MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Myxococcus xanthus DK 1622 chromosome

Total Repeats: 7464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008095	CGGCG	2	10	2063	2072	0 %	0 %	60 %	40 %	108764057
2	NC_008095	GCCGG	2	10	2937	2946	0 %	0 %	60 %	40 %	108764057
3	NC_008095	CTCGA	2	10	7021	7030	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_008095	GCCCA	2	10	11825	11834	20 %	0 %	20 %	60 %	108759107
5	NC_008095	CGCGG	2	10	12392	12401	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008095	GCCGA	2	10	13462	13471	20 %	0 %	40 %	40 %	108757906
7	NC_008095	GGTGG	2	10	14249	14258	0 %	20 %	80 %	0 %	108758446
8	NC_008095	CCGGG	2	10	14812	14821	0 %	0 %	60 %	40 %	108758446
9	NC_008095	GAAGG	2	10	15968	15977	40 %	0 %	60 %	0 %	108763598
10	NC_008095	GTGCC	2	10	17574	17583	0 %	20 %	40 %	40 %	108757004
11	NC_008095	GCGTC	2	10	18388	18397	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_008095	CTCAG	2	10	18472	18481	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008095	GGACG	2	10	18802	18811	20 %	0 %	60 %	20 %	108761672
14	NC_008095	TCGCG	2	10	19119	19128	0 %	20 %	40 %	40 %	108761672
15	NC_008095	CCCAG	2	10	21946	21955	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_008095	GGGGC	2	10	22408	22417	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008095	ACGCA	2	10	22478	22487	40 %	0 %	20 %	40 %	108758631
18	NC_008095	TGGGG	2	10	22526	22535	0 %	20 %	80 %	0 %	108758631
19	NC_008095	CGGCG	2	10	22595	22604	0 %	0 %	60 %	40 %	108758631
20	NC_008095	GGCCG	2	10	23127	23136	0 %	0 %	60 %	40 %	108758631
21	NC_008095	GGATG	2	10	23162	23171	20 %	20 %	60 %	0 %	108758631
22	NC_008095	GGACG	2	10	23574	23583	20 %	0 %	60 %	20 %	108758631
23	NC_008095	GCCTC	2	10	23870	23879	0 %	20 %	20 %	60 %	108758631
24	NC_008095	CGCGC	2	10	24456	24465	0 %	0 %	40 %	60 %	108758631
25	NC_008095	CCCCG	2	10	25070	25079	0 %	0 %	20 %	80 %	108757099
26	NC_008095	CCCAG	2	10	25379	25388	20 %	0 %	20 %	60 %	108757099
27	NC_008095	CTTTG	2	10	27070	27079	0 %	60 %	20 %	20 %	108759965
28	NC_008095	CGCCA	2	10	27196	27205	20 %	0 %	20 %	60 %	108759965
29	NC_008095	CACCC	2	10	27385	27394	20 %	0 %	0 %	80 %	108759965
30	NC_008095	CGGCG	2	10	29953	29962	0 %	0 %	60 %	40 %	108762968
31	NC_008095	CGCAG	2	10	30330	30339	20 %	0 %	40 %	40 %	108762968
32	NC_008095	ACGCC	2	10	34174	34183	20 %	0 %	20 %	60 %	108758114
33	NC_008095	GTCCT	2	10	35912	35921	0 %	40 %	20 %	40 %	108763817
34	NC_008095	GCGCG	2	10	36282	36291	0 %	0 %	60 %	40 %	108759648
35	NC_008095	AAGAC	2	10	39960	39969	60 %	0 %	20 %	20 %	108757226
36	NC_008095	GCCAC	2	10	41684	41693	20 %	0 %	20 %	60 %	108760206
37	NC_008095	CCGCC	2	10	41721	41730	0 %	0 %	20 %	80 %	108760206
38	NC_008095	TGTCG	2	10	42368	42377	0 %	40 %	40 %	20 %	108759571
