MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Nepal516 plasmid pMT

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008118	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	108793733
2	NC_008118	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	108793733
3	NC_008118	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	108793733
4	NC_008118	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008118	GA	3	6	2327	2332	50 %	0 %	50 %	0 %	108793735
6	NC_008118	AT	3	6	2557	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	108793735
7	NC_008118	AT	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008118	TG	3	6	3012	3017	0 %	50 %	50 %	0 %	108793736
9	NC_008118	TG	3	6	3194	3199	0 %	50 %	50 %	0 %	108793736
10	NC_008118	AC	3	6	3534	3539	50 %	0 %	0 %	50 %	108793736
11	NC_008118	AC	3	6	3570	3575	50 %	0 %	0 %	50 %	108793736
12	NC_008118	AT	3	6	3693	3698	50 %	50 %	0 %	0 %	108793736
13	NC_008118	GC	3	6	5333	5338	0 %	0 %	50 %	50 %	108793736
14	NC_008118	CA	3	6	5960	5965	50 %	0 %	0 %	50 %	108793737
15	NC_008118	TC	3	6	6684	6689	0 %	50 %	0 %	50 %	108793738
16	NC_008118	AT	3	6	6695	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	108793738
17	NC_008118	CG	3	6	7422	7427	0 %	0 %	50 %	50 %	108793738
18	NC_008118	CT	3	6	8538	8543	0 %	50 %	0 %	50 %	108793738
19	NC_008118	CG	3	6	8726	8731	0 %	0 %	50 %	50 %	108793738
20	NC_008118	AG	3	6	8922	8927	50 %	0 %	50 %	0 %	108793738
21	NC_008118	TG	3	6	10328	10333	0 %	50 %	50 %	0 %	108793738
22	NC_008118	GT	3	6	11822	11827	0 %	50 %	50 %	0 %	108793740
23	NC_008118	AC	3	6	13102	13107	50 %	0 %	0 %	50 %	108793741
24	NC_008118	CG	3	6	13474	13479	0 %	0 %	50 %	50 %	108793742
25	NC_008118	GA	3	6	15222	15227	50 %	0 %	50 %	0 %	108793743
26	NC_008118	AG	3	6	15472	15477	50 %	0 %	50 %	0 %	108793743
27	NC_008118	GA	3	6	16905	16910	50 %	0 %	50 %	0 %	108793743
28	NC_008118	AC	3	6	17588	17593	50 %	0 %	0 %	50 %	108793743
29	NC_008118	AG	3	6	18991	18996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008118	CA	3	6	19176	19181	50 %	0 %	0 %	50 %	108793746
31	NC_008118	GA	3	6	19264	19269	50 %	0 %	50 %	0 %	108793746
32	NC_008118	TA	3	6	19833	19838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008118	CT	3	6	20314	20319	0 %	50 %	0 %	50 %	108793748
34	NC_008118	AG	3	6	23173	23178	50 %	0 %	50 %	0 %	108793753
35	NC_008118	AT	3	6	25011	25016	50 %	50 %	0 %	0 %	108793756
36	NC_008118	AG	3	6	25262	25267	50 %	0 %	50 %	0 %	108793756
37	NC_008118	CG	4	8	25974	25981	0 %	0 %	50 %	50 %	108793756
38	NC_008118	GC	4	8	26069	26076	0 %	0 %	50 %	50 %	108793756
39	NC_008118	AT	3	6	26844	26849	50 %	50 %	0 %	0 %	108793757
40	NC_008118	CA	3	6	26952	26957	50 %	0 %	0 %	50 %	108793757
41	NC_008118	CG	3	6	27667	27672	0 %	0 %	50 %	50 %	108793757
42	NC_008118	CA	3	6	27720	27725	50 %	0 %	0 %	50 %	108793757
43	NC_008118	GT	3	6	28364	28369	0 %	50 %	50 %	0 %	108793758
44	NC_008118	TA	3	6	28580	28585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008118	TA	4	8	28607	28614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008118	TA	3	6	32071	32076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008118	CG	3	6	32621	32626	0 %	0 %	50 %	50 %	108793765
48	NC_008118	AG	3	6	33686	33691	50 %	0 %	50 %	0 %	108793765
49	NC_008118	GA	3	6	34240	34245	50 %	0 %	50 %	0 %	108793767
50	NC_008118	CG	3	6	34511	34516	0 %	0 %	50 %	50 %	108793768
51	NC_008118	TC	3	6	34558	34563	0 %	50 %	0 %	50 %	108793768
