MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia cenocepacia AU 1054 chromosome 2

Total Repeats: 2891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008061	GACTG	2	10	319	328	20 %	20 %	40 %	20 %	107025344
2	NC_008061	GATGA	2	10	2226	2235	40 %	20 %	40 %	0 %	107025345
3	NC_008061	CGTTC	2	10	5729	5738	0 %	40 %	20 %	40 %	107025349
4	NC_008061	CGCGG	2	10	6763	6772	0 %	0 %	60 %	40 %	107025350
5	NC_008061	CGGCG	2	10	7361	7370	0 %	0 %	60 %	40 %	107025350
6	NC_008061	CGCGG	2	10	7545	7554	0 %	0 %	60 %	40 %	107025351
7	NC_008061	CGACC	2	10	7657	7666	20 %	0 %	20 %	60 %	107025351
8	NC_008061	CGGCG	2	10	7915	7924	0 %	0 %	60 %	40 %	107025351
9	NC_008061	GCGTC	2	10	8346	8355	0 %	20 %	40 %	40 %	107025351
10	NC_008061	GCTCG	2	10	8548	8557	0 %	20 %	40 %	40 %	107025351
11	NC_008061	CGACC	2	10	9968	9977	20 %	0 %	20 %	60 %	107025353
12	NC_008061	ACGGC	2	10	10246	10255	20 %	0 %	40 %	40 %	107025353
13	NC_008061	GCGCC	2	10	10647	10656	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_008061	CGGCG	2	10	11103	11112	0 %	0 %	60 %	40 %	107025354
15	NC_008061	CGCGC	2	10	11124	11133	0 %	0 %	40 %	60 %	107025354
16	NC_008061	GACGT	2	10	11440	11449	20 %	20 %	40 %	20 %	107025354
17	NC_008061	TGGTG	2	10	11492	11501	0 %	40 %	60 %	0 %	107025354
18	NC_008061	CCGCG	2	10	12032	12041	0 %	0 %	40 %	60 %	107025355
19	NC_008061	ACGAC	2	10	13465	13474	40 %	0 %	20 %	40 %	107025356
20	NC_008061	TCGAT	2	10	13522	13531	20 %	40 %	20 %	20 %	107025356
21	NC_008061	CGCGC	2	10	13910	13919	0 %	0 %	40 %	60 %	107025356
22	NC_008061	GCTGT	2	10	14290	14299	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008061	AGCCG	2	10	15039	15048	20 %	0 %	40 %	40 %	107025358
24	NC_008061	TTGCA	2	10	16195	16204	20 %	40 %	20 %	20 %	107025359
25	NC_008061	GCGCG	2	10	16646	16655	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_008061	AAGGC	2	10	17088	17097	40 %	0 %	40 %	20 %	107025360
27	NC_008061	CGGCG	2	10	17390	17399	0 %	0 %	60 %	40 %	107025360
28	NC_008061	CGCAG	2	10	17898	17907	20 %	0 %	40 %	40 %	107025360
29	NC_008061	GAGCA	2	10	18152	18161	40 %	0 %	40 %	20 %	107025360
30	NC_008061	AAGGC	2	10	19044	19053	40 %	0 %	40 %	20 %	107025361
31	NC_008061	GCGTC	2	10	19104	19113	0 %	20 %	40 %	40 %	107025361
32	NC_008061	CGCAG	2	10	19854	19863	20 %	0 %	40 %	40 %	107025361
33	NC_008061	GGGAA	2	10	20190	20199	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008061	CGGGC	2	10	25106	25115	0 %	0 %	60 %	40 %	107025365
35	NC_008061	CGAGC	2	10	25280	25289	20 %	0 %	40 %	40 %	107025365
36	NC_008061	GCCGC	2	10	25481	25490	0 %	0 %	40 %	60 %	107025365
37	NC_008061	AGCAC	2	10	25852	25861	40 %	0 %	20 %	40 %	107025365
38	NC_008061	GAACG	2	10	29100	29109	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008061	GAATT	2	10	29700	29709	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008061	CGCGG	2	10	29776	29785	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_008061	CGTCG	2	10	30044	30053	0 %	20 %	40 %	40 %	107025370
42	NC_008061	CACGT	2	10	30279	30288	20 %	20 %	20 %	40 %	107025370
43	NC_008061	GCGAC	2	10	30466	30475	20 %	0 %	40 %	40 %	107025370
