MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 1276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	TTAAA	2	10	440	449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008086	TGTTC	2	10	941	950	0 %	60 %	20 %	20 %	108562425
3	NC_008086	TAAAA	2	10	3119	3128	80 %	20 %	0 %	0 %	108562428
4	NC_008086	GATTA	2	10	3766	3775	40 %	40 %	20 %	0 %	108562429
5	NC_008086	GTTTT	2	10	3945	3954	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008086	GAAAC	2	10	6175	6184	60 %	0 %	20 %	20 %	108562433
7	NC_008086	TTTTA	2	10	6454	6463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008086	AAATT	2	10	8616	8625	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008086	TTTCT	2	10	9696	9705	0 %	80 %	0 %	20 %	108562435
10	NC_008086	AATTT	2	10	10535	10544	40 %	60 %	0 %	0 %	108562435
11	NC_008086	TTGAA	2	10	13208	13217	40 %	40 %	20 %	0 %	108562438
12	NC_008086	TTTTG	2	10	13224	13233	0 %	80 %	20 %	0 %	108562438
13	NC_008086	TGGTG	2	10	14059	14068	0 %	40 %	60 %	0 %	108562439
14	NC_008086	GCTTT	2	10	14885	14894	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008086	CAAAA	2	10	19915	19924	80 %	0 %	0 %	20 %	108562444
16	NC_008086	AATCA	2	10	24462	24471	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008086	CCATG	2	10	24725	24734	20 %	20 %	20 %	40 %	108562448
18	NC_008086	AGCCT	2	10	27193	27202	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008086	CAAGC	2	10	29385	29394	40 %	0 %	20 %	40 %	108562450
20	NC_008086	TGGGT	2	10	29822	29831	0 %	40 %	60 %	0 %	108562450
21	NC_008086	TTTTA	2	10	30310	30319	20 %	80 %	0 %	0 %	108562451
22	NC_008086	GTGGG	2	10	35202	35211	0 %	20 %	80 %	0 %	108562456
23	NC_008086	TGGGG	2	10	36453	36462	0 %	20 %	80 %	0 %	108562458
24	NC_008086	TTACT	2	10	44380	44389	20 %	60 %	0 %	20 %	108562467
25	NC_008086	TTTAG	2	10	45484	45493	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008086	TAAAA	2	10	46258	46267	80 %	20 %	0 %	0 %	108562468
27	NC_008086	TCCCA	2	10	47270	47279	20 %	20 %	0 %	60 %	108562469
28	NC_008086	GCTCC	2	10	47591	47600	0 %	20 %	20 %	60 %	108562469
29	NC_008086	TCGCA	2	10	48128	48137	20 %	20 %	20 %	40 %	108562469
30	NC_008086	TAGGG	2	10	48370	48379	20 %	20 %	60 %	0 %	108562469
31	NC_008086	TGCCT	2	10	50385	50394	0 %	40 %	20 %	40 %	108562471
32	NC_008086	TAAAA	2	10	52216	52225	80 %	20 %	0 %	0 %	108562473
33	NC_008086	ATTTC	2	10	52291	52300	20 %	60 %	0 %	20 %	108562473
34	NC_008086	TGAAA	2	10	54139	54148	60 %	20 %	20 %	0 %	108562477
35	NC_008086	TCAAA	2	10	54393	54402	60 %	20 %	0 %	20 %	108562477
36	NC_008086	CAACA	2	10	57801	57810	60 %	0 %	0 %	40 %	108562478
37	NC_008086	TCAAA	2	10	58148	58157	60 %	20 %	0 %	20 %	108562478
38	NC_008086	TTAAA	2	10	59169	59178	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008086	TATCC	2	10	62322	62331	20 %	40 %	0 %	40 %	108562483
40	NC_008086	TGGAT	2	10	65311	65320	20 %	40 %	40 %	0 %	108562488
41	NC_008086	GAACG	2	10	65972	65981	40 %	0 %	40 %	20 %	108562488
42	NC_008086	GGTGG	2	10	68104	68113	0 %	20 %	80 %	0 %	108562492
43	NC_008086	TCAAT	2	10	71374	71383	40 %	40 %	0 %	20 %	108562495
44	NC_008086	CTTCT	2	10	72220	72229	0 %	60 %	0 %	40 %	108562496
45	NC_008086	TGCCT	2	10	72297	72306	0 %	40 %	20 %	40 %	108562496
46	NC_008086	TCCAA	2	10	72709	72718	40 %	20 %	0 %	40 %	108562497
47	NC_008086	TTTTA	2	10	75960	75969	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008086	TTTTG	2	10	75991	76000	0 %	80 %	20 %	0 %	108562500
