MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 14886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	CTT	2	6	537	542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
2	NC_008086	CAA	2	6	761	766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108562425
3	NC_008086	CGC	2	6	819	824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562425
4	NC_008086	CTT	2	6	890	895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
5	NC_008086	CAT	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562425
6	NC_008086	TTC	2	6	906	911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
7	NC_008086	CTT	2	6	916	921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
8	NC_008086	TTG	2	6	973	978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562425
9	NC_008086	ATC	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562425
10	NC_008086	GAT	3	9	1640	1648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562426
11	NC_008086	GTT	2	6	1823	1828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562426
12	NC_008086	TTC	2	6	1874	1879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562426
13	NC_008086	ACA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108562426
14	NC_008086	AAT	2	6	1975	1980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562427
15	NC_008086	CTT	2	6	2318	2323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562427
16	NC_008086	TGA	2	6	2336	2341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562427
17	NC_008086	TCA	2	6	2476	2481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562428
18	NC_008086	CCG	4	12	2561	2572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562428
19	NC_008086	CCA	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108562428
20	NC_008086	GCT	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108562428
21	NC_008086	CTA	2	6	2797	2802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562428
22	NC_008086	ATA	2	6	2878	2883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562428
23	NC_008086	GGC	2	6	2921	2926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108562428
24	NC_008086	GCC	2	6	2965	2970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562428
25	NC_008086	GTT	2	6	3141	3146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562428
26	NC_008086	CTT	2	6	3175	3180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562428
27	NC_008086	TTC	2	6	3280	3285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562429
28	NC_008086	GTT	2	6	3415	3420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562429
29	NC_008086	CTT	2	6	3504	3509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562429
30	NC_008086	TGG	2	6	3561	3566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562429
31	NC_008086	TCA	3	9	3569	3577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562429
32	NC_008086	AAT	2	6	3622	3627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562429
33	NC_008086	TAG	2	6	3675	3680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562429
34	NC_008086	AGC	2	6	4296	4301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108562430
35	NC_008086	GTG	2	6	4485	4490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562430
36	NC_008086	AGA	2	6	4583	4588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562430
37	NC_008086	GCC	2	6	4651	4656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562430
38	NC_008086	TGC	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108562431
39	NC_008086	GAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562431
40	NC_008086	GTT	2	6	5097	5102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562431
41	NC_008086	ATC	2	6	5181	5186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562431
42	NC_008086	ATT	2	6	5425	5430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562431
43	NC_008086	GGC	2	6	5498	5503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108562431
44	NC_008086	AAT	2	6	6146	6151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562433
45	NC_008086	TAG	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562434
46	NC_008086	TGC	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108562434
47	NC_008086	ATT	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562434
48	NC_008086	TGG	2	6	6927	6932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562434
49	NC_008086	TCT	2	6	7066	7071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562434
50	NC_008086	GTT	2	6	7129	7134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
51	NC_008086	TAA	2	6	7198	7203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562434
52	NC_008086	TTA	2	6	7256	7261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562434
53	NC_008086	GTG	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562434
54	NC_008086	GTT	2	6	7345	7350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
55	NC_008086	TGT	2	6	7446	7451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
56	NC_008086	GGT	2	6	7456	7461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562434
57	NC_008086	CAG	2	6	7677	7682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108562434
58	NC_008086	GTT	2	6	7729	7734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
59	NC_008086	CTT	2	6	7923	7928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562434
60	NC_008086	GTT	2	6	7945	7950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
61	NC_008086	AGT	5	15	7951	7965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562434
62	NC_008086	GTT	2	6	7994	7999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
63	NC_008086	TTG	2	6	8065	8070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
64	NC_008086	GTT	2	6	8134	8139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
65	NC_008086	TTG	2	6	8206	8211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
66	NC_008086	CCG	2	6	8268	8273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562434
67	NC_008086	GTT	2	6	8413	8418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