52	NC_008118	AT	3	6	35082	35087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008118	GC	3	6	36191	36196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008118	TG	3	6	36423	36428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008118	CT	3	6	36838	36843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008118	CA	3	6	38365	38370	50 %	0 %	0 %	50 %	108793772
57	NC_008118	AG	3	6	40300	40305	50 %	0 %	50 %	0 %	108793774
58	NC_008118	TG	3	6	40520	40525	0 %	50 %	50 %	0 %	108793774
59	NC_008118	GT	3	6	41618	41623	0 %	50 %	50 %	0 %	108793774
60	NC_008118	AG	3	6	42962	42967	50 %	0 %	50 %	0 %	108793775
61	NC_008118	AC	3	6	43914	43919	50 %	0 %	0 %	50 %	108793776
62	NC_008118	TC	4	8	44879	44886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008118	TC	3	6	45309	45314	0 %	50 %	0 %	50 %	108793777
64	NC_008118	AG	3	6	45862	45867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008118	AG	3	6	45971	45976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008118	CT	3	6	46007	46012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008118	AT	3	6	46110	46115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008118	CA	3	6	46150	46155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008118	AG	3	6	46333	46338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008118	AG	3	6	46375	46380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008118	AG	3	6	47563	47568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008118	CT	3	6	47765	47770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008118	CT	3	6	47970	47975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008118	CG	4	8	48077	48084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008118	TG	3	6	48608	48613	0 %	50 %	50 %	0 %	108793779
76	NC_008118	TA	3	6	48861	48866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008118	GT	3	6	49369	49374	0 %	50 %	50 %	0 %	108793781
78	NC_008118	TA	3	6	51225	51230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008118	CG	4	8	51783	51790	0 %	0 %	50 %	50 %	108793784
80	NC_008118	AG	3	6	51895	51900	50 %	0 %	50 %	0 %	108793784
81	NC_008118	CG	3	6	53029	53034	0 %	0 %	50 %	50 %	108793786
82	NC_008118	GA	3	6	53202	53207	50 %	0 %	50 %	0 %	108793786
83	NC_008118	GT	4	8	53820	53827	0 %	50 %	50 %	0 %	108793787
84	NC_008118	CA	3	6	54390	54395	50 %	0 %	0 %	50 %	108793787
85	NC_008118	GA	3	6	54857	54862	50 %	0 %	50 %	0 %	108793788
86	NC_008118	TA	3	6	55223	55228	50 %	50 %	0 %	0 %	108793788
87	NC_008118	CT	3	6	55769	55774	0 %	50 %	0 %	50 %	108793789
88	NC_008118	CA	3	6	56177	56182	50 %	0 %	0 %	50 %	108793789
89	NC_008118	CG	3	6	58025	58030	0 %	0 %	50 %	50 %	108793791
90	NC_008118	CT	3	6	58539	58544	0 %	50 %	0 %	50 %	108793791
91	NC_008118	GT	3	6	59314	59319	0 %	50 %	50 %	0 %	108793791
92	NC_008118	TC	3	6	60050	60055	0 %	50 %	0 %	50 %	108793791
93	NC_008118	TC	3	6	60219	60224	0 %	50 %	0 %	50 %	108793791
94	NC_008118	AG	3	6	60454	60459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008118	AC	3	6	60958	60963	50 %	0 %	0 %	50 %	108793792
96	NC_008118	GT	3	6	61306	61311	0 %	50 %	50 %	0 %	108793792
97	NC_008118	GA	3	6	61516	61521	50 %	0 %	50 %	0 %	108793792
98	NC_008118	TA	3	6	61757	61762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008118	AT	3	6	61764	61769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008118	TG	3	6	63786	63791	0 %	50 %	50 %	0 %	108793793
101	NC_008118	CT	3	6	63892	63897	0 %	50 %	0 %	50 %	108793793
102	NC_008118	TG	3	6	64218	64223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008118	TC	3	6	64894	64899	0 %	50 %	0 %	50 %	108793796
104	NC_008118	CG	3	6	65808	65813	0 %	0 %	50 %	50 %	108793795
