MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 2189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	AC	3	6	60	65	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008086	CA	3	6	76	81	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008086	CA	3	6	1000	1005	50 %	0 %	0 %	50 %	108562425
4	NC_008086	CT	3	6	2209	2214	0 %	50 %	0 %	50 %	108562427
5	NC_008086	CA	3	6	2744	2749	50 %	0 %	0 %	50 %	108562428
6	NC_008086	CT	3	6	3079	3084	0 %	50 %	0 %	50 %	108562428
7	NC_008086	GC	3	6	4309	4314	0 %	0 %	50 %	50 %	108562430
8	NC_008086	AG	3	6	4466	4471	50 %	0 %	50 %	0 %	108562430
9	NC_008086	TG	3	6	4948	4953	0 %	50 %	50 %	0 %	108562431
10	NC_008086	GC	3	6	7387	7392	0 %	0 %	50 %	50 %	108562434
11	NC_008086	AC	3	6	7816	7821	50 %	0 %	0 %	50 %	108562434
12	NC_008086	GA	8	16	8569	8584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008086	GC	3	6	9227	9232	0 %	0 %	50 %	50 %	108562435
14	NC_008086	CG	3	6	9292	9297	0 %	0 %	50 %	50 %	108562435
15	NC_008086	AG	3	6	9439	9444	50 %	0 %	50 %	0 %	108562435
16	NC_008086	AG	3	6	11638	11643	50 %	0 %	50 %	0 %	108562437
17	NC_008086	AG	3	6	12455	12460	50 %	0 %	50 %	0 %	108562437
18	NC_008086	AG	3	6	13033	13038	50 %	0 %	50 %	0 %	108562438
19	NC_008086	AG	3	6	13093	13098	50 %	0 %	50 %	0 %	108562438
20	NC_008086	AG	3	6	13920	13925	50 %	0 %	50 %	0 %	108562438
21	NC_008086	GA	3	6	14099	14104	50 %	0 %	50 %	0 %	108562439
22	NC_008086	TG	3	6	15171	15176	0 %	50 %	50 %	0 %	108562440
23	NC_008086	GC	3	6	15814	15819	0 %	0 %	50 %	50 %	108562442
24	NC_008086	GC	3	6	15950	15955	0 %	0 %	50 %	50 %	108562442
25	NC_008086	TC	3	6	15991	15996	0 %	50 %	0 %	50 %	108562442
26	NC_008086	CT	3	6	16030	16035	0 %	50 %	0 %	50 %	108562442
27	NC_008086	AG	4	8	16416	16423	50 %	0 %	50 %	0 %	108562442
28	NC_008086	CA	3	6	17970	17975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008086	GC	3	6	18478	18483	0 %	0 %	50 %	50 %	108562443
30	NC_008086	CG	3	6	18584	18589	0 %	0 %	50 %	50 %	108562443
31	NC_008086	AG	3	6	19861	19866	50 %	0 %	50 %	0 %	108562444
32	NC_008086	AG	3	6	20660	20665	50 %	0 %	50 %	0 %	108562445
33	NC_008086	GA	3	6	20851	20856	50 %	0 %	50 %	0 %	108562445
34	NC_008086	CT	3	6	21049	21054	0 %	50 %	0 %	50 %	108562445
35	NC_008086	GC	3	6	22242	22247	0 %	0 %	50 %	50 %	108562446
36	NC_008086	AG	3	6	23351	23356	50 %	0 %	50 %	0 %	108562447
37	NC_008086	AC	3	6	23994	23999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008086	GC	3	6	24737	24742	0 %	0 %	50 %	50 %	108562448
39	NC_008086	AG	3	6	25332	25337	50 %	0 %	50 %	0 %	108562448
40	NC_008086	TC	3	6	25484	25489	0 %	50 %	0 %	50 %	108562448
41	NC_008086	GT	3	6	26243	26248	0 %	50 %	50 %	0 %	108562448
42	NC_008086	AG	3	6	27005	27010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008086	GC	3	6	27517	27522	0 %	0 %	50 %	50 %	108562449
44	NC_008086	GC	3	6	27912	27917	0 %	0 %	50 %	50 %	108562449
45	NC_008086	AG	3	6	28080	28085	50 %	0 %	50 %	0 %	108562449
46	NC_008086	CA	3	6	28231	28236	50 %	0 %	0 %	50 %	108562449
47	NC_008086	TA	3	6	28641	28646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008086	TG	3	6	29100	29105	0 %	50 %	50 %	0 %	108562450
