MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Nepal516 plasmid pMT

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008118	CAGGAG	2	12	408	419	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	108793733
2	NC_008118	ATAGTG	2	12	3002	3013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793736
3	NC_008118	GCTGAA	2	12	5261	5272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	108793736
4	NC_008118	GTGCCA	2	12	5756	5767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108793736
5	NC_008118	CGAGTT	2	12	11312	11323	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	108793739
6	NC_008118	AGTGAT	2	12	19589	19600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793746
7	NC_008118	AACGGT	2	12	24201	24212	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	108793754
8	NC_008118	GGCTGC	2	12	27017	27028	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	108793757
9	NC_008118	GACGCC	2	12	29448	29459	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108793760
10	NC_008118	GGTGGC	2	12	33461	33472	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	108793765
11	NC_008118	CGCGCC	2	12	40711	40722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793774
12	NC_008118	TGTGGT	2	12	42684	42695	0 %	50 %	50 %	0 %	108793775
13	NC_008118	GCTTAT	2	12	43585	43596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008118	TGGATA	2	12	46760	46771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793778
15	NC_008118	AGGGTT	2	12	49683	49694	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	108793782
16	NC_008118	GCCAGT	2	12	52315	52326	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108793784
17	NC_008118	TCAGCA	2	12	52609	52620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	108793785
18	NC_008118	TGCTTG	2	12	53081	53092	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	108793786
19	NC_008118	TCGCCA	2	12	53147	53158	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108793786
20	NC_008118	TGGGTT	2	12	55480	55491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008118	CGCCAG	2	12	56625	56636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108793790
22	NC_008118	ACACGC	2	12	57485	57496	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	108793791
23	NC_008118	CGCCAG	2	12	61025	61036	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108793792
24	NC_008118	CGTCCA	2	12	61567	61578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108793792
25	NC_008118	TACGGT	2	12	67021	67032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	108793832
26	NC_008118	TAATTG	2	12	67365	67376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	108793832
27	NC_008118	AATTCA	2	12	68237	68248	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	108793797
28	NC_008118	TTCTTT	2	12	70668	70679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	108793798
29	NC_008118	GCTCCT	2	12	76059	76070	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	108793803
30	NC_008118	CATGTT	2	12	85070	85081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	108793811
31	NC_008118	CGCTTT	2	12	88459	88470	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	108793815
32	NC_008118	ACCCCT	2	12	90794	90805	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	108793817
33	NC_008118	GTTATT	2	12	93022	93033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	108793819
34	NC_008118	CCAGGA	2	12	97520	97531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793824
35	NC_008118	TCGGCT	2	12	99362	99373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793826

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.