MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 4517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	ATGC	2	8	589	596	25 %	25 %	25 %	25 %	108562425
2	NC_008086	TTTC	2	8	881	888	0 %	75 %	0 %	25 %	108562425
3	NC_008086	TTCT	2	8	1094	1101	0 %	75 %	0 %	25 %	108562425
4	NC_008086	CAAA	2	8	1202	1209	75 %	0 %	0 %	25 %	108562425
5	NC_008086	AAAC	2	8	1308	1315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008086	GAGC	2	8	1546	1553	25 %	0 %	50 %	25 %	108562426
7	NC_008086	CATT	2	8	1632	1639	25 %	50 %	0 %	25 %	108562426
8	NC_008086	TTCT	2	8	1777	1784	0 %	75 %	0 %	25 %	108562426
9	NC_008086	TCTG	2	8	2328	2335	0 %	50 %	25 %	25 %	108562427
10	NC_008086	AAAT	2	8	2430	2437	75 %	25 %	0 %	0 %	108562428
11	NC_008086	GCTT	2	8	2973	2980	0 %	50 %	25 %	25 %	108562428
12	NC_008086	CCTG	2	8	3328	3335	0 %	25 %	25 %	50 %	108562429
13	NC_008086	CCAA	2	8	3352	3359	50 %	0 %	0 %	50 %	108562429
14	NC_008086	TGAA	2	8	3392	3399	50 %	25 %	25 %	0 %	108562429
15	NC_008086	TGAA	2	8	3580	3587	50 %	25 %	25 %	0 %	108562429
16	NC_008086	TTTG	2	8	3822	3829	0 %	75 %	25 %	0 %	108562429
17	NC_008086	ATTC	2	8	3867	3874	25 %	50 %	0 %	25 %	108562429
18	NC_008086	TCTT	2	8	4076	4083	0 %	75 %	0 %	25 %	108562430
19	NC_008086	GAAA	2	8	4841	4848	75 %	0 %	25 %	0 %	108562431
20	NC_008086	AGAA	2	8	5297	5304	75 %	0 %	25 %	0 %	108562431
21	NC_008086	CAAG	2	8	5342	5349	50 %	0 %	25 %	25 %	108562431
22	NC_008086	ATGC	2	8	5809	5816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008086	TAAA	2	8	6214	6221	75 %	25 %	0 %	0 %	108562433
24	NC_008086	TCGC	2	8	6734	6741	0 %	25 %	25 %	50 %	108562434
25	NC_008086	CATT	2	8	6807	6814	25 %	50 %	0 %	25 %	108562434
26	NC_008086	CTGG	2	8	8181	8188	0 %	25 %	50 %	25 %	108562434
27	NC_008086	ATCG	2	8	8356	8363	25 %	25 %	25 %	25 %	108562434
28	NC_008086	CGTT	2	8	8391	8398	0 %	50 %	25 %	25 %	108562434
29	NC_008086	TAAG	2	8	8648	8655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008086	TTTG	2	8	8742	8749	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008086	TTCA	2	8	9160	9167	25 %	50 %	0 %	25 %	108562435
32	NC_008086	TCTT	2	8	9454	9461	0 %	75 %	0 %	25 %	108562435
33	NC_008086	ATAA	2	8	10956	10963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008086	TATT	2	8	11155	11162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008086	ATTC	2	8	11170	11177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008086	AAAG	2	8	11206	11213	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008086	TCAA	2	8	11367	11374	50 %	25 %	0 %	25 %	108562437
38	NC_008086	TTTG	2	8	12187	12194	0 %	75 %	25 %	0 %	108562437
39	NC_008086	GTTT	2	8	12283	12290	0 %	75 %	25 %	0 %	108562437
40	NC_008086	CTTT	2	8	12815	12822	0 %	75 %	0 %	25 %	108562437
41	NC_008086	ATTG	2	8	13162	13169	25 %	50 %	25 %	0 %	108562438
42	NC_008086	GCAA	2	8	13353	13360	50 %	0 %	25 %	25 %	108562438
43	NC_008086	TGCT	2	8	13558	13565	0 %	50 %	25 %	25 %	108562438
44	NC_008086	GGCC	2	8	13821	13828	0 %	0 %	50 %	50 %	108562438
45	NC_008086	TGCA	2	8	14036	14043	25 %	25 %	25 %	25 %	108562439
46	NC_008086	AGCA	2	8	14091	14098	50 %	0 %	25 %	25 %	108562439
47	NC_008086	GTTT	2	8	14448	14455	0 %	75 %	25 %	0 %	108562439