49	NC_008086	AG	3	6	29340	29345	50 %	0 %	50 %	0 %	108562450
50	NC_008086	AG	3	6	30450	30455	50 %	0 %	50 %	0 %	108562451
51	NC_008086	TC	3	6	31903	31908	0 %	50 %	0 %	50 %	108562453
52	NC_008086	GA	3	6	31942	31947	50 %	0 %	50 %	0 %	108562453
53	NC_008086	CT	3	6	32449	32454	0 %	50 %	0 %	50 %	108562453
54	NC_008086	AG	3	6	33702	33707	50 %	0 %	50 %	0 %	108562455
55	NC_008086	AT	3	6	34632	34637	50 %	50 %	0 %	0 %	108562456
56	NC_008086	GA	3	6	35806	35811	50 %	0 %	50 %	0 %	108562456
57	NC_008086	CA	3	6	35944	35949	50 %	0 %	0 %	50 %	108562456
58	NC_008086	AG	3	6	36078	36083	50 %	0 %	50 %	0 %	108562457
59	NC_008086	CA	3	6	36259	36264	50 %	0 %	0 %	50 %	108562457
60	NC_008086	GC	3	6	36841	36846	0 %	0 %	50 %	50 %	108562459
61	NC_008086	GC	3	6	37808	37813	0 %	0 %	50 %	50 %	108562460
62	NC_008086	CT	3	6	37939	37944	0 %	50 %	0 %	50 %	108562460
63	NC_008086	TG	3	6	38052	38057	0 %	50 %	50 %	0 %	108562460
64	NC_008086	TG	3	6	38136	38141	0 %	50 %	50 %	0 %	108562460
65	NC_008086	GA	3	6	39166	39171	50 %	0 %	50 %	0 %	108562462
66	NC_008086	CT	3	6	40280	40285	0 %	50 %	0 %	50 %	108562463
67	NC_008086	CT	3	6	40352	40357	0 %	50 %	0 %	50 %	108562463
68	NC_008086	AG	3	6	41553	41558	50 %	0 %	50 %	0 %	108562464
69	NC_008086	AG	3	6	41610	41615	50 %	0 %	50 %	0 %	108562464
70	NC_008086	AG	3	6	41693	41698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008086	TG	3	6	41876	41881	0 %	50 %	50 %	0 %	108562465
72	NC_008086	AG	3	6	41957	41962	50 %	0 %	50 %	0 %	108562465
73	NC_008086	AG	3	6	42599	42604	50 %	0 %	50 %	0 %	108562465
74	NC_008086	AG	3	6	43676	43681	50 %	0 %	50 %	0 %	108562466
75	NC_008086	AG	3	6	44654	44659	50 %	0 %	50 %	0 %	108562467
76	NC_008086	CT	3	6	44715	44720	0 %	50 %	0 %	50 %	108562467
77	NC_008086	GA	3	6	44918	44923	50 %	0 %	50 %	0 %	108562467
78	NC_008086	AC	3	6	46851	46856	50 %	0 %	0 %	50 %	108562469
79	NC_008086	TG	4	8	47750	47757	0 %	50 %	50 %	0 %	108562469
80	NC_008086	AG	3	6	48140	48145	50 %	0 %	50 %	0 %	108562469
81	NC_008086	GT	3	6	48876	48881	0 %	50 %	50 %	0 %	108562470
82	NC_008086	TG	3	6	49981	49986	0 %	50 %	50 %	0 %	108562471
83	NC_008086	GT	3	6	50741	50746	0 %	50 %	50 %	0 %	108562472
84	NC_008086	CT	4	8	51103	51110	0 %	50 %	0 %	50 %	108562472
85	NC_008086	TA	3	6	51282	51287	50 %	50 %	0 %	0 %	108562472
86	NC_008086	AT	4	8	52558	52565	50 %	50 %	0 %	0 %	108562473
87	NC_008086	TC	3	6	52654	52659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008086	AT	3	6	52762	52767	50 %	50 %	0 %	0 %	108562474
89	NC_008086	TC	3	6	53343	53348	0 %	50 %	0 %	50 %	108562475
90	NC_008086	AC	3	6	54745	54750	50 %	0 %	0 %	50 %	108562477
91	NC_008086	CG	3	6	55887	55892	0 %	0 %	50 %	50 %	108562478
92	NC_008086	GT	3	6	55906	55911	0 %	50 %	50 %	0 %	108562478
93	NC_008086	TC	3	6	59726	59731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008086	AG	3	6	60172	60177	50 %	0 %	50 %	0 %	108562481
95	NC_008086	TC	3	6	60560	60565	0 %	50 %	0 %	50 %	108562482
96	NC_008086	AG	3	6	61218	61223	50 %	0 %	50 %	0 %	108562482
97	NC_008086	GC	3	6	61832	61837	0 %	0 %	50 %	50 %	108562483