44	NC_008061	AATTT	2	10	30983	30992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008061	CCTTT	2	10	31428	31437	0 %	60 %	0 %	40 %	107025371
46	NC_008061	CACCG	2	10	32592	32601	20 %	0 %	20 %	60 %	107025372
47	NC_008061	GCCGC	2	10	32665	32674	0 %	0 %	40 %	60 %	107025372
48	NC_008061	GTCGC	2	10	33493	33502	0 %	20 %	40 %	40 %	107025373
49	NC_008061	CGCGG	2	10	34894	34903	0 %	0 %	60 %	40 %	107025373
50	NC_008061	ACGGC	2	10	35238	35247	20 %	0 %	40 %	40 %	107025373
51	NC_008061	CGCGG	2	10	35389	35398	0 %	0 %	60 %	40 %	107025373
52	NC_008061	CGCGT	2	10	37798	37807	0 %	20 %	40 %	40 %	107025374
53	NC_008061	CGGAA	2	10	38878	38887	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_008061	GCGAC	2	10	42365	42374	20 %	0 %	40 %	40 %	107025379
55	NC_008061	CGATG	2	10	43482	43491	20 %	20 %	40 %	20 %	107025380
56	NC_008061	TGCGC	2	10	46290	46299	0 %	20 %	40 %	40 %	107025383
57	NC_008061	CGCGC	2	10	47442	47451	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_008061	AGCGA	2	10	51586	51595	40 %	0 %	40 %	20 %	107025387
59	NC_008061	GCGGT	2	10	52706	52715	0 %	20 %	60 %	20 %	107025387
60	NC_008061	GTTTT	2	10	56343	56352	0 %	80 %	20 %	0 %	107025391
61	NC_008061	ATCGA	2	10	56838	56847	40 %	20 %	20 %	20 %	107025392
62	NC_008061	CCTGA	2	10	57730	57739	20 %	20 %	20 %	40 %	107025392
63	NC_008061	CCGCT	2	10	58679	58688	0 %	20 %	20 %	60 %	107025393
64	NC_008061	GCCGG	2	10	60956	60965	0 %	0 %	60 %	40 %	107025396
65	NC_008061	GAAGG	2	10	60983	60992	40 %	0 %	60 %	0 %	107025396
66	NC_008061	CGGCT	2	10	63175	63184	0 %	20 %	40 %	40 %	107025399
67	NC_008061	CGAAG	2	10	63802	63811	40 %	0 %	40 %	20 %	107025400
68	NC_008061	GTCGT	2	10	63860	63869	0 %	40 %	40 %	20 %	107025400
69	NC_008061	CGAGC	2	10	63871	63880	20 %	0 %	40 %	40 %	107025400
70	NC_008061	CGCCC	2	10	65983	65992	0 %	0 %	20 %	80 %	107025402
71	NC_008061	CGCGC	2	10	66420	66429	0 %	0 %	40 %	60 %	107025402
72	NC_008061	ACGCG	2	10	67099	67108	20 %	0 %	40 %	40 %	107025403
73	NC_008061	TGCGA	2	10	68327	68336	20 %	20 %	40 %	20 %	107025403
74	NC_008061	GCGGG	2	10	68656	68665	0 %	0 %	80 %	20 %	107025404
75	NC_008061	GCGTC	2	10	68963	68972	0 %	20 %	40 %	40 %	107025404
76	NC_008061	GATGC	2	10	69271	69280	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_008061	AGGGT	2	10	71112	71121	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008061	CGGCG	2	10	72625	72634	0 %	0 %	60 %	40 %	107025408
79	NC_008061	GGGCA	2	10	73986	73995	20 %	0 %	60 %	20 %	107025410
80	NC_008061	GCCGC	2	10	74190	74199	0 %	0 %	40 %	60 %	107025410
81	NC_008061	TGCGC	2	10	75391	75400	0 %	20 %	40 %	40 %	107025411
82	NC_008061	CGGCG	2	10	76500	76509	0 %	0 %	60 %	40 %	107025412
83	NC_008061	TGCGA	2	10	76768	76777	20 %	20 %	40 %	20 %	107025413
84	NC_008061	CGAGC	2	10	78642	78651	20 %	0 %	40 %	40 %	107025415
85	NC_008061	CGCGC	2	10	79533	79542	0 %	0 %	40 %	60 %	107025416
86	NC_008061	GCGGT	2	10	80113	80122	0 %	20 %	60 %	20 %	107025416
87	NC_008061	TGCGC	2	10	81042	81051	0 %	20 %	40 %	40 %	107025417
88	NC_008061	GCCGT	2	10	82164	82173	0 %	20 %	40 %	40 %	107025419
