MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Nepal516 plasmid pMT

Total Repeats: 1291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008118	GCC	2	6	215	220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793733
2	NC_008118	CGC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793733
3	NC_008118	CTG	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793733
4	NC_008118	GAC	2	6	448	453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793733
5	NC_008118	CTT	2	6	605	610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793733
6	NC_008118	TGG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793733
7	NC_008118	AGC	2	6	970	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793733
8	NC_008118	TGA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793733
9	NC_008118	CAT	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793733
10	NC_008118	TGA	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793733
11	NC_008118	GAA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793734
12	NC_008118	TCA	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793734
13	NC_008118	CGG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793734
14	NC_008118	CAG	3	9	1518	1526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793734
15	NC_008118	ACG	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793734
16	NC_008118	TCA	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793734
17	NC_008118	TGA	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793734
18	NC_008118	GAA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793734
19	NC_008118	TTC	2	6	1664	1669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793734
20	NC_008118	GCA	2	6	1760	1765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793734
21	NC_008118	TGG	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008118	CGT	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008118	TGA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008118	TCT	2	6	2044	2049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793735
25	NC_008118	TCA	2	6	2155	2160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793735
26	NC_008118	TTG	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793735
27	NC_008118	TTC	2	6	2215	2220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793735
28	NC_008118	TCT	2	6	2264	2269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793735
29	NC_008118	CTT	2	6	2273	2278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793735
30	NC_008118	GAT	2	6	2417	2422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793735
31	NC_008118	CTT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793735
32	NC_008118	GTC	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793735
33	NC_008118	GGT	2	6	2488	2493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793735
34	NC_008118	CAG	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793735
35	NC_008118	CAG	2	6	3117	3122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793736
36	NC_008118	ACT	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793736
37	NC_008118	CTG	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793736
38	NC_008118	TGT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793736
39	NC_008118	ACA	2	6	3477	3482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793736
40	NC_008118	ATC	2	6	3509	3514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793736
41	NC_008118	GCC	2	6	3554	3559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793736
42	NC_008118	ATG	2	6	3599	3604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793736
43	NC_008118	GGT	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793736
44	NC_008118	ACT	2	6	3682	3687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793736
45	NC_008118	AAC	2	6	3755	3760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793736
46	NC_008118	ATT	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793736
47	NC_008118	CTG	2	6	3882	3887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793736
48	NC_008118	ACC	2	6	4062	4067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793736
49	NC_008118	AAT	2	6	4124	4129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793736
50	NC_008118	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793736
51	NC_008118	GCT	2	6	4269	4274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793736
52	NC_008118	GCA	2	6	4328	4333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793736
53	NC_008118	CAA	2	6	4374	4379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793736
54	NC_008118	CAG	3	9	4428	4436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793736
55	NC_008118	ACT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793736
56	NC_008118	AAC	2	6	4585	4590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793736
57	NC_008118	CTG	2	6	4594	4599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793736
58	NC_008118	GTT	2	6	4604	4609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793736
59	NC_008118	TGC	2	6	4623	4628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793736
60	NC_008118	CCG	2	6	4731	4736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793736
61	NC_008118	GCT	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793736
62	NC_008118	AGC	2	6	4831	4836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793736
63	NC_008118	CAT	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793736
64	NC_008118	GCT	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793736
65	NC_008118	AGC	4	12	5002	5013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793736
66	NC_008118	GAA	2	6	5072	5077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793736
67	NC_008118	GCA	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793736
68	NC_008118	CGA	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793736
69	NC_008118	TCA	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793736
70	NC_008118	TGA	2	6	5595	5600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793736
71	NC_008118	TTG	2	6	5693	5698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793736
72	NC_008118	CCG	2	6	5904	5909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793737
73	NC_008118	AAC	2	6	6025	6030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793737
74	NC_008118	TTA	2	6	6088	6093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793737
75	NC_008118	AGA	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793737
76	NC_008118	GCT	2	6	6136	6141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793737
77	NC_008118	ACC	2	6	6315	6320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793737
