MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	TTGCAA	2	12	2385	2396	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	108562427
2	NC_008086	ATTATA	2	12	3313	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	108562429
3	NC_008086	GCTTGC	2	12	7631	7642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108562434
4	NC_008086	GAAACC	2	12	9032	9043	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	108562435
5	NC_008086	ACTAAA	2	12	15528	15539	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	108562441
6	NC_008086	AGCTTG	2	12	17272	17283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	108562442
7	NC_008086	AGAAAA	2	12	19950	19961	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	108562444
8	NC_008086	GAATGA	2	12	23329	23340	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	108562447
9	NC_008086	CAATTC	2	12	28164	28175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562449
10	NC_008086	TATCAA	2	12	31341	31352	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	108562453
11	NC_008086	GCGTGG	2	12	34044	34055	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	108562456
12	NC_008086	TTGGAT	2	12	34154	34165	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	108562456
13	NC_008086	TAATGA	2	12	34189	34200	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	108562456
14	NC_008086	TTGAAT	2	12	35240	35251	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	108562456
15	NC_008086	TAAGGA	2	12	35539	35550	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	108562456
16	NC_008086	TAGGGG	2	12	37042	37053	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	108562459
17	NC_008086	AAAGAA	2	12	38554	38565	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	108562460
18	NC_008086	AAAGAA	2	12	40133	40144	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	108562463
19	NC_008086	CAAAAT	2	12	42473	42484	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	108562465
20	NC_008086	CGCAAA	2	12	46323	46334	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	108562468
21	NC_008086	TAAAAA	2	12	55220	55231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	108562477
22	NC_008086	AGAAAA	2	12	60012	60023	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	108562481
23	NC_008086	AATTTT	2	12	60184	60195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562481
24	NC_008086	AGAAAA	2	12	60948	60959	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	108562482
25	NC_008086	GATGTG	2	12	61622	61633	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	108562483
26	NC_008086	AGCCAA	2	12	61700	61711	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	108562483
27	NC_008086	AAAAGA	2	12	62727	62738	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	108562484
28	NC_008086	CCAACA	2	12	63572	63583	50 %	0 %	0 %	50 %	108562484
29	NC_008086	TTTTGT	2	12	63909	63920	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	108562486
30	NC_008086	AAAGAG	2	12	64188	64199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562486
31	NC_008086	AGCGGG	2	12	68183	68194	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	108562492
32	NC_008086	ACGCCC	2	12	76035	76046	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	108562500
33	NC_008086	AAGGGC	2	12	78763	78774	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	108562503
34	NC_008086	AGGATA	2	12	80147	80158	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	108562505
35	NC_008086	AGCGTG	2	12	80662	80673	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108562505
36	NC_008086	CAACGA	2	12	81011	81022	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	108562505
37	NC_008086	GGCATG	2	12	82524	82535	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108562506
38	NC_008086	ACACCG	2	12	83458	83469	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	108562506
39	NC_008086	AATATT	2	12	84316	84327	50 %	50 %	0 %	0 %	108562508
40	NC_008086	AAGCAT	2	12	96202	96213	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	108562518
41	NC_008086	CAAGAT	2	12	96841	96852	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	108562519
42	NC_008086	GATTTT	2	12	98269	98280	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	108562521
43	NC_008086	AAACTC	2	12	98386	98397	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	108562521
44	NC_008086	TCAAAA	2	12	99670	99681	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	108562522
45	NC_008086	GCGGTG	2	12	100368	100379	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	108562523
46	NC_008086	TTAAGG	2	12	101915	101926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562524
47	NC_008086	AATATT	2	12	103576	103587	50 %	50 %	0 %	0 %	108562524
48	NC_008086	AAACCT	2	12	105125	105136	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	108562526
49	NC_008086	ATATTT	2	12	109304	109315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562529
50	NC_008086	GGAGCG	2	12	114360	114371	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	108562534
51	NC_008086	GCAAGC	2	12	116267	116278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108562535
52	NC_008086	GTTAAG	2	12	120789	120800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562540
53	NC_008086	CGCTCG	2	12	120865	120876	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	108562540
54	NC_008086	TAGGCA	2	12	123402	123413	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	108562541
55	NC_008086	CTTCTA	2	12	125739	125750	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	108562543
56	NC_008086	TGAATT	2	12	129461	129472	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	108562545
57	NC_008086	AGCAAA	2	12	132982	132993	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	108562548
58	NC_008086	TAGCGA	2	12	144385	144396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	108562561
59	NC_008086	ACGATT	2	12	146908	146919	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	108562563
60	NC_008086	TTAGCG	2	12	147277	147288	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	108562563
61	NC_008086	TATCGC	2	12	147489	147500	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	108562563
62	NC_008086	ATCGCT	2	12	149198	149209	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	108562564
63	NC_008086	TTCTAT	2	12	152581	152592	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	108562567
64	NC_008086	ATTGGA	2	12	157606	157617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562574
65	NC_008086	TTGGGT	2	12	161009	161020	0 %	50 %	50 %	0 %	108562578
66	NC_008086	GATTTT	2	12	161523	161534	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	108562579
67	NC_008086	GATGGC	2	12	164748	164759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108562583
68	NC_008086	GATGGC	2	12	164856	164867	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108562583
69	NC_008086	CTTTCT	2	12	165000	165011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562583
70	NC_008086	CCGCTC	2	12	166775	166786	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	108562585
71	NC_008086	GCTCTC	2	12	169203	169214	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	108562587
