MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Nepal516 plasmid pPCP

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008119	TC	4	8	387	394	0 %	50 %	0 %	50 %	108793838
2	NC_008119	CG	3	6	616	621	0 %	0 %	50 %	50 %	108793838
3	NC_008119	TC	3	6	730	735	0 %	50 %	0 %	50 %	108793838
4	NC_008119	AC	3	6	2205	2210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008119	TG	3	6	3028	3033	0 %	50 %	50 %	0 %	108793845
6	NC_008119	AC	3	6	3372	3377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008119	TG	3	6	4195	4200	0 %	50 %	50 %	0 %	108793846
8	NC_008119	CA	3	6	4614	4619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008119	TG	3	6	4943	4948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008119	AG	3	6	5778	5783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008119	TC	3	6	5811	5816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008119	AC	3	6	7400	7405	50 %	0 %	0 %	50 %	108793841
13	NC_008119	AG	3	6	7807	7812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008119	AT	3	6	7909	7914	50 %	50 %	0 %	0 %	108793842
15	NC_008119	AT	3	6	8053	8058	50 %	50 %	0 %	0 %	108793842
16	NC_008119	AT	3	6	8411	8416	50 %	50 %	0 %	0 %	108793842
17	NC_008119	GA	3	6	8516	8521	50 %	0 %	50 %	0 %	108793842
18	NC_008119	TC	3	6	8781	8786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008119	TG	3	6	8853	8858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008119	GT	3	6	9265	9270	0 %	50 %	50 %	0 %	108793844

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.