MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia AU 1054 chromosome 2

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008061	TCCTGA	2	12	53458	53469	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008061	GCGGGC	2	12	150510	150521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008061	CGTGGC	2	12	174056	174067	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008061	CGCGTC	2	12	174275	174286	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008061	GCCGAA	2	12	221900	221911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008061	TGAACG	2	12	254199	254210	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008061	GTCGAG	2	12	255478	255489	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008061	TGCTCG	2	12	317539	317550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008061	GCTTCG	2	12	323776	323787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008061	TGCCGG	2	12	338179	338190	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008061	TTTCCG	2	12	410900	410911	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008061	GCCGGC	2	12	420737	420748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008061	GCCGAC	2	12	427596	427607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008061	ATTTTT	2	12	438481	438492	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008061	CGGCGA	2	12	450274	450285	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008061	GCCGGC	2	12	521290	521301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008061	CGAACC	2	12	523095	523106	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008061	CCAGCG	2	12	530452	530463	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008061	GCTGAA	2	12	530735	530746	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008061	CAATAC	2	12	540335	540346	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008061	TCGGCG	2	12	540611	540622	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008061	ACGCTG	2	12	541577	541588	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008061	GACGCT	2	12	541756	541767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008061	CAGCGG	2	12	541804	541815	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008061	GTGAAC	2	12	542237	542248	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008061	CCTCGG	2	12	542344	542355	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008061	ACGAAC	2	12	542531	542542	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008061	AACCTC	2	12	543417	543428	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008061	CGGCAG	2	12	544913	544924	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008061	CCGGCA	2	12	545278	545289	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008061	CACTCG	2	12	545350	545361	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008061	CGGCAG	2	12	545519	545530	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008061	GTTCCC	2	12	557752	557763	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008061	GACAGT	2	12	616431	616442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008061	TATGCA	2	12	669258	669269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008061	AGCGCG	2	12	701640	701651	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008061	ACGCTG	2	12	750605	750616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008061	GAAGGC	2	12	751636	751647	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008061	GCTGCG	2	12	752344	752355	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008061	ATTGCA	2	12	754890	754901	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008061	CATCGC	2	12	759261	759272	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008061	GTGCCG	6	36	805778	805813	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008061	GATATG	2	12	825927	825938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008061	GGCGTG	2	12	834571	834582	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008061	CAGGAG	2	12	839602	839613	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008061	CAATAT	2	12	840568	840579	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008061	ACGTGT	2	12	874439	874450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008061	CTGCCG	2	12	898659	898670	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008061	GCCGGG	2	12	900051	900062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008061	GGAGTG	2	12	978384	978395	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008061	GGCAAG	2	12	978401	978412	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008061	GCCGCG	2	12	1000460	1000471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008061	GACGGG	2	12	1013361	1013372	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008061	TCATCG	2	12	1018679	1018690	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008061	GAAGCT	2	12	1019641	1019652	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_008061	TCGTTG	2	12	1044400	1044411	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008061	GCATCG	2	12	1063226	1063237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008061	CACCGA	2	12	1066163	1066174	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008061	CATCCC	2	12	1079957	1079968	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_008061	AATCGC	2	12	1095788	1095799	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008061	ACAGAA	2	12	1127329	1127340	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008061	TCGCCA	2	12	1138446	1138457	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008061	CCGGCG	2	12	1146941	1146952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008061	TCCGCC	2	12	1187587	1187598	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_008061	GGTTCG	2	12	1226405	1226416	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008061	CGGCCG	2	12	1242905	1242916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008061	TCGCGA	2	12	1245512	1245523	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008061	GCGCCC	2	12	1317211	1317222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_008061	CGGCCC	2	12	1328923	1328934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008061	TCGAAC	2	12	1344653	1344664	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008061	CCGGCG	2	12	1345667	1345678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008061	TGATCG	2	12	1359308	1359319	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008061	TGCGGC	2	12	1360916	1360927	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008061	GCGACC	2	12	1362525	1362536	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008061	AATTTC	2	12	1378355	1378366	