39	NC_008095	GGATG	2	10	44533	44542	20 %	20 %	60 %	0 %	108761513
40	NC_008095	GGTCC	2	10	45697	45706	0 %	20 %	40 %	40 %	108763586
41	NC_008095	TGGAA	2	10	45768	45777	40 %	20 %	40 %	0 %	108763586
42	NC_008095	AGGGC	2	10	45858	45867	20 %	0 %	60 %	20 %	108763586
43	NC_008095	GTTTT	2	10	47393	47402	0 %	80 %	20 %	0 %	108762865
44	NC_008095	GGCCC	2	10	48944	48953	0 %	0 %	40 %	60 %	108762865
45	NC_008095	CGCGA	2	10	50222	50231	20 %	0 %	40 %	40 %	108757805
46	NC_008095	GAAGG	2	10	52661	52670	40 %	0 %	60 %	0 %	108757612
47	NC_008095	ACCCG	2	10	54087	54096	20 %	0 %	20 %	60 %	108760785
48	NC_008095	GACGC	2	10	54506	54515	20 %	0 %	40 %	40 %	108760785
49	NC_008095	ACGCC	2	10	57718	57727	20 %	0 %	20 %	60 %	108763947
50	NC_008095	CGGGG	2	10	57793	57802	0 %	0 %	80 %	20 %	108763947
51	NC_008095	AGGGG	2	10	59478	59487	20 %	0 %	80 %	0 %	108763109
52	NC_008095	GGCAA	2	10	60992	61001	40 %	0 %	40 %	20 %	108762090
53	NC_008095	CCGCG	2	10	62136	62145	0 %	0 %	40 %	60 %	108763731
54	NC_008095	GGGCG	2	10	64076	64085	0 %	0 %	80 %	20 %	108758098
55	NC_008095	TGACT	2	10	64469	64478	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008095	TCCCG	2	10	68066	68075	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_008095	CAGAC	2	10	69387	69396	40 %	0 %	20 %	40 %	108762656
58	NC_008095	CGCGG	2	10	69532	69541	0 %	0 %	60 %	40 %	108762656
59	NC_008095	CGTCC	2	10	70711	70720	0 %	20 %	20 %	60 %	108758299
60	NC_008095	CGGGC	2	10	72676	72685	0 %	0 %	60 %	40 %	108760524
61	NC_008095	CGCGC	2	10	73583	73592	0 %	0 %	40 %	60 %	108756827
62	NC_008095	ATTCC	2	10	74974	74983	20 %	40 %	0 %	40 %	108763407
63	NC_008095	GCCGT	2	10	75673	75682	0 %	20 %	40 %	40 %	108763407
64	NC_008095	CGCGG	2	10	75824	75833	0 %	0 %	60 %	40 %	108763407
65	NC_008095	TGCCC	2	10	76355	76364	0 %	20 %	20 %	60 %	108762854
66	NC_008095	GGTCG	2	10	78031	78040	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_008095	GGCTC	2	10	78197	78206	0 %	20 %	40 %	40 %	108763383
68	NC_008095	AGCGG	2	10	81949	81958	20 %	0 %	60 %	20 %	108760307
69	NC_008095	CCGGC	2	10	82313	82322	0 %	0 %	40 %	60 %	108760307
70	NC_008095	GCGCT	2	10	85708	85717	0 %	20 %	40 %	40 %	108763117
71	NC_008095	CGGGG	2	10	86185	86194	0 %	0 %	80 %	20 %	108763953
72	NC_008095	GCCGC	2	10	87188	87197	0 %	0 %	40 %	60 %	108757973
73	NC_008095	TTCGC	2	10	87255	87264	0 %	40 %	20 %	40 %	108757973
74	NC_008095	CCGCG	2	10	87355	87364	0 %	0 %	40 %	60 %	108757973
75	NC_008095	ACGGG	2	10	90032	90041	20 %	0 %	60 %	20 %	108762575
76	NC_008095	GGGCC	2	10	90685	90694	0 %	0 %	60 %	40 %	108762575
77	NC_008095	GCCGC	2	10	91088	91097	0 %	0 %	40 %	60 %	108762575
78	NC_008095	GAAGC	2	10	92847	92856	40 %	0 %	40 %	20 %	108756800
