MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC 11842 chromosome

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008054	TCTTTT	2	12	10469	10480	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008054	TCTTGC	2	12	21673	21684	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008054	CAAAGG	2	12	22745	22756	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008054	TGAAAA	2	12	36139	36150	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008054	GGACCA	2	12	37024	37035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008054	CCGTGG	2	12	40967	40978	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008054	AGTATT	2	12	41330	41341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008054	TGGCAA	2	12	49919	49930	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008054	GACCTG	2	12	57985	57996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008054	TGAAAA	2	12	58594	58605	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008054	CAAGCA	2	12	60474	60485	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008054	ATTTTT	2	12	66643	66654	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008054	AGTATT	2	12	87804	87815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008054	ATAGCA	2	12	93153	93164	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008054	TGAAAA	2	12	98487	98498	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008054	AAAAGC	2	12	101141	101152	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008054	AAGGCA	2	12	103237	103248	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008054	CTTCAA	2	12	121365	121376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008054	GAGAGG	2	12	131178	131189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008054	AATTTA	2	12	132262	132273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008054	TTTTGA	2	12	165266	165277	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008054	TGAGCG	2	12	169653	169664	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008054	TTACTT	2	12	193427	193438	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008054	AAGTTT	2	12	209630	209641	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008054	TTTGGA	2	12	226099	226110	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008054	CCAACA	2	12	230267	230278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008054	GTCAGC	2	12	230602	230613	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008054	GTCAGC	2	12	234312	234323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008054	ACCAGG	2	12	265233	265244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008054	AAAATC	2	12	265913	265924	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008054	TCCAGA	2	12	265938	265949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008054	ATAACA	2	12	267783	267794	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008054	TCATTT	2	12	269709	269720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008054	AGCATC	2	12	364672	364683	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008054	TTTATA	2	12	364748	364759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008054	GCAAGA	2	12	366802	366813	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008054	AAAGTC	2	12	404687	404698	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008054	GGCCAG	2	12	405497	405508	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008054	GCCCTG	2	12	406164	406175	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008054	CTTGAC	2	12	415986	415997	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008054	AAGCAA	2	12	416980	416991	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008054	ATAACA	2	12	427485	427496	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008054	GCCGGG	2	12	433458	433469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008054	CGAAAT	2	12	441713	441724	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008054	GCGCTT	2	12	442421	442432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008054	GAAAAA	2	12	464270	464281	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008054	CATGTA	2	12	468032	468043	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008054	CTTTTG	2	12	468219	468230	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008054	CTTGAA	2	12	468272	468283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_008054	TTGTCG	2	12	482607	482618	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008054	GTCCCG	2	12	514300	514311	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008054	AAAAGC	2	12	528872	528883	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008054	TTTAGC	2	12	530153	530164	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008054	AGCTTT	2	12	530625	530636	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008054	TATCAA	2	12	536478	536489	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_008054	AAGTAA	2	12	548520	548531	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008054	CAAGGT	2	12	555029	555040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008054	AATTAA	2	12	604994	605005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008054	CTTTTT	2	12	624916	624927	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008054	AAAAAT	2	12	625010	625021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008054	TCTTTT	2	12	659555	659566	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008054	AAAAGA	2	12	663637	663648	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008054	TCATGC	2	12	664501	664512	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008054	TTAAAA	2	12	664521	664532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008054	GCCCTG	2	12	680588	680599	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008054	TCCTGG	2	12	681880	681891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008054	ACCTTG	2	12	687625	687636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008054	TGGCAA	2	12	694134	694145	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008054	TCTACC	2	12	712145	712156	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008054	GACAAA	2	12	719441	719452	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008054	CGATGG	2	12	721247	721258	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008054	GCTCTT	2	12	748119	748130	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008054	ATGTGC	2	12	754345	754356	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008054	AATCGA	2	12	764476	764487	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_008054	GCAATT	2	12	800355	800366	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008054	TGGCAA	2	12	811152	811163	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008054	CAAGAA	2	12	816742	816753	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008054	CGAAAT	2	12	824492	824503	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008054	ATGACG	2	12	831968	831979	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008054	CTTTTC	2	12	894517	894528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008054	TCATGG	2	12	894758	894769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008054	GTAGTC	2	12	895555	895566	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008054	AATTTT	2	12	896258	896269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008054	GCCTTT	2	12	919290	919301	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008054	GAACTG	2	12	927496	927507	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008054	TCCCCC	2	12	949491	949502	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