48	NC_008086	TCTT	2	8	14835	14842	0 %	75 %	0 %	25 %	108562439
49	NC_008086	TTAA	2	8	14982	14989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008086	AGCG	2	8	15305	15312	25 %	0 %	50 %	25 %	108562441
51	NC_008086	GATT	2	8	15413	15420	25 %	50 %	25 %	0 %	108562441
52	NC_008086	CAAA	2	8	15582	15589	75 %	0 %	0 %	25 %	108562442
53	NC_008086	GTTA	2	8	15727	15734	25 %	50 %	25 %	0 %	108562442
54	NC_008086	ATGC	2	8	15997	16004	25 %	25 %	25 %	25 %	108562442
55	NC_008086	TTTA	2	8	16584	16591	25 %	75 %	0 %	0 %	108562442
56	NC_008086	TTTA	2	8	17060	17067	25 %	75 %	0 %	0 %	108562442
57	NC_008086	CAGG	2	8	17742	17749	25 %	0 %	50 %	25 %	108562442
58	NC_008086	TGAT	2	8	17786	17793	25 %	50 %	25 %	0 %	108562442
59	NC_008086	AACG	2	8	18590	18597	50 %	0 %	25 %	25 %	108562443
60	NC_008086	GAGC	2	8	18706	18713	25 %	0 %	50 %	25 %	108562443
61	NC_008086	GCTT	2	8	18762	18769	0 %	50 %	25 %	25 %	108562443
62	NC_008086	ATCT	2	8	19319	19326	25 %	50 %	0 %	25 %	108562443
63	NC_008086	GTTT	2	8	19537	19544	0 %	75 %	25 %	0 %	108562443
64	NC_008086	AGCA	2	8	19671	19678	50 %	0 %	25 %	25 %	108562444
65	NC_008086	TTGA	2	8	19879	19886	25 %	50 %	25 %	0 %	108562444
66	NC_008086	AGCG	2	8	20427	20434	25 %	0 %	50 %	25 %	108562444
67	NC_008086	TAAA	2	8	21933	21940	75 %	25 %	0 %	0 %	108562446
68	NC_008086	GCGA	2	8	21942	21949	25 %	0 %	50 %	25 %	108562446
69	NC_008086	TAAA	2	8	22686	22693	75 %	25 %	0 %	0 %	108562447
70	NC_008086	CTTT	2	8	22792	22799	0 %	75 %	0 %	25 %	108562447
71	NC_008086	AAGT	2	8	23104	23111	50 %	25 %	25 %	0 %	108562447
72	NC_008086	TTTA	2	8	23691	23698	25 %	75 %	0 %	0 %	108562447
73	NC_008086	CTTT	2	8	23869	23876	0 %	75 %	0 %	25 %	108562447
74	NC_008086	ATCA	2	8	24008	24015	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008086	GCTT	2	8	24393	24400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008086	TTTG	2	8	24478	24485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008086	GTTT	2	8	25082	25089	0 %	75 %	25 %	0 %	108562448
78	NC_008086	TTCC	2	8	25880	25887	0 %	50 %	0 %	50 %	108562448
79	NC_008086	TCCC	2	8	26222	26229	0 %	25 %	0 %	75 %	108562448
80	NC_008086	GATT	2	8	26705	26712	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008086	TAAG	2	8	26743	26750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008086	GCTT	2	8	27112	27119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008086	ATAA	2	8	27927	27934	75 %	25 %	0 %	0 %	108562449
84	NC_008086	AAGG	2	8	29329	29336	50 %	0 %	50 %	0 %	108562450
85	NC_008086	GCTC	2	8	29463	29470	0 %	25 %	25 %	50 %	108562450
86	NC_008086	ATGG	2	8	29911	29918	25 %	25 %	50 %	0 %	108562450
87	NC_008086	GAAT	2	8	30167	30174	50 %	25 %	25 %	0 %	108562451
88	NC_008086	GCGT	2	8	30524	30531	0 %	25 %	50 %	25 %	108562451
89	NC_008086	TTTA	2	8	30543	30550	25 %	75 %	0 %	0 %	108562451
90	NC_008086	TGGT	2	8	31061	31068	0 %	50 %	50 %	0 %	108562452
91	NC_008086	GAGT	2	8	31375	31382	25 %	25 %	50 %	0 %	108562453
92	NC_008086	TCAA	2	8	31397	31404	50 %	25 %	0 %	25 %	108562453
93	NC_008086	TGCT	2	8	31429	31436	0 %	50 %	25 %	25 %	108562453
94	NC_008086	AGCA	2	8	31546	31553	50 %	0 %	25 %	25 %	108562453