89	NC_008061	GCGCC	2	10	86194	86203	0 %	0 %	40 %	60 %	107025423
90	NC_008061	CGCGC	2	10	87769	87778	0 %	0 %	40 %	60 %	107025424
91	NC_008061	GCGCG	2	10	87975	87984	0 %	0 %	60 %	40 %	107025424
92	NC_008061	TGCCG	2	10	88251	88260	0 %	20 %	40 %	40 %	107025424
93	NC_008061	GCGTG	2	10	88667	88676	0 %	20 %	60 %	20 %	107025424
94	NC_008061	CGGGC	2	10	88696	88705	0 %	0 %	60 %	40 %	107025424
95	NC_008061	GTGCT	2	10	91892	91901	0 %	40 %	40 %	20 %	107025427
96	NC_008061	CGGCT	2	10	92325	92334	0 %	20 %	40 %	40 %	107025428
97	NC_008061	GGCGC	2	10	94686	94695	0 %	0 %	60 %	40 %	107025430
98	NC_008061	GCTCG	2	10	95109	95118	0 %	20 %	40 %	40 %	107025430
99	NC_008061	ACGGC	2	10	95489	95498	20 %	0 %	40 %	40 %	107025430
100	NC_008061	AAGGC	2	10	96213	96222	40 %	0 %	40 %	20 %	107025431
101	NC_008061	CGCGG	2	10	96409	96418	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_008061	TCGTG	2	10	97855	97864	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008061	GCGAA	2	10	99021	99030	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_008061	GGGAG	2	10	99339	99348	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008061	CTCAT	2	10	101338	101347	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_008061	GCGAC	2	10	107183	107192	20 %	0 %	40 %	40 %	107025435
107	NC_008061	CCGAT	2	10	107341	107350	20 %	20 %	20 %	40 %	107025435
108	NC_008061	CGCAG	2	10	107596	107605	20 %	0 %	40 %	40 %	107025435
109	NC_008061	AGGCG	2	10	108300	108309	20 %	0 %	60 %	20 %	107025437
110	NC_008061	GCGCG	2	10	108921	108930	0 %	0 %	60 %	40 %	107025438
111	NC_008061	CGGGC	2	10	112029	112038	0 %	0 %	60 %	40 %	107025439
112	NC_008061	ATGCA	2	10	112867	112876	40 %	20 %	20 %	20 %	107025440
113	NC_008061	CGTGC	2	10	114202	114211	0 %	20 %	40 %	40 %	107025441
114	NC_008061	CGGCT	2	10	114990	114999	0 %	20 %	40 %	40 %	107025442
115	NC_008061	CCGGC	2	10	115806	115815	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_008061	GGGCA	2	10	118441	118450	20 %	0 %	60 %	20 %	107025445
117	NC_008061	CGACC	2	10	120295	120304	20 %	0 %	20 %	60 %	107025446
118	NC_008061	GCATC	2	10	121228	121237	20 %	20 %	20 %	40 %	107025447
119	NC_008061	GCCGC	2	10	121920	121929	0 %	0 %	40 %	60 %	107025448
120	NC_008061	GCGCC	2	10	122192	122201	0 %	0 %	40 %	60 %	107025448
121	NC_008061	CATGC	2	10	122730	122739	20 %	20 %	20 %	40 %	107025448
122	NC_008061	TGCGC	2	10	122812	122821	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_008061	GAGCC	2	10	123446	123455	20 %	0 %	40 %	40 %	107025450
124	NC_008061	CGGCC	2	10	124306	124315	0 %	0 %	40 %	60 %	107025451
125	NC_008061	TGAAG	2	10	132056	132065	40 %	20 %	40 %	0 %	107025456
126	NC_008061	GTCGG	2	10	132909	132918	0 %	20 %	60 %	20 %	107025457
127	NC_008061	GAACG	2	10	135823	135832	40 %	0 %	40 %	20 %	107025458
128	NC_008061	GCGCG	2	10	135956	135965	0 %	0 %	60 %	40 %	107025458
129	NC_008061	CGGCG	2	10	135990	135999	0 %	0 %	60 %	40 %	107025458
130	NC_008061	CGGCG	2	10	136227	136236	0 %	0 %	60 %	40 %	107025458
131	NC_008061	ATGCG	2	10	138635	138644	20 %	20 %	40 %	20 %	107025460
132	NC_008061	GGCGC	2	10	138747	138756	0 %	0 %	60 %	40 %	107025460
