MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	TTTCTT	2	12	24245	24256	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008086	TAAGAT	2	12	92493	92504	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008086	TACAAA	2	12	94617	94628	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008086	AAAACA	2	12	130568	130579	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008086	GTTTTA	2	12	133992	134003	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008086	TTGTTT	2	12	155569	155580	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008086	TAAAAA	2	12	169861	169872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008086	TTTTGC	2	12	228335	228346	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008086	CAAAAC	2	12	228354	228365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008086	ATTAAA	2	12	229860	229871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008086	ATTTTA	2	12	253006	253017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008086	TTTTAT	2	12	380898	380909	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008086	ATTATA	2	12	413785	413796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008086	AAAATA	2	12	439352	439363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008086	TAAAAA	2	12	453328	453339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008086	TATTTT	2	12	476841	476852	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008086	TAAAAT	2	12	485132	485143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008086	TTTAAT	2	12	488416	488427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008086	TTTAGA	2	12	503283	503294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008086	GAATAA	2	12	534269	534280	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008086	TTTAAA	2	12	552492	552503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008086	ATTTTA	2	12	585818	585829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008086	TAAAAT	2	12	592913	592924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008086	ACACCA	2	12	647976	647987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008086	AAGAAA	2	12	694782	694793	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008086	AAAAAT	2	12	701846	701857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008086	CGGCTT	2	12	766917	766928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008086	AAAACT	2	12	862522	862533	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008086	ATTTTT	2	12	892731	892742	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008086	AAAATA	2	12	909258	909269	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008086	ATTATA	2	12	937034	937045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008086	ATTGAA	2	12	944528	944539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008086	TTAAAA	2	12	992224	992235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008086	TATGGG	2	12	992286	992297	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008086	TTTCTT	2	12	1009867	1009878	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008086	CTTTAA	2	12	1013556	1013567	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008086	ACAAAA	2	12	1107844	1107855	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008086	AACGCC	2	12	1141750	1141761	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008086	TTGTAT	2	12	1194208	1194219	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008086	ACTTAA	2	12	1211187	1211198	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008086	CCCTAA	2	12	1227726	1227737	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008086	AAACTT	2	12	1234772	1234783	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008086	AAAAAG	2	12	1249898	1249909	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008086	TAAAAA	2	12	1288175	1288186	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008086	AGTTTT	2	12	1380275	1380286	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008086	CTTTAA	2	12	1382860	1382871	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008086	AGCGGG	2	12	1391675	1391686	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008086	GTTTTA	2	12	1401741	1401752	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008086	TAAAAA	2	12	1403568	1403579	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008086	CTAAGT	2	12	1414949	1414960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008086	TATATT	2	12	1480222	1480233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008086	TAATTT	2	12	1497915	1497926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008086	TAAAAA	2	12	1512091	1512102	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008086	GTGTGA	2	12	1576065	1576076	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008086	AAAGAT	2	12	1592660	1592671	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008086	ATGATT	2	12	1594042	1594053	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.