MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 1231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	CAT	2	6	19	24	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008086	ATT	2	6	202	207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008086	CCT	2	6	268	273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008086	GTT	2	6	367	372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008086	ATT	2	6	1275	1280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008086	TTA	2	6	1301	1306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008086	AAT	2	6	1480	1485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008086	GGT	2	6	5604	5609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008086	TAT	2	6	5652	5657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008086	TGG	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008086	TGG	2	6	5825	5830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008086	GTG	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008086	ACC	2	6	5973	5978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008086	GGT	2	6	5986	5991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008086	TTA	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008086	TGT	2	6	6421	6426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008086	AAG	2	6	6566	6571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008086	GGT	2	6	8750	8755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008086	TGT	2	6	8821	8826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008086	AAG	2	6	8869	8874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008086	TAA	3	9	10565	10573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008086	TTA	2	6	10986	10991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008086	ATA	3	9	11045	11053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008086	ATT	2	6	11065	11070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008086	TTA	2	6	11129	11134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008086	ACA	2	6	11187	11192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008086	AGG	2	6	14028	14033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008086	ATA	2	6	14963	14968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008086	CTG	2	6	17991	17996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008086	GGT	2	6	24085	24090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008086	TGT	2	6	24118	24123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008086	TCA	2	6	24130	24135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008086	TAT	2	6	24230	24235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008086	TGA	2	6	24275	24280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008086	GAG	2	6	24546	24551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008086	CTT	2	6	26692	26697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008086	GTT	2	6	26906	26911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008086	TGT	2	6	26964	26969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008086	TTA	2	6	27097	27102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008086	ATC	2	6	27171	27176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008086	TAA	2	6	41673	41678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008086	ATC	2	6	45387	45392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008086	TGT	2	6	45447	45452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008086	TAG	2	6	45477	45482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008086	AAC	2	6	49801	49806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008086	AAG	2	6	53527	53532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008086	GTT	2	6	53553	53558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008086	ATA	2	6	59457	59462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008086	AAC	2	6	59494	59499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008086	TCT	2	6	59764	59769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008086	AAG	2	6	59831	59836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008086	AAG	2	6	59840	59845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008086	ACA	2	6	73041	73046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008086	TTG	2	6	73068	73073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008086	ATT	3	9	75748	75756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008086	TTA	2	6	75799	75804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008086	TGG	2	6	75884	75889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008086	CTT	2	6	78161	78166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008086	TTG	2	6	78225	78230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008086	TAT	2	6	78250	78255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008086	TCT	2	6	81719	81724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008086	AAG	2	6	81829	81834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008086	ATT	2	6	86172	86177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008086	ATT	2	6	86182	86187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008086	TAA	2	6	86197	86202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008086	TAT	2	6	87128	87133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008086	TTA	2	6	92577	92582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008086	TCA	2	6	92588	92593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008086	CCA	2	6	92630	92635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008086	TTA	2	6	94320	94325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008086	TTA	2	6	99262	99267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008086	TTA	2	6	100035	100040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008086	TTA	2	6	100069	100074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008086	CTT	2	6	101566	101571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008086	TCA	2	6	101740	101745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008086	GTT	2	6	108364	108369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008086	ATA	2	6	108442	108447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008086	ATT	2	6	110238	110243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008086	ATA	2	6	110249	110254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008086	GAT	2	6	110268	110273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008086	AAC	2	6	110365	110370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008086	TGA	2	6	112034	112039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008086	TCC	2	6	112963	112968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_008086	AAC	2	6	113645	113650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008086	TGA	2	6	113806	113811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008086	AAG	2	6	113856	113861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008086	TGA	2	6	117178	117183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008086	TAA	2	6	117213	117218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008086	TTA	2	6	121990	121995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008086	TCC	2	6	125136	125141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_008086	TTA	2	6	125199	125204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008086	TTA	2	6	126531	126536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008086	GTA	2	6	126539	126544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008086	CAA	2	6	126628	126633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008086	TAA	2	6	126691	126696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008086	TAA	2	6	130580	130585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008086	TAA	2	6	130636	130641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008086	TAG	2	6	134119	134124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008086	ATT	2	6	135230	135235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008086	GAT	2	6	135336	135341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008086	GGT	2	6	136122	136127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008086	AGA	2	6	136139	136144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008086	GAA	2	6	136168	136173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008086	TTG	2	6	136186	136191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008086	ACC	2	6	137213	137218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008086	TAC	2	6	137528	137533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008086	TAA	2	6	140434	140439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008086	TAA	2	6	140455	140460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008086	ATA	2	6	141834	141839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008086	AAT	2	6	141987	141992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008086	TGA	2	6	142024	142029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008086	ATT	2	6	142095	142100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008086	ATT	2	6	145024	145029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008086	ATA	2	6	145822	145827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008086	ATT	2	6	145981	145986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008086	TAG	2	6	151833	151838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008086	TTA	2	6	151876	151881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008086	TTG	2	6	151951	151956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008086	TAC	2	6	151961	151966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008086	GTA	2	6	155521	155526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008086	TAA	2	6	156844	156849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008086	TAT	2	6	158515	158520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008086	GTT	2	6	164389	164394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008086	TAA	2	6	164462	164467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008086	ATA	2	6	165607	165612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008086	CTT	2	6	165685	165690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008086	CAC	2	6	165758	165763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_008086	TTG	2	6	165955	165960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008086	TTA	2	6	169060	169065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008086	TAT	2	6	169833	169838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008086	TTA	2	6	169891	169896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008086	AAT	2	6	176797	176802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008086	AAT	2	6	176838	176843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008086	ATT	2	6	176948	176953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008086	ACA	2	6	176954	176959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008086	ATG	2	6	177086	177091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008086	AAC	2	6	177112	177117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008086	TGA	2	6	178022	178027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008086	GTT	2	6	178031	178036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008086	CAA	2	6	178962	178967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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