MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 16117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	CAT	2	6	19	24	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008086	ATT	2	6	202	207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008086	CCT	2	6	268	273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008086	GTT	2	6	367	372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008086	CTT	2	6	537	542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
6	NC_008086	CAA	2	6	761	766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108562425
7	NC_008086	CGC	2	6	819	824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562425
8	NC_008086	CTT	2	6	890	895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
9	NC_008086	CAT	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562425
10	NC_008086	TTC	2	6	906	911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
11	NC_008086	CTT	2	6	916	921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
12	NC_008086	TTG	2	6	973	978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562425
13	NC_008086	ATC	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562425
14	NC_008086	ATT	2	6	1275	1280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008086	TTA	2	6	1301	1306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008086	AAT	2	6	1480	1485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008086	GAT	3	9	1640	1648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562426
18	NC_008086	GTT	2	6	1823	1828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562426
19	NC_008086	TTC	2	6	1874	1879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562426
20	NC_008086	ACA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108562426
21	NC_008086	AAT	2	6	1975	1980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562427
22	NC_008086	CTT	2	6	2318	2323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562427
23	NC_008086	TGA	2	6	2336	2341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562427
24	NC_008086	TCA	2	6	2476	2481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562428
25	NC_008086	CCG	4	12	2561	2572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562428
26	NC_008086	CCA	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108562428
27	NC_008086	GCT	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108562428
28	NC_008086	CTA	2	6	2797	2802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562428
29	NC_008086	ATA	2	6	2878	2883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562428
30	NC_008086	GGC	2	6	2921	2926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108562428
31	NC_008086	GCC	2	6	2965	2970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562428
32	NC_008086	GTT	2	6	3141	3146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562428
33	NC_008086	CTT	2	6	3175	3180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562428
34	NC_008086	TTC	2	6	3280	3285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562429
35	NC_008086	GTT	2	6	3415	3420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562429
36	NC_008086	CTT	2	6	3504	3509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562429
37	NC_008086	TGG	2	6	3561	3566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562429
38	NC_008086	TCA	3	9	3569	3577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562429
39	NC_008086	AAT	2	6	3622	3627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562429
40	NC_008086	TAG	2	6	3675	3680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562429
41	NC_008086	AGC	2	6	4296	4301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108562430
42	NC_008086	GTG	2	6	4485	4490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562430
43	NC_008086	AGA	2	6	4583	4588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562430
44	NC_008086	GCC	2	6	4651	4656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562430
45	NC_008086	TGC	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108562431
46	NC_008086	GAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562431
47	NC_008086	GTT	2	6	5097	5102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562431
48	NC_008086	ATC	2	6	5181	5186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562431
49	NC_008086	ATT	2	6	5425	5430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562431
50	NC_008086	GGC	2	6	5498	5503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108562431
51	NC_008086	GGT	2	6	5604	5609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008086	TAT	2	6	5652	5657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008086	TGG	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008086	TGG	2	6	5825	5830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008086	GTG	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008086	ACC	2	6	5973	5978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008086	GGT	2	6	5986	5991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008086	AAT	2	6	6146	6151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562433
59	NC_008086	TTA	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008086	TGT	2	6	6421	6426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008086	AAG	2	6	6566	6571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008086	TAG	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562434
63	NC_008086	TGC	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108562434
64	NC_008086	ATT	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562434
65	NC_008086	TGG	2	6	6927	6932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562434
66	NC_008086	TCT	2	6	7066	7071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562434
67	NC_008086	GTT	2	6	7129	7134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
68	NC_008086	TAA	2	6	7198	7203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562434
69	NC_008086	TTA	2	6	7256	7261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562434
70	NC_008086	GTG	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562434
71	NC_008086	GTT	2	6	7345	7350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
72	NC_008086	TGT	2	6	7446	7451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
73	NC_008086	GGT	2	6	7456	7461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562434
74	NC_008086	CAG	2	6	7677	7682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108562434
75	NC_008086	GTT	2	6	7729	7734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
76	NC_008086	CTT	2	6	7923	7928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562434
77	NC_008086	GTT	2	6	7945	7950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
78	NC_008086	AGT	5	15	7951	7965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562434
79	NC_008086	GTT	2	6	7994	7999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
80	NC_008086	TTG	2	6	8065	8070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