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008061	GGAGAC	2	12	1378408	1378419	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008061	TGCCGG	2	12	1385053	1385064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008061	CGCGTG	2	12	1386361	1386372	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008061	CAACTT	2	12	1386903	1386914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008061	CTGTCG	2	12	1386952	1386963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008061	GCGCTG	2	12	1387068	1387079	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008061	CGACGC	2	12	1387503	1387514	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008061	GCGCAC	2	12	1387612	1387623	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008061	TCGGCG	2	12	1425234	1425245	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008061	CGCGCC	2	12	1433034	1433045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_008061	CATCGC	2	12	1443203	1443214	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008061	CGAGTG	2	12	1562748	1562759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_008061	CGTCAT	3	18	1564321	1564338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008061	CGGTTC	2	12	1570825	1570836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008061	GGCCGC	2	12	1572922	1572933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008061	GCTTCC	2	12	1572986	1572997	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008061	CGCTGC	2	12	1574774	1574785	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008061	GCCCCG	2	12	1604529	1604540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_008061	CACCGA	2	12	1615084	1615095	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008061	CAAAAA	2	12	1617446	1617457	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008061	GCGCGG	2	12	1645650	1645661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008061	CGGGCG	2	12	1645816	1645827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008061	CAATTC	2	12	1646094	1646105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008061	GAAAAT	2	12	1646140	1646151	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008061	ATCACC	2	12	1660261	1660272	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008061	GAACAA	2	12	1666873	1666884	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_008061	GCCCGC	2	12	1676725	1676736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_008061	CAACGA	2	12	1694648	1694659	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008061	CATCGG	2	12	1700967	1700978	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008061	CTCGGG	2	12	1734537	1734548	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008061	ACCGCG	2	12	1751418	1751429	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008061	CCGGTT	2	12	1778076	1778087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008061	GGTGCG	2	12	1860440	1860451	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008061	TGCATA	2	12	1864207	1864218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_008061	GGTGAT	2	12	1899072	1899083	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008061	TCGCCG	2	12	1912463	1912474	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008061	CGAGGT	2	12	1922732	1922743	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_008061	CGGGCG	2	12	1923292	1923303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008061	CGATCA	2	12	1945337	1945348	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008061	GCCGCG	2	12	1956184	1956195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008061	TCGGAT	2	12	1958661	1958672	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_008061	GACCCA	2	12	1963429	1963440	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008061	TGATAC	2	12	1964793	1964804	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_008061	ACGGCC	2	12	1982493	1982504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008061	AGAGAA	2	12	1982525	1982536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008061	GCCGTC	2	12	2010769	2010780	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008061	CCCGCC	2	12	2045323	2045334	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
123	NC_008061	CTGCGT	2	12	2046591	2046602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008061	CGTCAA	2	12	2059633	2059644	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008061	CGACAA	2	12	2081635	2081646	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008061	CGGCGC	2	12	2089408	2089419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008061	AGTGTT	2	12	2128966	2128977	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008061	GTGACG	2	12	2143050	2143061	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_008061	AATATT	2	12	2153061	2153072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008061	TCGCGC	2	12	2194540	2194551	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008061	GTGGCA	2	12	2238151	2238162	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_008061	CCCCGC	2	12	2265649	2265660	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
133	NC_008061	CCGCGC	2	12	2278699	2278710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008061	AAAAGA	2	12	2325482	2325493	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008061	CCGGCC	2	12	2398201	2398212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_008061	TGCGAT	2	12	2403034	2403045	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_008061	GCGACA	2	12	2403197	2403208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008061	ACGTAA	2	12	2454083	2454094	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_008061	ACGCGA	2	12	2528839	2528850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008061	TGATCC	2	12	2548101	2548112	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008061	CATTTT	2	12	2548834	2548845	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_008061	GCACGC	2	12	2576032	2576043	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008061	GCGCTC	2	12	2588629	2588640	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008061	GCCGTC	2	12	2653008	2653019	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008061	GTTCGA	3	18	2653443	2653460	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_008061	TGCCGC	2	12	2697387	2697398	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008061	GGCGCG	2	12	2708056	2708067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_008061	GAGCGG	2	12	2745659	2745670	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_008061	CGGGGC	2	12	2767418	2767429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.