98	NC_008086	CT	3	6	61937	61942	0 %	50 %	0 %	50 %	108562483
99	NC_008086	AG	4	8	62366	62373	50 %	0 %	50 %	0 %	108562483
100	NC_008086	GC	3	6	62815	62820	0 %	0 %	50 %	50 %	108562484
101	NC_008086	CT	3	6	63394	63399	0 %	50 %	0 %	50 %	108562484
102	NC_008086	GA	4	8	63439	63446	50 %	0 %	50 %	0 %	108562484
103	NC_008086	AG	4	8	64457	64464	50 %	0 %	50 %	0 %	108562487
104	NC_008086	AG	3	6	64546	64551	50 %	0 %	50 %	0 %	108562487
105	NC_008086	GA	3	6	64828	64833	50 %	0 %	50 %	0 %	108562488
106	NC_008086	AG	3	6	65476	65481	50 %	0 %	50 %	0 %	108562488
107	NC_008086	AG	3	6	65618	65623	50 %	0 %	50 %	0 %	108562488
108	NC_008086	AG	3	6	65918	65923	50 %	0 %	50 %	0 %	108562488
109	NC_008086	GA	3	6	66316	66321	50 %	0 %	50 %	0 %	108562488
110	NC_008086	AG	3	6	66579	66584	50 %	0 %	50 %	0 %	108562489
111	NC_008086	AG	3	6	67202	67207	50 %	0 %	50 %	0 %	108562491
112	NC_008086	TA	3	6	67416	67421	50 %	50 %	0 %	0 %	108562491
113	NC_008086	GT	3	6	68132	68137	0 %	50 %	50 %	0 %	108562492
114	NC_008086	AG	3	6	68539	68544	50 %	0 %	50 %	0 %	108562492
115	NC_008086	AG	3	6	69875	69880	50 %	0 %	50 %	0 %	108562493
116	NC_008086	CT	3	6	70934	70939	0 %	50 %	0 %	50 %	108562494
117	NC_008086	AG	3	6	71663	71668	50 %	0 %	50 %	0 %	108562495
118	NC_008086	GA	4	8	72249	72256	50 %	0 %	50 %	0 %	108562496
119	NC_008086	AG	3	6	73158	73163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008086	TG	3	6	74168	74173	0 %	50 %	50 %	0 %	108562498
121	NC_008086	TG	4	8	74506	74513	0 %	50 %	50 %	0 %	108562498
122	NC_008086	GC	3	6	76728	76733	0 %	0 %	50 %	50 %	108562501
123	NC_008086	CA	3	6	76746	76751	50 %	0 %	0 %	50 %	108562501
124	NC_008086	CG	3	6	77080	77085	0 %	0 %	50 %	50 %	108562501
125	NC_008086	GC	3	6	79087	79092	0 %	0 %	50 %	50 %	108562503
126	NC_008086	TA	5	10	79485	79494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008086	GT	3	6	79776	79781	0 %	50 %	50 %	0 %	108562504
128	NC_008086	CT	3	6	80710	80715	0 %	50 %	0 %	50 %	108562505
129	NC_008086	GA	3	6	81452	81457	50 %	0 %	50 %	0 %	108562505
130	NC_008086	TC	3	6	81742	81747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008086	GA	3	6	83012	83017	50 %	0 %	50 %	0 %	108562506
132	NC_008086	GA	3	6	84516	84521	50 %	0 %	50 %	0 %	108562508
133	NC_008086	GC	3	6	85599	85604	0 %	0 %	50 %	50 %	108562508
134	NC_008086	AG	3	6	85864	85869	50 %	0 %	50 %	0 %	108562508
135	NC_008086	CA	3	6	86091	86096	50 %	0 %	0 %	50 %	108562508
136	NC_008086	AG	3	6	86207	86212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008086	AG	3	6	86232	86237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008086	AG	3	6	87863	87868	50 %	0 %	50 %	0 %	108562512
139	NC_008086	TG	3	6	89228	89233	0 %	50 %	50 %	0 %	108562513
140	NC_008086	TC	3	6	89590	89595	0 %	50 %	0 %	50 %	108562513
141	NC_008086	GT	3	6	89639	89644	0 %	50 %	50 %	0 %	108562513
142	NC_008086	CT	3	6	90199	90204	0 %	50 %	0 %	50 %	108562513
143	NC_008086	CT	3	6	91141	91146	0 %	50 %	0 %	50 %	108562514
144	NC_008086	CT	3	6	92319	92324	0 %	50 %	0 %	50 %	108562514
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