MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 plasmid pMT

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008118	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008118	AT	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008118	AG	3	6	18991	18996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008118	TA	3	6	19833	19838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008118	TA	3	6	28580	28585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008118	TA	4	8	28607	28614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008118	TA	3	6	32071	32076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008118	AT	3	6	35082	35087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008118	GC	3	6	36191	36196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008118	TG	3	6	36423	36428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008118	CT	3	6	36838	36843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008118	TC	4	8	44879	44886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008118	AG	3	6	45862	45867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008118	AG	3	6	45971	45976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008118	CT	3	6	46007	46012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008118	AT	3	6	46110	46115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008118	CA	3	6	46150	46155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008118	AG	3	6	46333	46338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008118	AG	3	6	46375	46380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008118	AG	3	6	47563	47568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008118	CT	3	6	47765	47770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008118	CT	3	6	47970	47975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008118	CG	4	8	48077	48084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008118	TA	3	6	48861	48866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008118	TA	3	6	51225	51230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008118	AG	3	6	60454	60459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008118	TA	3	6	61757	61762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008118	AT	3	6	61764	61769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008118	TG	3	6	64218	64223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008118	CT	3	6	66800	66805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008118	AG	3	6	67564	67569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008118	CA	3	6	71057	71062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008118	GT	3	6	72485	72490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008118	GT	3	6	73334	73339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008118	GT	3	6	80695	80700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008118	CG	3	6	81974	81979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008118	TC	3	6	82037	82042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008118	TA	3	6	86659	86664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008118	GT	3	6	89909	89914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008118	AT	3	6	89944	89949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008118	TA	3	6	93960	93965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008118	CG	3	6	97892	97897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008118	CG	3	6	98328	98333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008118	TG	3	6	100899	100904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.