68	NC_008086	CAT	2	6	8917	8922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562435
69	NC_008086	TCT	2	6	8984	8989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562435
70	NC_008086	AAT	2	6	9082	9087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562435
71	NC_008086	CTT	2	6	9090	9095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562435
72	NC_008086	CAT	2	6	9180	9185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562435
73	NC_008086	ATG	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562435
74	NC_008086	TCA	2	6	9257	9262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562435
75	NC_008086	CCG	2	6	9311	9316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562435
76	NC_008086	CTT	2	6	9330	9335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562435
77	NC_008086	CCG	2	6	9339	9344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562435
78	NC_008086	CAT	2	6	9363	9368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562435
79	NC_008086	CAT	2	6	9534	9539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562435
80	NC_008086	GTG	2	6	9566	9571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562435
81	NC_008086	TTC	2	6	9646	9651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562435
82	NC_008086	TAA	2	6	9654	9659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562435
83	NC_008086	CCG	2	6	9665	9670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562435
84	NC_008086	CAC	2	6	9766	9771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108562435
85	NC_008086	GAT	2	6	9808	9813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562435
86	NC_008086	AAT	2	6	9848	9853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562435
87	NC_008086	CTT	2	6	10020	10025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562435
88	NC_008086	TCT	2	6	10130	10135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562435
89	NC_008086	GCA	2	6	10304	10309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108562435
90	NC_008086	CTT	2	6	10329	10334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562435
91	NC_008086	TCT	2	6	10685	10690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562436
92	NC_008086	CTT	2	6	10767	10772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562436
93	NC_008086	GAT	3	9	10855	10863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562436
94	NC_008086	TCT	2	6	10883	10888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562436
95	NC_008086	CTA	2	6	10899	10904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562436
96	NC_008086	TTG	2	6	11326	11331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562437
97	NC_008086	GAA	2	6	11342	11347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562437
98	NC_008086	TTA	2	6	11521	11526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562437
99	NC_008086	AGA	2	6	11536	11541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562437
100	NC_008086	ACC	2	6	11544	11549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108562437
101	NC_008086	AAG	2	6	11577	11582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562437
102	NC_008086	ATT	2	6	11610	11615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562437
103	NC_008086	CAT	2	6	11791	11796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562437
104	NC_008086	GTG	2	6	11825	11830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562437
105	NC_008086	ATG	2	6	12105	12110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562437
106	NC_008086	AAC	2	6	12197	12202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108562437
107	NC_008086	AGA	2	6	12583	12588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562437
108	NC_008086	TTG	2	6	12596	12601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562437
109	NC_008086	GAC	2	6	12683	12688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108562437
110	NC_008086	TTA	3	9	12704	12712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562437
111	NC_008086	TTG	2	6	12761	12766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562437
112	NC_008086	TGT	2	6	12947	12952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562438
113	NC_008086	TGT	2	6	13115	13120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562438
114	NC_008086	AAG	2	6	13274	13279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562438
115	NC_008086	TTG	2	6	13451	13456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562438
116	NC_008086	TGG	3	9	13685	13693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562438
117	NC_008086	GAA	3	9	13702	13710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562438
118	NC_008086	AGA	2	6	13806	13811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562438
119	NC_008086	TTA	2	6	14114	14119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562439
120	NC_008086	GAA	2	6	14131	14136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562439
121	NC_008086	GTT	2	6	14198	14203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562439
122	NC_008086	ATT	2	6	14221	14226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562439
123	NC_008086	CGC	2	6	14373	14378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562439
124	NC_008086	AAT	2	6	14503	14508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562439
125	NC_008086	ACC	2	6	14597	14602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108562439
126	NC_008086	GGT	2	6	14739	14744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562439
127	NC_008086	AGA	3	9	14799	14807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562439
128	NC_008086	GTG	2	6	15223	15228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562440
129	NC_008086	GAA	2	6	15314	15319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562441
130	NC_008086	ATT	2	6	15501	15506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562441
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