MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 plasmid pHPAG1

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008087	ATT	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108564599
2	NC_008087	AGA	2	6	489	494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108564599
3	NC_008087	CAA	2	6	656	661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564599
4	NC_008087	ACC	2	6	730	735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108564599
5	NC_008087	TAA	2	6	750	755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108564599
6	NC_008087	ATT	2	6	906	911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108564599
7	NC_008087	ACA	2	6	935	940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564599
8	NC_008087	CAA	2	6	1110	1115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564599
9	NC_008087	AAC	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564599
10	NC_008087	ACA	2	6	1634	1639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564599
11	NC_008087	CAA	2	6	1719	1724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564599
12	NC_008087	AGA	2	6	1785	1790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108564599
13	NC_008087	GAA	2	6	1843	1848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108564599
14	NC_008087	TGA	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564600
15	NC_008087	TGA	2	6	2394	2399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564600
16	NC_008087	TGG	2	6	2406	2411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108564600
17	NC_008087	CAA	2	6	2450	2455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564600
18	NC_008087	CAT	2	6	2532	2537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108564600
19	NC_008087	TCA	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108564600
20	NC_008087	TAC	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108564600
21	NC_008087	ACA	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564600
22	NC_008087	CAA	2	6	3958	3963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564601
23	NC_008087	CAA	2	6	4043	4048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564601
24	NC_008087	TAA	2	6	4052	4057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108564601
25	NC_008087	GTT	2	6	4212	4217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564601
26	NC_008087	CAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564601
27	NC_008087	CTT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108564601
28	NC_008087	AAC	2	6	4708	4713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564601
29	NC_008087	ACA	2	6	4915	4920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564601
30	NC_008087	CAA	2	6	5000	5005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564601
31	NC_008087	AGA	2	6	5066	5071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108564601
32	NC_008087	GAA	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108564601
33	NC_008087	TGT	2	6	5516	5521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
34	NC_008087	AAG	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108564602
35	NC_008087	GTT	2	6	5699	5704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
36	NC_008087	TTG	2	6	5788	5793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
37	NC_008087	TAA	2	6	5914	5919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108564602
38	NC_008087	TGT	2	6	5922	5927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
39	NC_008087	CTG	2	6	6015	6020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108564602
40	NC_008087	TAA	2	6	6040	6045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108564602
41	NC_008087	GTA	2	6	6093	6098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564602
42	NC_008087	CTT	2	6	6129	6134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108564602
43	NC_008087	GTT	2	6	6232	6237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
44	NC_008087	CTT	2	6	6270	6275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108564602
45	NC_008087	ATG	2	6	6350	6355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564602
46	NC_008087	ATG	2	6	6365	6370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564602
47	NC_008087	TGT	2	6	6456	6461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
48	NC_008087	TTG	2	6	6467	6472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
49	NC_008087	TAG	2	6	6546	6551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564602
50	NC_008087	GTT	2	6	6553	6558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
51	NC_008087	ATT	2	6	6632	6637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108564602
52	NC_008087	GTA	2	6	6719	6724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564602
53	NC_008087	TGA	2	6	6826	6831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564602
54	NC_008087	GTT	2	6	6937	6942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
55	NC_008087	TGT	2	6	6946	6951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
56	NC_008087	TGT	2	6	7141	7146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564602
57	NC_008087	TCA	2	6	7215	7220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108564602
58	NC_008087	GTT	2	6	7433	7438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564603
59	NC_008087	GTT	2	6	7463	7468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564603
60	NC_008087	TTA	2	6	7495	7500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108564603
61	NC_008087	TTA	2	6	7567	7572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108564603
62	NC_008087	TTG	2	6	7598	7603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108564603
63	NC_008087	TGA	2	6	8295	8300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108564605
64	NC_008087	ACA	2	6	8319	8324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108564605

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.