79	NC_008095	CGTTC	2	10	94209	94218	0 %	40 %	20 %	40 %	108759202
80	NC_008095	GCCTT	2	10	95396	95405	0 %	40 %	20 %	40 %	108759793
81	NC_008095	GGCGC	2	10	95663	95672	0 %	0 %	60 %	40 %	108759793
82	NC_008095	GCGCC	2	10	95720	95729	0 %	0 %	40 %	60 %	108759793
83	NC_008095	GGCAT	2	10	96067	96076	20 %	20 %	40 %	20 %	108761100
84	NC_008095	GAGCG	2	10	96235	96244	20 %	0 %	60 %	20 %	108761100
85	NC_008095	GCTCC	2	10	97496	97505	0 %	20 %	20 %	60 %	108761927
86	NC_008095	CGCGC	2	10	99571	99580	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_008095	CGCGG	2	10	100489	100498	0 %	0 %	60 %	40 %	108759555
88	NC_008095	GGCCC	2	10	101352	101361	0 %	0 %	40 %	60 %	108759330
89	NC_008095	CCGCG	2	10	101576	101585	0 %	0 %	40 %	60 %	108758237
90	NC_008095	GTCAT	2	10	102207	102216	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008095	GCCAG	2	10	103411	103420	20 %	0 %	40 %	40 %	108763599
92	NC_008095	TTCTC	2	10	104912	104921	0 %	60 %	0 %	40 %	108762552
93	NC_008095	GTGGA	2	10	106030	106039	20 %	20 %	60 %	0 %	108762552
94	NC_008095	GCCAC	2	10	109156	109165	20 %	0 %	20 %	60 %	108759722
95	NC_008095	AGCGC	2	10	113055	113064	20 %	0 %	40 %	40 %	108762017
96	NC_008095	GCGAG	2	10	115051	115060	20 %	0 %	60 %	20 %	108762521
97	NC_008095	GCTCG	2	10	118388	118397	0 %	20 %	40 %	40 %	108759284
98	NC_008095	GCAAG	2	10	118435	118444	40 %	0 %	40 %	20 %	108759284
99	NC_008095	ATCCA	2	10	118722	118731	40 %	20 %	0 %	40 %	108759284
100	NC_008095	CGGCG	2	10	120040	120049	0 %	0 %	60 %	40 %	108763363
101	NC_008095	GTGAA	2	10	121637	121646	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008095	CGTTC	2	10	125300	125309	0 %	40 %	20 %	40 %	108761237
103	NC_008095	GCCGC	2	10	127079	127088	0 %	0 %	40 %	60 %	108759547
104	NC_008095	CGGGG	2	10	127666	127675	0 %	0 %	80 %	20 %	108759547
105	NC_008095	GGGGA	2	10	129053	129062	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008095	CCTCG	2	10	129097	129106	0 %	20 %	20 %	60 %	108759336
107	NC_008095	GACGG	2	10	129492	129501	20 %	0 %	60 %	20 %	108759336
108	NC_008095	TGGCA	2	10	130104	130113	20 %	20 %	40 %	20 %	108759336
109	NC_008095	GCCGC	2	10	131612	131621	0 %	0 %	40 %	60 %	108760732
110	NC_008095	CGGCG	2	10	133516	133525	0 %	0 %	60 %	40 %	108757154
111	NC_008095	AGGGC	2	10	137593	137602	20 %	0 %	60 %	20 %	108761044
112	NC_008095	GCCGC	2	10	137878	137887	0 %	0 %	40 %	60 %	108761044
113	NC_008095	CCTTC	2	10	140868	140877	0 %	40 %	0 %	60 %	108760366
114	NC_008095	CCAGG	2	10	141217	141226	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_008095	GGTGG	2	10	143282	143291	0 %	20 %	80 %	0 %	108762210
116	NC_008095	GTGGC	2	10	144866	144875	0 %	20 %	60 %	20 %	108760567
117	NC_008095	GGGCA	2	10	146294	146303	20 %	0 %	60 %	20 %	108757185
