MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 plasmid pHPAG1

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008087	AACC	2	8	672	679	50 %	0 %	0 %	50 %	108564599
2	NC_008087	CTTG	2	8	927	934	0 %	50 %	25 %	25 %	108564599
3	NC_008087	TACT	2	8	1102	1109	25 %	50 %	0 %	25 %	108564599
4	NC_008087	AGCA	2	8	1687	1694	50 %	0 %	25 %	25 %	108564599
5	NC_008087	TGTT	2	8	1745	1752	0 %	75 %	25 %	0 %	108564599
6	NC_008087	ACGA	2	8	1819	1826	50 %	0 %	25 %	25 %	108564599
7	NC_008087	ATGC	2	8	2073	2080	25 %	25 %	25 %	25 %	108564600
8	NC_008087	GAAA	2	8	2110	2117	75 %	0 %	25 %	0 %	108564600
9	NC_008087	ATCA	2	8	2290	2297	50 %	25 %	0 %	25 %	108564600
10	NC_008087	TTGA	2	8	2317	2324	25 %	50 %	25 %	0 %	108564600
11	NC_008087	ATCA	2	8	3838	3845	50 %	25 %	0 %	25 %	108564601
12	NC_008087	TACT	2	8	4386	4393	25 %	50 %	0 %	25 %	108564601
13	NC_008087	AGCA	2	8	4968	4975	50 %	0 %	25 %	25 %	108564601
14	NC_008087	TGTT	2	8	5026	5033	0 %	75 %	25 %	0 %	108564601
15	NC_008087	ACGA	2	8	5100	5107	50 %	0 %	25 %	25 %	108564601
16	NC_008087	CTTG	2	8	5688	5695	0 %	50 %	25 %	25 %	108564602
17	NC_008087	TTTC	2	8	5838	5845	0 %	75 %	0 %	25 %	108564602
18	NC_008087	TTGG	2	8	6204	6211	0 %	50 %	50 %	0 %	108564602
19	NC_008087	TTAG	2	8	7293	7300	25 %	50 %	25 %	0 %	108564602
20	NC_008087	ATTG	2	8	7442	7449	25 %	50 %	25 %	0 %	108564603
21	NC_008087	AAGA	2	8	8088	8095	75 %	0 %	25 %	0 %	108564604
22	NC_008087	CTAA	2	8	8378	8385	50 %	25 %	0 %	25 %	108564606

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.