49	NC_008086	ACGCC	2	10	76297	76306	20 %	0 %	20 %	60 %	108562500
50	NC_008086	AAAGC	2	10	77063	77072	60 %	0 %	20 %	20 %	108562501
51	NC_008086	TTACA	2	10	77845	77854	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_008086	TTTGT	2	10	81778	81787	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008086	TCTTG	2	10	85473	85482	0 %	60 %	20 %	20 %	108562508
54	NC_008086	TGGCT	2	10	86013	86022	0 %	40 %	40 %	20 %	108562508
55	NC_008086	ATGCC	2	10	86433	86442	20 %	20 %	20 %	40 %	108562509
56	NC_008086	TTGAT	2	10	87470	87479	20 %	60 %	20 %	0 %	108562511
57	NC_008086	GGCGT	2	10	89284	89293	0 %	20 %	60 %	20 %	108562513
58	NC_008086	ATAAA	2	10	92451	92460	80 %	20 %	0 %	0 %	108562514
59	NC_008086	TCCAT	2	10	92637	92646	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_008086	CTTTC	2	10	92878	92887	0 %	60 %	0 %	40 %	108562515
61	NC_008086	TTTGA	2	10	95845	95854	20 %	60 %	20 %	0 %	108562518
62	NC_008086	TCTTT	2	10	96056	96065	0 %	80 %	0 %	20 %	108562518
63	NC_008086	GGCTT	2	10	97177	97186	0 %	40 %	40 %	20 %	108562519
64	NC_008086	ATAAA	2	10	99185	99194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008086	GAATT	2	10	103957	103966	40 %	40 %	20 %	0 %	108562525
66	NC_008086	TCGTT	2	10	105756	105765	0 %	60 %	20 %	20 %	108562526
67	NC_008086	TCACT	2	10	108466	108475	20 %	40 %	0 %	40 %	108562529
68	NC_008086	TCTTT	2	10	109056	109065	0 %	80 %	0 %	20 %	108562529
69	NC_008086	AAAGC	2	10	111858	111867	60 %	0 %	20 %	20 %	108562531
70	NC_008086	GAATG	2	10	113085	113094	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008086	CAAAT	2	10	114380	114389	60 %	20 %	0 %	20 %	108562534
72	NC_008086	TCCTT	2	10	115745	115754	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_008086	ACCCT	2	10	115809	115818	20 %	20 %	0 %	60 %	108562535
74	NC_008086	ATGCC	2	10	115941	115950	20 %	20 %	20 %	40 %	108562535
75	NC_008086	ATTTA	2	10	117330	117339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008086	TGATT	2	10	117936	117945	20 %	60 %	20 %	0 %	108562537
77	NC_008086	CTAAA	2	10	118406	118415	60 %	20 %	0 %	20 %	108562539
78	NC_008086	AAGCC	2	10	124339	124348	40 %	0 %	20 %	40 %	108562542
79	NC_008086	CAATC	2	10	126599	126608	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_008086	TTCTG	2	10	127327	127336	0 %	60 %	20 %	20 %	108562544
81	NC_008086	CGCTG	2	10	128799	128808	0 %	20 %	40 %	40 %	108562545
82	NC_008086	TTTGA	2	10	128946	128955	20 %	60 %	20 %	0 %	108562545
83	NC_008086	CGCTC	2	10	129189	129198	0 %	20 %	20 %	60 %	108562545
84	NC_008086	GACTT	2	10	129480	129489	20 %	40 %	20 %	20 %	108562545
85	NC_008086	ATCTC	2	10	130231	130240	20 %	40 %	0 %	40 %	108562545
86	NC_008086	CGCTT	2	10	130389	130398	0 %	40 %	20 %	40 %	108562545
87	NC_008086	TTTGT	2	10	130744	130753	0 %	80 %	20 %	0 %	108562546
88	NC_008086	TGCGT	2	10	132793	132802	0 %	40 %	40 %	20 %	108562548
89	NC_008086	GAAAA	2	10	132954	132963	80 %	0 %	20 %	0 %	108562548
90	NC_008086	GAAAA	2	10	133272	133281	80 %	0 %	20 %	0 %	108562548
91	NC_008086	ATTTT	2	10	136230	136239	20 %	80 %	0 %	0 %	108562554
92	NC_008086	ATGTT	2	10	136312	136321	20 %	60 %	20 %	0 %	108562554
93	NC_008086	AAAAG	2	10	136724	136733	80 %	0 %	20 %	0 %	108562554
94	NC_008086	AGATT	2	10	137667	137676	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008086	AAATC	2	10	138711	138720	60 %	20 %	0 %	20 %	108562555
96	NC_008086	AAAAT	2	10	140183	140192	80 %	20 %	0 %	0 %	108562556