78	NC_008118	CAG	2	6	6491	6496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793737
79	NC_008118	ATA	2	6	6517	6522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793737
80	NC_008118	TAA	2	6	6648	6653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793738
81	NC_008118	CTG	2	6	6701	6706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793738
82	NC_008118	TCC	2	6	6762	6767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793738
83	NC_008118	TAG	2	6	6780	6785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793738
84	NC_008118	CTG	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793738
85	NC_008118	GCA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793738
86	NC_008118	GTT	2	6	6983	6988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793738
87	NC_008118	CGC	2	6	7261	7266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793738
88	NC_008118	GCA	2	6	7296	7301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793738
89	NC_008118	CTT	2	6	7307	7312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793738
90	NC_008118	TGC	2	6	7338	7343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793738
91	NC_008118	AGC	2	6	7445	7450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793738
92	NC_008118	TCT	2	6	7632	7637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793738
93	NC_008118	CGG	2	6	7642	7647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793738
94	NC_008118	GTG	2	6	7779	7784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793738
95	NC_008118	TCG	2	6	7854	7859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793738
96	NC_008118	TTC	2	6	7976	7981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793738
97	NC_008118	TCG	2	6	8007	8012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793738
98	NC_008118	TCT	2	6	8020	8025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793738
99	NC_008118	ATT	2	6	8045	8050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793738
100	NC_008118	CGG	2	6	8185	8190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793738
101	NC_008118	GGA	2	6	8207	8212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108793738
102	NC_008118	TTG	2	6	8399	8404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793738
103	NC_008118	CGT	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793738
104	NC_008118	TCC	2	6	8598	8603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793738
105	NC_008118	AGC	2	6	8604	8609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793738
106	NC_008118	CGG	2	6	8696	8701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793738
107	NC_008118	GTG	2	6	8781	8786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793738
108	NC_008118	GGC	2	6	8789	8794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793738
109	NC_008118	GGC	2	6	8940	8945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793738
110	NC_008118	TGA	2	6	8977	8982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793738
111	NC_008118	GTT	2	6	9104	9109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793738
112	NC_008118	ACG	2	6	9119	9124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793738
113	NC_008118	TGT	2	6	9262	9267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793738
114	NC_008118	ATT	2	6	9317	9322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793738
115	NC_008118	TCA	2	6	9430	9435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793738
116	NC_008118	CAG	2	6	9743	9748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793738
117	NC_008118	ACG	2	6	9824	9829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793738
118	NC_008118	CCT	2	6	9835	9840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793738
119	NC_008118	TTG	3	9	9882	9890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793738
120	NC_008118	CAT	2	6	9977	9982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793738
121	NC_008118	CCA	2	6	10023	10028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793738
122	NC_008118	AGA	2	6	10033	10038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793738
123	NC_008118	TTC	2	6	10154	10159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793738
124	NC_008118	ACA	2	6	10285	10290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793738
125	NC_008118	CGA	2	6	10468	10473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793738
126	NC_008118	GCA	2	6	10540	10545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793738
127	NC_008118	GTA	2	6	10598	10603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793738
128	NC_008118	CGT	2	6	10819	10824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793738
129	NC_008118	ATC	2	6	10970	10975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793738
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162	NC_008118	ATA	2	6	13303	13308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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377	NC_008118	ATC	2	6	29940	29945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793761
378	NC_008118	CTT	2	6	29992	29997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793761
379	NC_008118	CAG	2	6	29999	30004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793761
380	NC_008118	GTT	3	9	30020	30028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793761
381	NC_008118	TTC	2	6	30136	30141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793762
382	NC_008118	GTC	2	6	30154	30159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793762
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385	NC_008118	CAG	2	6	30381	30386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793762
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388	NC_008118	GCA	2	6	30509	30514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793762
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393	NC_008118	CTT	2	6	30904	30909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793763
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397	NC_008118	CTT	3	9	31120	31128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793763
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403	NC_008118	GGC	2	6	31265	31270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793763
404	NC_008118	CTG	2	6	31286	31291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793763
405	NC_008118	GTA	2	6	31387	31392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793764
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463	NC_008118	TTG	2	6	38562	38567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_008118	GCC	2	6	42286	42291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793775
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