87	NC_008054	CCAGTT	2	12	957928	957939	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008054	AGAAAA	2	12	962616	962627	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008054	AAAGGC	2	12	966135	966146	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_008054	CCATCT	2	12	966583	966594	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008054	CATTTC	2	12	978538	978549	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008054	GTATTC	2	12	988419	988430	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_008054	CCCCGG	2	12	1011094	1011105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_008054	CGGAAG	2	12	1017451	1017462	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008054	TTTAAC	2	12	1029519	1029530	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008054	AAGATC	2	12	1034066	1034077	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_008054	TACCAG	2	12	1039183	1039194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008054	TAAATT	2	12	1039492	1039503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008054	TTCATT	2	12	1046197	1046208	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008054	GAATTA	2	12	1050261	1050272	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008054	CTGCCG	2	12	1050540	1050551	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008054	GCGGTT	2	12	1051425	1051436	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_008054	TTTTCT	2	12	1051950	1051961	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_008054	CTGGTC	2	12	1069449	1069460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008054	CCAGTT	2	12	1069865	1069876	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008054	ATTTTT	2	12	1080785	1080796	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008054	AAAAAG	2	12	1080809	1080820	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008054	GAAAAT	2	12	1094174	1094185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008054	ACGATA	2	12	1094793	1094804	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_008054	GAGGAC	2	12	1100243	1100254	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008054	GTCATA	2	12	1100336	1100347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008054	GCTATA	2	12	1106663	1106674	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_008054	AACTTC	2	12	1174494	1174505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008054	CATTTT	2	12	1189924	1189935	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_008054	TTTTCT	2	12	1194406	1194417	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_008054	TTAATC	2	12	1220267	1220278	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_008054	GTCCTT	2	12	1231474	1231485	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008054	TGTGGG	2	12	1246662	1246673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008054	CCAGGG	2	12	1274466	1274477	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008054	CATCCC	2	12	1307720	1307731	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_008054	TACTTC	2	12	1321619	1321630	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008054	AGAAAA	2	12	1330979	1330990	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008054	GCCAAA	2	12	1333583	1333594	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008054	TGACAT	2	12	1335501	1335512	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_008054	TTCCAG	2	12	1344477	1344488	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008054	TCCATG	2	12	1345279	1345290	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008054	ATTGCC	2	12	1356484	1356495	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008054	TGTGAA	2	12	1395146	1395157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008054	TAGACA	2	12	1413263	1413274	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_008054	AGAATT	2	12	1413746	1413757	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008054	GTCATC	2	12	1430585	1430596	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008054	TGGTAG	2	12	1432273	1432284	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008054	CTTGAC	2	12	1432485	1432496	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008054	TACCAA	2	12	1450222	1450233	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008054	TTGCCA	2	12	1467392	1467403	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008054	AAAATA	2	12	1480909	1480920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008054	TTTAGC	2	12	1488773	1488784	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_008054	GCACTT	2	12	1499655	1499666	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008054	TCAAAG	2	12	1502778	1502789	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_008054	CTTGTC	2	12	1503228	1503239	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008054	AAAACA	2	12	1507346	1507357	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_008054	TAAGGT	2	12	1510697	1510708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008054	ATATTA	2	12	1536570	1536581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008054	ACAAAA	2	12	1539945	1539956	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_008054	GCTTCT	2	12	1545201	1545212	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008054	TTGTTT	2	12	1545518	1545529	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008054	GGCAAG	2	12	1546014	1546025	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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150	NC_008054	CGTAAT	2	12	1570284	1570295	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_008054	CTTCAT	2	12	1570731	1570742	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_008054	CCCTTG	2	12	1597538	1597549	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
153	NC_008054	AAACTA	2	12	1598784	1598795	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_008054	ATAGTT	2	12	1605697	1605708	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008054	TTCAAG	2	12	1612151	1612162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_008054	TGGACT	2	12	1639424	1639435	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.