MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia AU 1054 chromosome 3

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008062	TGCCG	2	10	9690	9699	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_008062	AGCCG	2	10	22202	22211	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_008062	ATCGA	2	10	27954	27963	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008062	CATTG	2	10	31603	31612	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008062	AATTC	2	10	45006	45015	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008062	CATTG	2	10	46192	46201	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008062	CACGG	2	10	55271	55280	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_008062	CAAAA	2	10	62020	62029	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008062	AAGGA	2	10	63106	63115	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008062	GATCG	2	10	76426	76435	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008062	GCGCC	2	10	76762	76771	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_008062	TGCGC	2	10	84696	84705	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008062	TGCCG	2	10	84766	84775	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_008062	GCGTG	2	10	90831	90840	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008062	CATCC	2	10	98831	98840	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_008062	CCGCG	2	10	112542	112551	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_008062	CATCG	2	10	112573	112582	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_008062	GGGCC	2	10	117316	117325	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008062	GCCCG	2	10	123666	123675	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_008062	GGCGC	2	10	128386	128395	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008062	GGCGC	2	10	136942	136951	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008062	GCCGC	2	10	142977	142986	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_008062	TGACG	2	10	151556	151565	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008062	ATTGG	2	10	160647	160656	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008062	TGATT	2	10	162350	162359	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008062	TCGCA	2	10	163350	163359	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_008062	GCCGC	3	15	167323	167337	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_008062	CGCGC	2	10	168919	168928	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_008062	CAACT	2	10	178068	178077	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_008062	TCCGC	2	10	199532	199541	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_008062	TCGCG	2	10	199579	199588	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_008062	GATGC	2	10	203500	203509	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008062	TTCGA	2	10	208282	208291	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008062	CGGAC	2	10	217744	217753	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_008062	TGTCG	2	10	218278	218287	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008062	CGCGG	2	10	221512	221521	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_008062	CAGTG	2	10	223610	223619	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008062	CTCCC	2	10	231596	231605	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
39	NC_008062	GCCGC	2	10	232621	232630	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
40	NC_008062	CGATG	2	10	237758	237767	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008062	CCCGC	2	10	239358	239367	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
42	NC_008062	CAGCG	2	10	256387	256396	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_008062	GCGCG	2	10	259197	259206	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_008062	CGGTT	2	10	260840	260849	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008062	CGATC	2	10	278658	278667	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_008062	ATCGC	2	10	278771	278780	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_008062	CGGGC	2	10	279020	279029	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_008062	CGCGC	2	10	279044	279053	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_008062	AGAAA	2	10	283196	283205	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008062	TGCGA	2	10	283341	283350	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008062	TCGCG	2	10	302688	302697	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008062	GCGAC	2	10	312161	312170	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_008062	GCCGG	2	10	313279	313288	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_008062	GCCGC	2	10	319590	319599	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_008062	TCGGC	2	10	341822	341831	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_008062	CGCAC	2	10	345769	345778	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_008062	CACGC	2	10	360818	360827	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_008062	GCGAG	2	10	364348	364357	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008062	TGCGC	2	10	364607	364616	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_008062	CGACG	2	10	366233	366242	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_008062	AGGTC	2	10	366284	366293	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_008062	CGGGC	2	10	370578	370587	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_008062	TAGAG	2	10	374273	374282	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008062	CTCCC	2	10	375570	375579	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
65	NC_008062	CAGGG	2	10	382593	382602	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_008062	GGCCG	2	10	389528	389537	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_008062	CCCCG	2	10	397703	397712	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
68	NC_008062	CCGGT	2	10	407277	407286	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_008062	TGCCG	2	10	409594	409603	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_008062	CGGCC	2	10	410406	410415	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
71	NC_008062	CGGGC	2	10	410426	410435	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
