MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 plasmid pMT

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008118	TGG	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008118	CGT	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008118	TGA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008118	CTT	2	6	11182	11187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008118	TTC	2	6	13256	13261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008118	ATA	2	6	13303	13308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008118	CAG	2	6	18553	18558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008118	AAT	2	6	21127	21132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008118	GGC	2	6	22429	22434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008118	GCC	2	6	22438	22443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008118	TCG	2	6	24450	24455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008118	AAC	2	6	28496	28501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008118	TAA	2	6	28588	28593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008118	ATA	2	6	32091	32096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008118	TAA	2	6	35001	35006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008118	TTA	2	6	35021	35026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008118	GAA	2	6	35171	35176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008118	AGT	2	6	36137	36142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008118	CGA	2	6	36143	36148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008118	TTG	2	6	36338	36343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008118	CCG	2	6	36787	36792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_008118	TGG	2	6	36873	36878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008118	TTG	2	6	37426	37431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008118	TGG	2	6	37483	37488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008118	GTT	2	6	37507	37512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008118	CCA	2	6	37576	37581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_008118	TCC	2	6	37891	37896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008118	TTG	2	6	37918	37923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008118	TAA	2	6	37974	37979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008118	TCC	2	6	37983	37988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008118	TTG	2	6	38562	38567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008118	TCT	2	6	42164	42169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008118	AAC	2	6	43355	43360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008118	ACA	2	6	43365	43370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008118	AGA	2	6	43377	43382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008118	CAG	2	6	43519	43524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008118	TAT	2	6	43655	43660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008118	TAT	2	6	44794	44799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008118	TCT	2	6	44853	44858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008118	ACT	2	6	44863	44868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008118	GCC	3	9	44993	45001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_008118	ATT	2	6	45827	45832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008118	AAT	2	6	45847	45852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008118	AGA	2	6	45875	45880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008118	ATA	2	6	45978	45983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008118	AGG	2	6	46043	46048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008118	CCA	2	6	46146	46151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_008118	TGA	2	6	46416	46421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008118	CCA	2	6	46451	46456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_008118	AAC	3	9	47638	47646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008118	GTT	2	6	47941	47946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008118	CAC	2	6	48000	48005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_008118	TTG	2	6	49169	49174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008118	CTT	2	6	50002	50007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008118	TTG	2	6	50081	50086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008118	ATA	2	6	50090	50095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008118	ATA	2	6	51209	51214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008118	ATA	2	6	54732	54737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008118	ATC	2	6	54753	54758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008118	TGA	2	6	55301	55306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008118	GGA	2	6	55412	55417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008118	CAG	2	6	55493	55498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008118	CAC	2	6	55561	55566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008118	TAG	2	6	55669	55674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008118	GCC	2	6	55690	55695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_008118	CCG	2	6	56314	56319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008118	TGG	2	6	60391	60396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008118	TTA	2	6	64194	64199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008118	ATC	2	6	64508	64513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008118	TAC	3	9	64542	64550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008118	TTA	2	6	64758	64763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008118	GCT	2	6	66459	66464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008118	TTG	2	6	66465	66470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008118	GAT	2	6	66481	66486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008118	CTC	2	6	66503	66508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_008118	ATT	2	6	66568	66573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008118	TAA	2	6	66578	66583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008118	AAC	2	6	66598	66603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008118	AAT	2	6	66618	66623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008118	AAT	2	6	66639	66644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008118	ATA	2	6	66725	66730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008118	TAT	2	6	66783	66788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008118	TAT	2	6	66823	66828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008118	AGG	2	6	66967	66972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008118	ATA	2	6	66975	66980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008118	CCT	2	6	66983	66988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_008118	TAT	2	6	66994	66999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008118	AAT	2	6	67537	67542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008118	CCT	2	6	70913	70918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_008118	ACA	2	6	70931	70936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008118	CAT	2	6	70954	70959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008118	CGA	2	6	70967	70972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008118	TAT	2	6	71207	71212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008118	CGC	2	6	72297	72302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008118	GAT	2	6	72377	72382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008118	GTG	2	6	72439	72444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008118	CTT	2	6	72536	72541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008118	ATA	2	6	72629	72634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008118	AAC	2	6	72978	72983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008118	ATC	2	6	73462	73467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008118	ACG	2	6	74530	74535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008118	CCA	2	6	74561	74566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_008118	CCA	2	6	77322	77327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_008118	TCG	2	6	78165	78170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008118	CAA	2	6	79133	79138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008118	TAA	2	6	80450	80455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008118	ACG	2	6	80539	80544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008118	GAT	2	6	80607	80612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008118	AAT	2	6	80613	80618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008118	AGT	2	6	81862	81867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008118	TGA	2	6	81892	81897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008118	TCA	2	6	81984	81989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008118	TCA	2	6	82010	82015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008118	AAG	2	6	82415	82420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008118	GCC	2	6	82430	82435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_008118	CAC	2	6	82455	82460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_008118	CAA	2	6	82648	82653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008118	GAT	2	6	82762	82767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008118	GAA	2	6	82793	82798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008118	CAC	2	6	82837	82842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_008118	CCT	2	6	83016	83021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_008118	TAG	2	6	83118	83123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008118	TTA	2	6	83735	83740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008118	AAG	2	6	83757	83762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008118	ACC	2	6	83814	83819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_008118	CGA	2	6	83839	83844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008118	GAT	2	6	83851	83856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008118	CAT	2	6	83860	83865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008118	ATT	2	6	83867	83872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008118	ATG	2	6	83876	83881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008118	ATT	2	6	83902	83907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008118	TAA	2	6	85720	85725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008118	GCA	2	6	85737	85742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008118	CTT	2	6	86478	86483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008118	GTC	2	6	86815	86820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008118	GGA	2	6	86985	86990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008118	ATG	2	6	88256	88261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008118	AGT	2	6	88948	88953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008118	TTA	2	6	89194	89199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008118	TCC	2	6	89205	89210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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173	NC_008118	TTC	2	6	98116	98121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_008118	GCG	2	6	98503	98508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.