105	NC_008118	CT	3	6	66800	66805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008118	GA	3	6	67161	67166	50 %	0 %	50 %	0 %	108793832
107	NC_008118	AT	3	6	67520	67525	50 %	50 %	0 %	0 %	108793832
108	NC_008118	AG	3	6	67564	67569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008118	TC	3	6	67699	67704	0 %	50 %	0 %	50 %	108793797
110	NC_008118	TC	3	6	67988	67993	0 %	50 %	0 %	50 %	108793797
111	NC_008118	AC	3	6	68333	68338	50 %	0 %	0 %	50 %	108793797
112	NC_008118	GT	3	6	69104	69109	0 %	50 %	50 %	0 %	108793797
113	NC_008118	CT	3	6	69991	69996	0 %	50 %	0 %	50 %	108793797
114	NC_008118	CA	3	6	70076	70081	50 %	0 %	0 %	50 %	108793797
115	NC_008118	AT	3	6	70508	70513	50 %	50 %	0 %	0 %	108793798
116	NC_008118	CT	3	6	70558	70563	0 %	50 %	0 %	50 %	108793798
117	NC_008118	CA	3	6	71057	71062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008118	AT	3	6	71267	71272	50 %	50 %	0 %	0 %	108793833
119	NC_008118	AT	3	6	71390	71395	50 %	50 %	0 %	0 %	108793833
120	NC_008118	AG	3	6	71633	71638	50 %	0 %	50 %	0 %	108793833
121	NC_008118	GT	3	6	72485	72490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008118	GT	3	6	73334	73339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008118	GA	3	6	75738	75743	50 %	0 %	50 %	0 %	108793803
124	NC_008118	CG	3	6	75852	75857	0 %	0 %	50 %	50 %	108793803
125	NC_008118	GA	4	8	76079	76086	50 %	0 %	50 %	0 %	108793803
126	NC_008118	CG	3	6	76525	76530	0 %	0 %	50 %	50 %	108793804
127	NC_008118	CG	3	6	77769	77774	0 %	0 %	50 %	50 %	108793806
128	NC_008118	CG	3	6	77919	77924	0 %	0 %	50 %	50 %	108793806
129	NC_008118	TA	3	6	78742	78747	50 %	50 %	0 %	0 %	108793834
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131	NC_008118	GT	3	6	80695	80700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008118	CG	3	6	81974	81979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008118	TC	3	6	82037	82042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008118	TC	3	6	83442	83447	0 %	50 %	0 %	50 %	108793810
135	NC_008118	TG	3	6	85127	85132	0 %	50 %	50 %	0 %	108793811
136	NC_008118	TA	3	6	85622	85627	50 %	50 %	0 %	0 %	108793811
137	NC_008118	GA	3	6	86175	86180	50 %	0 %	50 %	0 %	108793812
138	NC_008118	TA	3	6	86659	86664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008118	AG	3	6	87620	87625	50 %	0 %	50 %	0 %	108793814
140	NC_008118	GT	3	6	89909	89914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008118	AT	3	6	89944	89949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_008118	AT	3	6	91159	91164	50 %	50 %	0 %	0 %	108793817
144	NC_008118	CG	3	6	91388	91393	0 %	0 %	50 %	50 %	108793818
145	NC_008118	TC	4	8	91692	91699	0 %	50 %	0 %	50 %	108793818
146	NC_008118	GA	3	6	91992	91997	50 %	0 %	50 %	0 %	108793818
147	NC_008118	CA	3	6	92734	92739	50 %	0 %	0 %	50 %	108793819
148	NC_008118	TA	3	6	93960	93965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008118	GC	3	6	94386	94391	0 %	0 %	50 %	50 %	108793836
150	NC_008118	CA	3	6	95269	95274	50 %	0 %	0 %	50 %	108793820
151	NC_008118	GC	3	6	95416	95421	0 %	0 %	50 %	50 %	108793820
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153	NC_008118	GC	3	6	96214	96219	0 %	0 %	50 %	50 %	108793823
154	NC_008118	GC	3	6	96586	96591	0 %	0 %	50 %	50 %	108793823
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157	NC_008118	CG	3	6	98328	98333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_008118	GC	3	6	99273	99278	0 %	0 %	50 %	50 %	108793826
159	NC_008118	TG	3	6	100899	100904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.