MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 plasmid pMT

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008118	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	108793733
2	NC_008118	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	108793734
3	NC_008118	C	6	6	5921	5926	0 %	0 %	0 %	100 %	108793737
4	NC_008118	T	6	6	5979	5984	0 %	100 %	0 %	0 %	108793737
5	NC_008118	T	6	6	10614	10619	0 %	100 %	0 %	0 %	108793738
6	NC_008118	C	6	6	11379	11384	0 %	0 %	0 %	100 %	108793739
7	NC_008118	T	6	6	19755	19760	0 %	100 %	0 %	0 %	108793746
8	NC_008118	T	6	6	22613	22618	0 %	100 %	0 %	0 %	108793752
9	NC_008118	T	6	6	25064	25069	0 %	100 %	0 %	0 %	108793756
10	NC_008118	T	6	6	26452	26457	0 %	100 %	0 %	0 %	108793756
11	NC_008118	T	6	6	31301	31306	0 %	100 %	0 %	0 %	108793763
12	NC_008118	A	6	6	31924	31929	100 %	0 %	0 %	0 %	108793764
13	NC_008118	A	6	6	32771	32776	100 %	0 %	0 %	0 %	108793765
14	NC_008118	G	7	7	34884	34890	0 %	0 %	100 %	0 %	108793768
15	NC_008118	A	6	6	35334	35339	100 %	0 %	0 %	0 %	108793769
16	NC_008118	A	6	6	35778	35783	100 %	0 %	0 %	0 %	108793769
17	NC_008118	T	6	6	39319	39324	0 %	100 %	0 %	0 %	108793773
18	NC_008118	T	7	7	41752	41758	0 %	100 %	0 %	0 %	108793774
19	NC_008118	G	7	7	43834	43840	0 %	0 %	100 %	0 %	108793776
20	NC_008118	A	6	6	43885	43890	100 %	0 %	0 %	0 %	108793776
21	NC_008118	A	6	6	44608	44613	100 %	0 %	0 %	0 %	108793776
22	NC_008118	T	6	6	48295	48300	0 %	100 %	0 %	0 %	108793829
23	NC_008118	T	6	6	49628	49633	0 %	100 %	0 %	0 %	108793781
24	NC_008118	T	6	6	49638	49643	0 %	100 %	0 %	0 %	108793782
25	NC_008118	T	6	6	55175	55180	0 %	100 %	0 %	0 %	108793788
26	NC_008118	A	6	6	56307	56312	100 %	0 %	0 %	0 %	108793789
27	NC_008118	T	7	7	62044	62050	0 %	100 %	0 %	0 %	108793793
28	NC_008118	A	6	6	65063	65068	100 %	0 %	0 %	0 %	108793796
29	NC_008118	T	7	7	67512	67518	0 %	100 %	0 %	0 %	108793832
30	NC_008118	T	6	6	67655	67660	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
31	NC_008118	T	6	6	67728	67733	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
32	NC_008118	T	6	6	68114	68119	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
33	NC_008118	T	6	6	68462	68467	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
34	NC_008118	A	7	7	68529	68535	100 %	0 %	0 %	0 %	108793797
35	NC_008118	T	6	6	68587	68592	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
36	NC_008118	T	8	8	68838	68845	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
37	NC_008118	C	6	6	69055	69060	0 %	0 %	0 %	100 %	108793797
38	NC_008118	C	6	6	69177	69182	0 %	0 %	0 %	100 %	108793797
39	NC_008118	C	6	6	70341	70346	0 %	0 %	0 %	100 %	108793798
40	NC_008118	T	6	6	71473	71478	0 %	100 %	0 %	0 %	108793833
41	NC_008118	T	6	6	71876	71881	0 %	100 %	0 %	0 %	108793833
42	NC_008118	G	6	6	74875	74880	0 %	0 %	100 %	0 %	108793802
43	NC_008118	T	6	6	75472	75477	0 %	100 %	0 %	0 %	108793803
44	NC_008118	T	6	6	77622	77627	0 %	100 %	0 %	0 %	108793806
45	NC_008118	T	6	6	78565	78570	0 %	100 %	0 %	0 %	108793834
46	NC_008118	A	6	6	78705	78710	100 %	0 %	0 %	0 %	108793834
47	NC_008118	T	6	6	78723	78728	0 %	100 %	0 %	0 %	108793834
48	NC_008118	A	6	6	79042	79047	100 %	0 %	0 %	0 %	108793834
49	NC_008118	A	6	6	79077	79082	100 %	0 %	0 %	0 %	108793834
50	NC_008118	A	7	7	80273	80279	100 %	0 %	0 %	0 %	108793807
51	NC_008118	T	9	9	84590	84598	0 %	100 %	0 %	0 %	108793811
52	NC_008118	T	6	6	84648	84653	0 %	100 %	0 %	0 %	108793811
53	NC_008118	T	6	6	84749	84754	0 %	100 %	0 %	0 %	108793811
54	NC_008118	T	7	7	84947	84953	0 %	100 %	0 %	0 %	108793811
55	NC_008118	T	6	6	85249	85254	0 %	100 %	0 %	0 %	108793811
56	NC_008118	T	7	7	85411	85417	0 %	100 %	0 %	0 %	108793811
57	NC_008118	G	6	6	85603	85608	0 %	0 %	100 %	0 %	108793811
58	NC_008118	T	6	6	88862	88867	0 %	100 %	0 %	0 %	108793815
59	NC_008118	T	6	6	88923	88928	0 %	100 %	0 %	0 %	108793815
60	NC_008118	T	8	8	89642	89649	0 %	100 %	0 %	0 %	108793816
61	NC_008118	A	6	6	94976	94981	100 %	0 %	0 %	0 %	108793820
62	NC_008118	A	6	6	96110	96115	100 %	0 %	0 %	0 %	108793822
63	NC_008118	A	6	6	98905	98910	100 %	0 %	0 %	0 %	108793826
64	NC_008118	A	7	7	98920	98926	100 %	0 %	0 %	0 %	108793826

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.