72	NC_008062	TCGTG	2	10	419385	419394	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008062	GCGAA	2	10	420551	420560	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_008062	GGGAG	2	10	420869	420878	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008062	CTCAT	2	10	422868	422877	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_008062	AATGG	2	10	424262	424271	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008062	TATGG	2	10	424645	424654	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008062	CTGGA	2	10	427948	427957	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_008062	GGCAG	2	10	428000	428009	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_008062	TGGCT	2	10	436561	436570	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008062	CCGAT	2	10	437643	437652	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_008062	TTTGT	2	10	439646	439655	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008062	CAAAA	2	10	442120	442129	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_008062	AAGCC	2	10	443981	443990	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_008062	GGTGC	2	10	447466	447475	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008062	GCGCG	2	10	447551	447560	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_008062	GCCGC	2	10	465257	465266	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NC_008062	GGCCG	2	10	495572	495581	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_008062	CGCAG	2	10	500272	500281	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_008062	CGGGC	2	10	514744	514753	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_008062	AGCGC	2	10	517932	517941	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_008062	GCAGC	2	10	518027	518036	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_008062	CGTCG	2	10	518139	518148	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_008062	CGACC	2	10	537480	537489	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
95	NC_008062	CGGCG	2	10	541515	541524	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_008062	CGGCA	2	10	559770	559779	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_008062	GCATC	2	10	573876	573885	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_008062	GCTCG	2	10	586963	586972	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_008062	GATTT	2	10	590641	590650	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008062	CCGCG	2	10	592251	592260	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_008062	GCCAC	3	15	599803	599817	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_008062	GCCCG	3	15	599826	599840	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
103	NC_008062	GCGCC	2	10	608184	608193	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104	NC_008062	TTCTG	2	10	609898	609907	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008062	GCATG	2	10	609940	609949	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008062	TCCGC	2	10	610343	610352	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_008062	TCCGC	2	10	610638	610647	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_008062	TCCGC	2	10	610927	610936	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_008062	GCGGA	2	10	611018	611027	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_008062	TCCGC	2	10	611114	611123	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_008062	GGTCG	2	10	615947	615956	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008062	CGAGC	2	10	621303	621312	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_008062	TGATT	2	10	621364	621373	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008062	GATGC	2	10	627266	627275	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008062	GCGCC	2	10	633128	633137	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_008062	GCCGG	2	10	639483	639492	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
117	NC_008062	GAAAA	2	10	649434	649443	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008062	TCCGC	2	10	657152	657161	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_008062	CGGTC	2	10	657197	657206	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_008062	CGCGC	2	10	672194	672203	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_008062	TGATC	2	10	677855	677864	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_008062	CGAAC	2	10	682802	682811	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_008062	CGGTG	2	10	695972	695981	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008062	CCGCG	3	15	699239	699253	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_008062	GCGCC	2	10	702249	702258	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
126	NC_008062	ACCTC	2	10	703633	703642	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_008062	CATCG	2	10	709379	709388	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_008062	CTGAT	2	10	712581	712590	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008062	CGCTG	2	10	712696	712705	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_008062	CACGT	2	10	715113	715122	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_008062	TACCA	2	10	715301	715310	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_008062	GGCTG	2	10	718041	718050	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008062	GGGGT	2	10	718056	718065	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008062	CGCGG	2	10	718214	718223	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_008062	CGCGC	2	10	722252	722261	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_008062	GCGCG	2	10	722274	722283	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_008062	CGCGC	2	10	733836	733845	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_008062	TGGCG	2	10	751064	751073	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008062	CGGCG	2	10	751077	751086	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
140	NC_008062	TCCGC	2	10	757738	757747	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_008062	GCGGA	2	10	757827	757836	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008062	CGGTG	2	10	766383	766392	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_008062	TCGCG	2	10	771204	771213	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_008062	GCCGC	2	10	775149	775158	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