95	NC_008086	CAAT	2	8	31560	31567	50 %	25 %	0 %	25 %	108562453
96	NC_008086	TTGA	2	8	32095	32102	25 %	50 %	25 %	0 %	108562453
97	NC_008086	TAAA	2	8	32134	32141	75 %	25 %	0 %	0 %	108562453
98	NC_008086	GGTT	2	8	33035	33042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008086	TTTA	2	8	33169	33176	25 %	75 %	0 %	0 %	108562454
100	NC_008086	CAGA	2	8	33205	33212	50 %	0 %	25 %	25 %	108562454
101	NC_008086	TGAT	2	8	33314	33321	25 %	50 %	25 %	0 %	108562454
102	NC_008086	ATTG	2	8	33357	33364	25 %	50 %	25 %	0 %	108562454
103	NC_008086	GCGA	2	8	33367	33374	25 %	0 %	50 %	25 %	108562454
104	NC_008086	ACCC	2	8	33491	33498	25 %	0 %	0 %	75 %	108562455
105	NC_008086	CATC	2	8	33617	33624	25 %	25 %	0 %	50 %	108562455
106	NC_008086	TCAA	2	8	33759	33766	50 %	25 %	0 %	25 %	108562456
107	NC_008086	CATG	2	8	34882	34889	25 %	25 %	25 %	25 %	108562456
108	NC_008086	GAAA	2	8	34990	34997	75 %	0 %	25 %	0 %	108562456
109	NC_008086	CGCT	2	8	34998	35005	0 %	25 %	25 %	50 %	108562456
110	NC_008086	TCAT	2	8	35823	35830	25 %	50 %	0 %	25 %	108562456
111	NC_008086	GCTT	2	8	35897	35904	0 %	50 %	25 %	25 %	108562456
112	NC_008086	GAAA	2	8	35956	35963	75 %	0 %	25 %	0 %	108562456
113	NC_008086	ATGA	2	8	36237	36244	50 %	25 %	25 %	0 %	108562457
114	NC_008086	CGAG	2	8	36847	36854	25 %	0 %	50 %	25 %	108562459
115	NC_008086	TGCA	2	8	37715	37722	25 %	25 %	25 %	25 %	108562460
116	NC_008086	CTTT	2	8	37975	37982	0 %	75 %	0 %	25 %	108562460
117	NC_008086	ATGA	2	8	38536	38543	50 %	25 %	25 %	0 %	108562460
118	NC_008086	AATA	2	8	38652	38659	75 %	25 %	0 %	0 %	108562460
119	NC_008086	TAAA	2	8	38674	38681	75 %	25 %	0 %	0 %	108562460
120	NC_008086	GAAA	2	8	38804	38811	75 %	0 %	25 %	0 %	108562461
121	NC_008086	TTTG	2	8	39434	39441	0 %	75 %	25 %	0 %	108562462
122	NC_008086	CGAA	2	8	39624	39631	50 %	0 %	25 %	25 %	108562463
123	NC_008086	TGAT	2	8	39924	39931	25 %	50 %	25 %	0 %	108562463
124	NC_008086	AACC	2	8	40617	40624	50 %	0 %	0 %	50 %	108562464
125	NC_008086	CAAA	2	8	40901	40908	75 %	0 %	0 %	25 %	108562464
126	NC_008086	ATTG	2	8	41315	41322	25 %	50 %	25 %	0 %	108562464
127	NC_008086	ATCA	2	8	41490	41497	50 %	25 %	0 %	25 %	108562464
128	NC_008086	TCAA	2	8	41503	41510	50 %	25 %	0 %	25 %	108562464
129	NC_008086	TATT	2	8	41569	41576	25 %	75 %	0 %	0 %	108562464
130	NC_008086	TGAG	2	8	42007	42014	25 %	25 %	50 %	0 %	108562465
131	NC_008086	GATT	2	8	42095	42102	25 %	50 %	25 %	0 %	108562465
132	NC_008086	TGTT	2	8	42277	42284	0 %	75 %	25 %	0 %	108562465
133	NC_008086	GGCG	2	8	42290	42297	0 %	0 %	75 %	25 %	108562465
134	NC_008086	AAAT	2	8	42745	42752	75 %	25 %	0 %	0 %	108562465
135	NC_008086	CTTT	2	8	42870	42877	0 %	75 %	0 %	25 %	108562465
136	NC_008086	GAGC	2	8	42896	42903	25 %	0 %	50 %	25 %	108562465
137	NC_008086	GAAA	2	8	43159	43166	75 %	0 %	25 %	0 %	108562466
138	NC_008086	GATC	2	8	43288	43295	25 %	25 %	25 %	25 %	108562466
139	NC_008086	ATGA	2	8	44295	44302	50 %	25 %	25 %	0 %	108562466
140	NC_008086	AACG	2	8	44687	44694	50 %	0 %	25 %	25 %	108562467
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142	NC_008086	CAAA	2	8	45319	45326	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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