81	NC_008086	GTT	2	6	8134	8139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
82	NC_008086	TTG	2	6	8206	8211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
83	NC_008086	CCG	2	6	8268	8273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562434
84	NC_008086	GTT	2	6	8413	8418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
85	NC_008086	GGT	2	6	8750	8755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008086	TGT	2	6	8821	8826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008086	AAG	2	6	8869	8874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008086	CAT	2	6	8917	8922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562435
89	NC_008086	TCT	2	6	8984	8989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562435
90	NC_008086	AAT	2	6	9082	9087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562435
91	NC_008086	CTT	2	6	9090	9095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562435
92	NC_008086	CAT	2	6	9180	9185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562435
93	NC_008086	ATG	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562435
94	NC_008086	TCA	2	6	9257	9262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562435
95	NC_008086	CCG	2	6	9311	9316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562435
96	NC_008086	CTT	2	6	9330	9335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562435
97	NC_008086	CCG	2	6	9339	9344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562435
98	NC_008086	CAT	2	6	9363	9368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562435
99	NC_008086	CAT	2	6	9534	9539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562435
100	NC_008086	GTG	2	6	9566	9571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562435
101	NC_008086	TTC	2	6	9646	9651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562435
102	NC_008086	TAA	2	6	9654	9659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562435
103	NC_008086	CCG	2	6	9665	9670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562435
104	NC_008086	CAC	2	6	9766	9771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108562435
105	NC_008086	GAT	2	6	9808	9813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562435
106	NC_008086	AAT	2	6	9848	9853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562435
107	NC_008086	CTT	2	6	10020	10025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562435
108	NC_008086	TCT	2	6	10130	10135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562435
109	NC_008086	GCA	2	6	10304	10309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108562435
110	NC_008086	CTT	2	6	10329	10334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562435
111	NC_008086	TAA	3	9	10565	10573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008086	TCT	2	6	10685	10690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562436
113	NC_008086	CTT	2	6	10767	10772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562436
114	NC_008086	GAT	3	9	10855	10863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562436
115	NC_008086	TCT	2	6	10883	10888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562436
116	NC_008086	CTA	2	6	10899	10904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562436
117	NC_008086	TTA	2	6	10986	10991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008086	ATA	3	9	11045	11053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008086	ATT	2	6	11065	11070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008086	TTA	2	6	11129	11134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008086	ACA	2	6	11187	11192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008086	TTG	2	6	11326	11331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562437
123	NC_008086	GAA	2	6	11342	11347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562437
124	NC_008086	TTA	2	6	11521	11526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562437
125	NC_008086	AGA	2	6	11536	11541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562437
126	NC_008086	ACC	2	6	11544	11549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108562437
127	NC_008086	AAG	2	6	11577	11582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562437
128	NC_008086	ATT	2	6	11610	11615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562437
129	NC_008086	CAT	2	6	11791	11796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562437
130	NC_008086	GTG	2	6	11825	11830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562437
131	NC_008086	ATG	2	6	12105	12110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562437
132	NC_008086	AAC	2	6	12197	12202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108562437
133	NC_008086	AGA	2	6	12583	12588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562437
134	NC_008086	TTG	2	6	12596	12601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562437
135	NC_008086	GAC	2	6	12683	12688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108562437
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137	NC_008086	TTG	2	6	12761	12766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562437
138	NC_008086	TGT	2	6	12947	12952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562438
139	NC_008086	TGT	2	6	13115	13120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562438
140	NC_008086	AAG	2	6	13274	13279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562438
141	NC_008086	TTG	2	6	13451	13456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562438
142	NC_008086	TGG	3	9	13685	13693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562438
143	NC_008086	GAA	3	9	13702	13710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562438
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145	NC_008086	AGG	2	6	14028	14033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008086	TTA	2	6	14114	14119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562439
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148	NC_008086	GTT	2	6	14198	14203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562439
149	NC_008086	ATT	2	6	14221	14226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562439
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154	NC_008086	AGA	3	9	14799	14807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562439
155	NC_008086	ATA	2	6	14963	14968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008086	GTG	2	6	15223	15228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562440
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160	NC_008086	AAC	2	6	15646	15651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108562442
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175	NC_008086	GTG	3	9	17557	17565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562442
176	NC_008086	CTG	2	6	17991	17996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_008086	TAT	2	6	18248	18253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562443
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