145	NC_008062	ATCGC	2	10	779231	779240	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_008062	CGGCG	2	10	781184	781193	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
147	NC_008062	GTTTT	2	10	785355	785364	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008062	CGTTT	2	10	788548	788557	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_008062	GGACA	2	10	799749	799758	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_008062	CGCGC	2	10	802881	802890	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
151	NC_008062	GAAAA	2	10	804679	804688	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008062	GCGGG	2	10	804991	805000	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
153	NC_008062	CGTCG	2	10	814781	814790	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
154	NC_008062	GCGCG	2	10	819205	819214	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
155	NC_008062	CGGCT	2	10	821445	821454	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
156	NC_008062	GGCCG	2	10	829491	829500	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
157	NC_008062	CGTTT	2	10	834400	834409	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
158	NC_008062	GCGCG	2	10	836588	836597	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
159	NC_008062	GCGTG	2	10	845243	845252	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
160	NC_008062	CGAAC	2	10	848619	848628	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_008062	GCGGA	2	10	858544	858553	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
162	NC_008062	CGGCG	2	10	881445	881454	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
163	NC_008062	AGCAC	2	10	883856	883865	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_008062	GCGCG	2	10	892597	892606	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
165	NC_008062	AGTCA	2	10	901666	901675	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_008062	GTTTT	2	10	907924	907933	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_008062	GCGCG	2	10	913341	913350	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
168	NC_008062	GCGAT	2	10	914659	914668	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
169	NC_008062	GCGGT	2	10	923387	923396	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
170	NC_008062	AATGA	2	10	942175	942184	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
171	NC_008062	GAAAT	2	10	942239	942248	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_008062	CGGGC	2	10	947467	947476	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
173	NC_008062	AGGTG	2	10	960259	960268	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
174	NC_008062	AGGGA	2	10	960412	960421	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
175	NC_008062	GCGCC	2	10	962871	962880	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
176	NC_008062	GCGCG	2	10	962912	962921	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
177	NC_008062	GTCGC	2	10	973144	973153	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
178	NC_008062	GGGAA	2	10	975479	975488	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
179	NC_008062	CATCG	2	10	983781	983790	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
180	NC_008062	CGGGT	2	10	1006028	1006037	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
181	NC_008062	TCGCC	2	10	1011667	1011676	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
182	NC_008062	ACCTC	2	10	1011866	1011875	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
183	NC_008062	TTCGT	2	10	1017361	1017370	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
184	NC_008062	GCGCC	2	10	1032586	1032595	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
185	NC_008062	CGGCG	2	10	1041016	1041025	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
186	NC_008062	CGCGG	2	10	1041730	1041739	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
187	NC_008062	CGCGG	2	10	1051437	1051446	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
188	NC_008062	GCGAC	2	10	1051504	1051513	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
189	NC_008062	GTGGC	2	10	1057894	1057903	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
190	NC_008062	ACTTA	2	10	1058935	1058944	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
191	NC_008062	CACCG	2	10	1068009	1068018	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
192	NC_008062	GACGC	2	10	1075872	1075881	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
193	NC_008062	CGTCA	2	10	1075913	1075922	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
194	NC_008062	GCGCC	2	10	1076802	1076811	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
195	NC_008062	GGCCG	2	10	1085751	1085760	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
196	NC_008062	GATGC	2	10	1088152	1088161	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
197	NC_008062	GGCGA	2	10	1089691	1089700	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
198	NC_008062	CCGCA	2	10	1113767	1113776	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
199	NC_008062	GCCGC	2	10	1115380	1115389	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
200	NC_008062	CCGCG	2	10	1119367	1119376	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
201	NC_008062	AGTGA	2	10	1121784	1121793	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
202	NC_008062	TGCCG	2	10	1121900	1121909	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
203	NC_008062	CGCCC	2	10	1130672	1130681	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
204	NC_008062	GCGCG	2	10	1131556	1131565	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
205	NC_008062	CCGTG	2	10	1132087	1132096	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
206	NC_008062	TCCCC	2	10	1132103	1132112	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
207	NC_008062	ACGCG	2	10	1141224	1141233	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
208	NC_008062	CATGC	2	10	1141436	1141445	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
209	NC_008062	GCCGC	2	10	1151314	1151323	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
210	NC_008062	TCGCG	2	10	1158522	1158531	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
211	NC_008062	CCGCC	2	10	1195615	1195624	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.