MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 plasmid pHPAG1

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008087	A	6	6	1369	1374	100 %	0 %	0 %	0 %	108564599
2	NC_008087	A	7	7	1649	1655	100 %	0 %	0 %	0 %	108564599
3	NC_008087	A	6	6	1768	1773	100 %	0 %	0 %	0 %	108564599
4	NC_008087	A	7	7	2249	2255	100 %	0 %	0 %	0 %	108564600
5	NC_008087	A	6	6	2416	2421	100 %	0 %	0 %	0 %	108564600
6	NC_008087	T	6	6	2811	2816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008087	T	6	6	2842	2847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008087	A	6	6	2892	2897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008087	A	7	7	2920	2926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008087	C	6	6	2935	2940	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_008087	A	6	6	3215	3220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008087	A	6	6	4650	4655	100 %	0 %	0 %	0 %	108564601
13	NC_008087	A	7	7	4930	4936	100 %	0 %	0 %	0 %	108564601
14	NC_008087	A	6	6	5049	5054	100 %	0 %	0 %	0 %	108564601
15	NC_008087	A	8	8	5420	5427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008087	T	6	6	5479	5484	0 %	100 %	0 %	0 %	108564602
17	NC_008087	A	6	6	6819	6824	100 %	0 %	0 %	0 %	108564602
18	NC_008087	T	6	6	7587	7592	0 %	100 %	0 %	0 %	108564603
19	NC_008087	T	7	7	7660	7666	0 %	100 %	0 %	0 %	108564603
20	NC_008087	T	8	8	7730	7737	0 %	100 %	0 %	0 %	108564603
21	NC_008087	T	7	7	7756	7762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008087	A	6	6	7955	7960	100 %	0 %	0 %	0 %	108564604
23	NC_008087	A	7	7	8100	8106	100 %	0 %	0 %	0 %	108564604
24	NC_008087	T	6	6	8771	8776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008087	T	6	6	8800	8805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008087	T	6	6	8831	8836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008087	A	6	6	8881	8886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008087	A	7	7	8909	8915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008087	C	6	6	8924	8929	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_008087	A	6	6	9204	9209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.