133	NC_008061	GTCGC	2	10	138895	138904	0 %	20 %	40 %	40 %	107025460
134	NC_008061	AGCCG	2	10	139128	139137	20 %	0 %	40 %	40 %	107025460
135	NC_008061	CGCTG	2	10	140704	140713	0 %	20 %	40 %	40 %	107025461
136	NC_008061	CGCGC	2	10	141642	141651	0 %	0 %	40 %	60 %	107025462
137	NC_008061	CGCGC	2	10	141787	141796	0 %	0 %	40 %	60 %	107025462
138	NC_008061	GCGCG	2	10	143519	143528	0 %	0 %	60 %	40 %	107025464
139	NC_008061	GAACG	2	10	147892	147901	40 %	0 %	40 %	20 %	107025466
140	NC_008061	AGCCG	2	10	148693	148702	20 %	0 %	40 %	40 %	107025467
141	NC_008061	CGTAG	2	10	148792	148801	20 %	20 %	40 %	20 %	107025467
142	NC_008061	GCGCC	2	10	148868	148877	0 %	0 %	40 %	60 %	107025467
143	NC_008061	CATCG	2	10	149000	149009	20 %	20 %	20 %	40 %	107025467
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145	NC_008061	AACCC	2	10	149883	149892	40 %	0 %	0 %	60 %	107025468
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150	NC_008061	TCGAT	2	10	155381	155390	20 %	40 %	20 %	20 %	107025474
151	NC_008061	TGCGT	2	10	155868	155877	0 %	40 %	40 %	20 %	107025475
152	NC_008061	GGAAC	2	10	156341	156350	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_008061	TTCCT	2	10	157618	157627	0 %	60 %	0 %	40 %	107025477
156	NC_008061	TCGGC	2	10	157788	157797	0 %	20 %	40 %	40 %	107025477
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158	NC_008061	GGCCG	2	10	158998	159007	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
159	NC_008061	AATGC	2	10	159213	159222	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_008061	GTGAA	2	10	159373	159382	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008061	CGACG	2	10	162021	162030	20 %	0 %	40 %	40 %	107025479
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166	NC_008061	CGCGC	2	10	164507	164516	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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169	NC_008061	ACGGA	2	10	169511	169520	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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178	NC_008061	GCCAT	2	10	179807	179816	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
179	NC_008061	TCCTG	2	10	179853	179862	0 %	40 %	20 %	40 %	107025492
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185	NC_008061	GCGTC	2	10	186210	186219	0 %	20 %	40 %	40 %	107025497
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190	NC_008061	CGGAT	2	10	189921	189930	20 %	20 %	40 %	20 %	107025501
191	NC_008061	GCCGA	2	10	195580	195589	20 %	0 %	40 %	40 %	107025502
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194	NC_008061	CGTTG	2	10	197892	197901	0 %	40 %	40 %	20 %	107025502
195	NC_008061	TGTCG	2	10	198696	198705	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
196	NC_008061	ACTTC	2	10	199433	199442	20 %	40 %	0 %	40 %	107025503
197	NC_008061	GCGGA	2	10	199845	199854	20 %	0 %	60 %	20 %	107025503
198	NC_008061	GTGAC	2	10	200550	200559	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
199	NC_008061	GCAGC	2	10	204702	204711	20 %	0 %	40 %	40 %	107025507
