MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 plasmid pMT

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008118	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008118	CTAC	3	12	2009	2020	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008118	CCAA	2	8	2710	2717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008118	ACTT	2	8	5867	5874	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008118	AAAG	2	8	5889	5896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008118	TTAC	2	8	23101	23108	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008118	TAGG	2	8	26539	26546	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008118	TACT	3	12	32079	32090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008118	ATTT	2	8	35111	35118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008118	ATAA	3	12	35264	35275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008118	AAAG	2	8	36883	36890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008118	GGTG	2	8	37532	37539	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008118	ACCT	2	8	38729	38736	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008118	TAAG	2	8	43416	43423	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008118	TCGT	2	8	44959	44966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008118	GTTT	2	8	46138	46145	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008118	ACCA	2	8	46363	46370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008118	AATG	2	8	47687	47694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008118	TGAA	2	8	47952	47959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008118	TGGT	2	8	48107	48114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008118	TTAT	2	8	49183	49190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008118	AGTA	2	8	51215	51222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008118	CGAG	2	8	54720	54727	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008118	TACT	2	8	54744	54751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008118	GAAA	2	8	55242	55249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008118	GAAG	2	8	55268	55275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008118	TCGT	2	8	61738	61745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008118	AGTA	2	8	61780	61787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008118	TAGG	2	8	64274	64281	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008118	GAAA	2	8	64674	64681	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008118	CACT	2	8	66254	66261	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008118	GAAA	2	8	66527	66534	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008118	AGGG	2	8	66544	66551	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008118	TTTA	2	8	71043	71050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008118	CTTG	2	8	71087	71094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008118	AGCC	2	8	72280	72287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008118	GCTG	2	8	72362	72369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008118	AACC	2	8	72398	72405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008118	TAAG	2	8	72637	72644	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008118	CCTG	2	8	73028	73035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008118	TACT	2	8	77290	77297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008118	TAAG	2	8	78191	78198	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008118	GTCT	2	8	82606	82613	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008118	GATA	2	8	82885	82892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008118	GCAA	2	8	82986	82993	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008118	CAGG	2	8	83037	83044	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008118	GCTG	2	8	83098	83105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008118	CATA	2	8	86595	86602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008118	CCTG	2	8	89164	89171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008118	ATCT	2	8	89959	89966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008118	TTTG	2	8	92215	92222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008118	AATG	2	8	93938	93945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008118	CCAG	2	8	94665	94672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008118	TCGC	2	8	97203	97210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008118	CTGC	2	8	97915	97922	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.