118	NC_008095	GTGCC	2	10	146932	146941	0 %	20 %	40 %	40 %	108763640
119	NC_008095	GACGC	2	10	150538	150547	20 %	0 %	40 %	40 %	108763864
120	NC_008095	TTGCA	2	10	151160	151169	20 %	40 %	20 %	20 %	108758367
121	NC_008095	GCGCA	2	10	151678	151687	20 %	0 %	40 %	40 %	108758367
122	NC_008095	GGGCG	2	10	153693	153702	0 %	0 %	80 %	20 %	108757317
123	NC_008095	ACCGA	2	10	154507	154516	40 %	0 %	20 %	40 %	108757317
124	NC_008095	GCGTC	2	10	157366	157375	0 %	20 %	40 %	40 %	108758615
125	NC_008095	CGCGG	2	10	158346	158355	0 %	0 %	60 %	40 %	108761448
126	NC_008095	GGGCC	2	10	160410	160419	0 %	0 %	60 %	40 %	108756899
127	NC_008095	TGAGC	2	10	163268	163277	20 %	20 %	40 %	20 %	108758657
128	NC_008095	AGGTC	2	10	163634	163643	20 %	20 %	40 %	20 %	108758657
129	NC_008095	GCGCC	2	10	164009	164018	0 %	0 %	40 %	60 %	108758657
130	NC_008095	GCGCT	2	10	164058	164067	0 %	20 %	40 %	40 %	108758657
131	NC_008095	CGGGG	2	10	166157	166166	0 %	0 %	80 %	20 %	108757057
132	NC_008095	AGCGC	2	10	166185	166194	20 %	0 %	40 %	40 %	108757057
133	NC_008095	CGGCG	2	10	167634	167643	0 %	0 %	60 %	40 %	108758069
134	NC_008095	GCCGC	2	10	168646	168655	0 %	0 %	40 %	60 %	108758069
135	NC_008095	CGCCA	3	15	169115	169129	20 %	0 %	20 %	60 %	108758069
136	NC_008095	GCATC	2	10	171671	171680	20 %	20 %	20 %	40 %	108758069
137	NC_008095	GGGTA	2	10	174251	174260	20 %	20 %	60 %	0 %	108757183
138	NC_008095	GCGAG	2	10	174507	174516	20 %	0 %	60 %	20 %	108757103
139	NC_008095	GCGCG	2	10	175249	175258	0 %	0 %	60 %	40 %	108757103
140	NC_008095	CGGCG	2	10	175488	175497	0 %	0 %	60 %	40 %	108757103
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150	NC_008095	CTGGA	2	10	191415	191424	20 %	20 %	40 %	20 %	108759302
151	NC_008095	CGCGG	2	10	192594	192603	0 %	0 %	60 %	40 %	108763287
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187	NC_008095	CGCGG	2	10	251277	251286	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
188	NC_008095	GCGCT	2	10	251556	251565	0 %	20 %	40 %	40 %	108760747
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257	NC_008095	CCAGC	2	10	324598	324607	20 %	0 %	20 %	60 %	108760101
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259	NC_008095	ACGGA	2	10	329535	329544	40 %	0 %	40 %	20 %	108762335
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261	NC_008095	CGCGG	2	10	330644	330653	0 %	0 %	60 %	40 %	108758210
262	NC_008095	GGCCA	2	10	330660	330669	20 %	0 %	40 %	40 %	108758210
263	NC_008095	GAAGG	2	10	331370	331379	40 %	0 %	60 %	0 %	108758210
264	NC_008095	GGGTG	3	15	331669	331683	0 %	20 %	80 %	0 %	108758210
265	NC_008095	GCTTC	2	10	333928	333937	0 %	40 %	20 %	40 %	108760659
266	NC_008095	GGACG	2	10	334267	334276	20 %	0 %	60 %	20 %	108761222
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