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201	NC_008061	TGAGC	2	10	210521	210530	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
202	NC_008061	CACCG	2	10	211165	211174	20 %	0 %	20 %	60 %	107025513
203	NC_008061	CGGCG	2	10	211231	211240	0 %	0 %	60 %	40 %	107025513
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215	NC_008061	GTCTG	2	10	223955	223964	0 %	40 %	40 %	20 %	107025525
216	NC_008061	GCTGG	2	10	226694	226703	0 %	20 %	60 %	20 %	107025527
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220	NC_008061	ATTCA	2	10	228107	228116	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
221	NC_008061	GCTGC	2	10	228369	228378	0 %	20 %	40 %	40 %	107025528
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230	NC_008061	CTGAT	2	10	237628	237637	20 %	40 %	20 %	20 %	107025534
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232	NC_008061	TTCAG	2	10	242585	242594	20 %	40 %	20 %	20 %	107025538
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240	NC_008061	CGCGC	2	10	251667	251676	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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245	NC_008061	CGGCG	2	10	254841	254850	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
246	NC_008061	AGTCG	2	10	254972	254981	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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249	NC_008061	GTCGA	2	10	263358	263367	20 %	20 %	40 %	20 %	107025555
250	NC_008061	GCGAA	2	10	263515	263524	40 %	0 %	40 %	20 %	107025555
251	NC_008061	GCGCG	2	10	265441	265450	0 %	0 %	60 %	40 %	107025558
252	NC_008061	GCGCG	2	10	266032	266041	0 %	0 %	60 %	40 %	107025558
253	NC_008061	CGTTT	2	10	266263	266272	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
254	NC_008061	CGGCT	2	10	266627	266636	0 %	20 %	40 %	40 %	107025559
255	NC_008061	TGTAG	2	10	267818	267827	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
256	NC_008061	GCGAC	2	10	268291	268300	20 %	0 %	40 %	40 %	107025561
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258	NC_008061	GAAGC	2	10	269418	269427	40 %	0 %	40 %	20 %	107025563
259	NC_008061	GGCCA	2	10	269690	269699	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
260	NC_008061	CGCGC	2	10	270036	270045	0 %	0 %	40 %	60 %	107025564
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263	NC_008061	GCGAT	2	10	271293	271302	20 %	20 %	40 %	20 %	107025565
264	NC_008061	GGGGC	2	10	271542	271551	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
265	NC_008061	GCGCA	2	10	277758	277767	20 %	0 %	40 %	40 %	107025571
266	NC_008061	CGCGG	2	10	277878	277887	0 %	0 %	60 %	40 %	107025571
267	NC_008061	CGCGG	2	10	280181	280190	0 %	0 %	60 %	40 %	107025573
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269	NC_008061	GAAGA	2	10	281593	281602	60 %	0 %	40 %	0 %	107025575
270	NC_008061	GCGGT	2	10	282293	282302	0 %	20 %	60 %	20 %	107025575
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500	NC_008061	CGACA	2	10	523298	523307	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

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