MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 plasmid pHPAG1

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008087	CTT	2	6	29	34	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008087	CTT	2	6	51	56	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008087	CTT	2	6	73	78	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008087	ATT	2	6	116	121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008087	AAC	2	6	141	146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008087	AGG	2	6	250	255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008087	TAG	2	6	278	283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008087	TAA	2	6	335	340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008087	CTT	2	6	361	366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008087	TTA	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008087	ATT	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108564599
12	NC_008087	AGA	2	6	489	494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108564599
13	NC_008087	CAA	2	6	656	661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564599
14	NC_008087	ACC	2	6	730	735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108564599
15	NC_008087	TAA	2	6	750	755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108564599
16	NC_008087	ATT	2	6	906	911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108564599
17	NC_008087	ACA	2	6	935	940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564599
18	NC_008087	CAA	2	6	1110	1115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564599
19	NC_008087	AAC	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564599
20	NC_008087	ACA	2	6	1634	1639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564599
21	NC_008087	CAA	2	6	1719	1724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564599
22	NC_008087	AGA	2	6	1785	1790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108564599
23	NC_008087	GAA	2	6	1843	1848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108564599
24	NC_008087	TGA	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564600
25	NC_008087	TGA	2	6	2394	2399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564600
26	NC_008087	TGG	2	6	2406	2411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108564600
27	NC_008087	CAA	2	6	2450	2455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564600
28	NC_008087	CAT	2	6	2532	2537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108564600
29	NC_008087	TCA	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108564600
30	NC_008087	TAC	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108564600
31	NC_008087	ACA	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564600
32	NC_008087	CAA	2	6	3095	3100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008087	GTT	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008087	TTA	2	6	3270	3275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008087	AAC	2	6	3284	3289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008087	TGT	2	6	3292	3297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008087	ACC	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_008087	CTT	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008087	CTT	2	6	3430	3435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008087	CTT	2	6	3452	3457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008087	CTT	2	6	3474	3479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008087	GGA	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008087	AGG	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008087	TAT	2	6	3680	3685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008087	TTA	2	6	3735	3740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008087	TAT	2	6	3802	3807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008087	CAA	2	6	3958	3963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564601
48	NC_008087	CAA	2	6	4043	4048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564601
49	NC_008087	TAA	2	6	4052	4057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108564601
50	NC_008087	GTT	2	6	4212	4217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564601
51	NC_008087	CAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564601
52	NC_008087	CTT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108564601
53	NC_008087	AAC	2	6	4708	4713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564601
54	NC_008087	ACA	2	6	4915	4920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564601
55	NC_008087	CAA	2	6	5000	5005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564601
56	NC_008087	AGA	2	6	5066	5071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108564601
57	NC_008087	GAA	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108564601
58	NC_008087	TGT	2	6	5516	5521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
59	NC_008087	AAG	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108564602
60	NC_008087	GTT	2	6	5699	5704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
61	NC_008087	TTG	2	6	5788	5793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
62	NC_008087	TAA	2	6	5914	5919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108564602
63	NC_008087	TGT	2	6	5922	5927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
64	NC_008087	CTG	2	6	6015	6020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108564602
65	NC_008087	TAA	2	6	6040	6045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108564602
66	NC_008087	GTA	2	6	6093	6098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564602
67	NC_008087	CTT	2	6	6129	6134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108564602
68	NC_008087	GTT	2	6	6232	6237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
69	NC_008087	CTT	2	6	6270	6275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108564602
70	NC_008087	ATG	2	6	6350	6355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564602
71	NC_008087	ATG	2	6	6365	6370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564602
72	NC_008087	TGT	2	6	6456	6461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
73	NC_008087	TTG	2	6	6467	6472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
74	NC_008087	TAG	2	6	6546	6551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564602
75	NC_008087	GTT	2	6	6553	6558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
76	NC_008087	ATT	2	6	6632	6637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108564602
77	NC_008087	GTA	2	6	6719	6724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564602
78	NC_008087	TGA	2	6	6826	6831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564602
79	NC_008087	GTT	2	6	6937	6942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
80	NC_008087	TGT	2	6	6946	6951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
81	NC_008087	TGT	2	6	7141	7146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
82	NC_008087	TCA	2	6	7215	7220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108564602
83	NC_008087	GTT	2	6	7433	7438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564603
84	NC_008087	GTT	2	6	7463	7468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564603
85	NC_008087	TTA	2	6	7495	7500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108564603
86	NC_008087	TTA	2	6	7567	7572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108564603
87	NC_008087	TTG	2	6	7598	7603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564603
88	NC_008087	TAT	2	6	7871	7876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008087	TGA	2	6	8295	8300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564605
90	NC_008087	ACA	2	6	8319	8324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564605
91	NC_008087	TTG	2	6	8620	8625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008087	GTT	2	6	8683	8688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008087	TTC	2	6	8699	8704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008087	ATC	2	6	8747	8752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008087	CAA	2	6	9084	9089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008087	GTT	2	6	9252	9257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008087	TTA	2	6	9259	9264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008087	AAC	2	6	9273	9278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008087	TGT	2	6	9281	9286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008087	ACC	2	6	9336	9341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.