72	NC_008086	TAGTGG	2	12	170972	170983	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	108562590
73	NC_008086	TTCTAA	2	12	171525	171536	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	108562590
74	NC_008086	CATTTT	2	12	173328	173339	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	108562592
75	NC_008086	ATCGTT	2	12	173641	173652	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	108562592
76	NC_008086	AATTTC	2	12	173992	174003	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	108562593
77	NC_008086	TAAAAT	2	12	175516	175527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562594
78	NC_008086	TTCTTT	2	12	175926	175937	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	108562594
79	NC_008086	ATTTTG	2	12	177320	177331	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	108562596
80	NC_008086	CGCTTT	2	12	177798	177809	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	108562596
81	NC_008086	ACTTAT	2	12	177895	177906	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	108562596
82	NC_008086	GTTTAA	2	12	178582	178593	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	108562597
83	NC_008086	GTGATA	2	12	183310	183321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562602
84	NC_008086	GAAAAA	2	12	185660	185671	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	108562604
85	NC_008086	AGGCAT	2	12	185749	185760	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	108562604
86	NC_008086	GCATTT	2	12	187462	187473	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	108562606
87	NC_008086	TCAAAC	2	12	188029	188040	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	108562607
88	NC_008086	ATAAAG	2	12	188196	188207	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	108562607
89	NC_008086	GGTATT	2	12	190488	190499	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	108562609
90	NC_008086	TCTAAA	2	12	190718	190729	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	108562609
91	NC_008086	GGCATG	2	12	191789	191800	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108562610
92	NC_008086	ATTTTC	2	12	194211	194222	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	108562611
93	NC_008086	TGGGGC	2	12	201608	201619	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	108562621
94	NC_008086	AAATCC	2	12	203377	203388	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	108562623
95	NC_008086	CTGTAT	2	12	205393	205404	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	108562625
96	NC_008086	TAGCTT	2	12	206338	206349	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	108562626
97	NC_008086	TTGGCT	2	12	206516	206527	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	108562626
98	NC_008086	AATTTT	2	12	208526	208537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562630
99	NC_008086	ATTAAA	2	12	215282	215293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562637
100	NC_008086	CATAGC	2	12	218513	218524	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	108562639
101	NC_008086	GTTTTG	2	12	219018	219029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562639
102	NC_008086	GCTAGA	2	12	223147	223158	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	108562642
103	NC_008086	TAATTA	2	12	223521	223532	50 %	50 %	0 %	0 %	108562643
104	NC_008086	GGTGAT	2	12	235689	235700	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	108562656
105	NC_008086	TCAATA	2	12	236124	236135	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	108562657
106	NC_008086	CACGCC	2	12	236604	236615	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	108562657
107	NC_008086	TATTTT	2	12	237158	237169	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	108562657
108	NC_008086	GCTTTG	2	12	237858	237869	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	108562658
109	NC_008086	GCTAGG	2	12	239239	239250	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108562659
110	NC_008086	TCTTTA	2	12	245908	245919	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	108562666
111	NC_008086	GTTTTT	2	12	251545	251556	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	108562673
112	NC_008086	ATTGTC	2	12	254701	254712	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	108562676
113	NC_008086	TCCCGC	2	12	257685	257696	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	108562678
114	NC_008086	GAAAAG	2	12	263704	263715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562683
115	NC_008086	AAAAAG	2	12	264015	264026	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	108562684
116	NC_008086	GCTTTA	2	12	270185	270196	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	108562691
117	NC_008086	ATGGAA	2	12	271547	271558	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	108562691
118	NC_008086	GATTTT	2	12	272263	272274	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	108562691
119	NC_008086	TGAGCG	2	12	275525	275536	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108562694
120	NC_008086	AGCTTT	2	12	275673	275684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	108562694
121	NC_008086	ATTAGA	2	12	280332	280343	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	108562701
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234	NC_008086	GGCATA	2	12	513915	513926	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	108562921
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345	NC_008086	TGGCTC	2	12	744663	744674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108563132
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347	NC_008086	TACCAT	2	12	750014	750025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108563136
348	NC_008086	AGGCTT	2	12	751626	751637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	108563138
349	NC_008086	CTTCCA	2	12	752254	752265	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	108563138
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352	NC_008086	TGTTTG	2	12	762389	762400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108563149
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356	NC_008086	CATGCT	2	12	772246	772257	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	108563159
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449	NC_008086	CGCATG	2	12	1003923	1003934	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108563382
450	NC_008086	TCCAAA	2	12	1004849	1004860	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	108563382
451	NC_008086	GATAGC	2	12	1005130	1005141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	108563383
452	NC_008086	GGGACT	2	12	1008476	1008487	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108563385
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454	NC_008086	ACGCTC	2	12	1009748	1009759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108563386
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458	NC_008086	AAAGCC	2	12	1037410	1037421	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	108563410
459	NC_008086	CCAAAG	2	12	1039934	1039945	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	108563412
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