97	NC_008086	TTTTC	2	10	142749	142758	0 %	80 %	0 %	20 %	108562559
98	NC_008086	TTCTT	2	10	144705	144714	0 %	80 %	0 %	20 %	108562561
99	NC_008086	TCTTT	2	10	145200	145209	0 %	80 %	0 %	20 %	108562562
100	NC_008086	TTTTG	2	10	146362	146371	0 %	80 %	20 %	0 %	108562563
101	NC_008086	GCGAT	2	10	147155	147164	20 %	20 %	40 %	20 %	108562563
102	NC_008086	GCTTG	2	10	147411	147420	0 %	40 %	40 %	20 %	108562563
103	NC_008086	TTTTG	2	10	148064	148073	0 %	80 %	20 %	0 %	108562564
104	NC_008086	GATTG	2	10	153035	153044	20 %	40 %	40 %	0 %	108562567
105	NC_008086	TACTT	2	10	153192	153201	20 %	60 %	0 %	20 %	108562567
106	NC_008086	ACGCC	2	10	153426	153435	20 %	0 %	20 %	60 %	108562567
107	NC_008086	GCGTT	2	10	155680	155689	0 %	40 %	40 %	20 %	108562572
108	NC_008086	ATTTG	2	10	156656	156665	20 %	60 %	20 %	0 %	108562573
109	NC_008086	GTTTT	2	10	158387	158396	0 %	80 %	20 %	0 %	108562575
110	NC_008086	CAAAT	2	10	158554	158563	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_008086	AGATT	2	10	161178	161187	40 %	40 %	20 %	0 %	108562578
112	NC_008086	AAGCC	2	10	162516	162525	40 %	0 %	20 %	40 %	108562581
113	NC_008086	ATTTT	2	10	164568	164577	20 %	80 %	0 %	0 %	108562583
114	NC_008086	GGGTG	2	10	164924	164933	0 %	20 %	80 %	0 %	108562583
115	NC_008086	AACAA	2	10	165850	165859	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008086	ATTCA	2	10	166083	166092	40 %	40 %	0 %	20 %	108562584
117	NC_008086	ATCTT	2	10	169486	169495	20 %	60 %	0 %	20 %	108562587
118	NC_008086	ATATT	2	10	176849	176858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008086	GAATG	2	10	176986	176995	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008086	TGGGG	2	10	178087	178096	0 %	20 %	80 %	0 %	108562597
121	NC_008086	ATTTG	2	10	178864	178873	20 %	60 %	20 %	0 %	108562597
122	NC_008086	GGTGA	2	10	179489	179498	20 %	20 %	60 %	0 %	108562598
123	NC_008086	GATTT	2	10	179807	179816	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008086	AAATC	2	10	180019	180028	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008086	AAATG	2	10	180828	180837	60 %	20 %	20 %	0 %	108562600
126	NC_008086	TGTAA	2	10	181618	181627	40 %	40 %	20 %	0 %	108562601
127	NC_008086	ATAAA	2	10	183114	183123	80 %	20 %	0 %	0 %	108562602
128	NC_008086	TTTAA	2	10	183477	183486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008086	AAAAG	2	10	184258	184267	80 %	0 %	20 %	0 %	108562603
130	NC_008086	ACCCC	2	10	184323	184332	20 %	0 %	0 %	80 %	108562603
131	NC_008086	TGAAT	2	10	184639	184648	40 %	40 %	20 %	0 %	108562604
132	NC_008086	AATGA	2	10	189006	189015	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008086	ATTCA	2	10	190285	190294	40 %	40 %	0 %	20 %	108562609
134	NC_008086	TTCAA	2	10	195113	195122	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_008086	TATTG	2	10	195566	195575	20 %	60 %	20 %	0 %	108562613
136	NC_008086	TCATT	2	10	195897	195906	20 %	60 %	0 %	20 %	108562613
137	NC_008086	CTATT	2	10	196782	196791	20 %	60 %	0 %	20 %	108562615
138	NC_008086	TTTTC	2	10	197842	197851	0 %	80 %	0 %	20 %	108562616
139	NC_008086	TATTT	2	10	201593	201602	20 %	80 %	0 %	0 %	108562621
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141	NC_008086	TTTAT	2	10	202861	202870	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_008086	ATTCT	2	10	214305	214314	20 %	60 %	0 %	20 %	108562636
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