MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 plasmid pHPAG1

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008087	AC	3	6	500	505	50 %	0 %	0 %	50 %	108564599
2	NC_008087	AG	3	6	967	972	50 %	0 %	50 %	0 %	108564599
3	NC_008087	AG	3	6	1255	1260	50 %	0 %	50 %	0 %	108564599
4	NC_008087	GC	4	8	3317	3324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008087	AG	3	6	3638	3643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008087	TA	3	6	3822	3827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008087	TC	3	6	5465	5470	0 %	50 %	0 %	50 %	108564602
8	NC_008087	CT	3	6	5534	5539	0 %	50 %	0 %	50 %	108564602
9	NC_008087	CT	3	6	5951	5956	0 %	50 %	0 %	50 %	108564602
10	NC_008087	CT	3	6	6506	6511	0 %	50 %	0 %	50 %	108564602
11	NC_008087	CT	3	6	6654	6659	0 %	50 %	0 %	50 %	108564602
12	NC_008087	CT	3	6	6683	6688	0 %	50 %	0 %	50 %	108564602
13	NC_008087	GT	3	6	7122	7127	0 %	50 %	50 %	0 %	108564602
14	NC_008087	CA	3	6	7250	7255	50 %	0 %	0 %	50 %	108564602
15	NC_008087	AG	4	8	7275	7282	50 %	0 %	50 %	0 %	108564602
16	NC_008087	AG	3	6	7627	7632	50 %	0 %	50 %	0 %	108564603
17	NC_008087	TA	3	6	7847	7852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008087	AG	3	6	8144	8149	50 %	0 %	50 %	0 %	108564604
19	NC_008087	AG	3	6	8205	8210	50 %	0 %	50 %	0 %	108564604
20	NC_008087	AT	3	6	8211	8216	50 %	50 %	0 %	0 %	108564604
21	NC_008087	AT	3	6	8564	8569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008087	GC	4	8	9306	9313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.