MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 3279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008048	GGGCA	2	10	650	659	20 %	0 %	60 %	20 %	103485499
2	NC_008048	AGGGC	2	10	1786	1795	20 %	0 %	60 %	20 %	103485500
3	NC_008048	CGTTC	2	10	4474	4483	0 %	40 %	20 %	40 %	103485502
4	NC_008048	TGCCG	2	10	6399	6408	0 %	20 %	40 %	40 %	103485505
5	NC_008048	GCATC	2	10	10268	10277	20 %	20 %	20 %	40 %	103485511
6	NC_008048	GCGCG	2	10	11275	11284	0 %	0 %	60 %	40 %	103485513
7	NC_008048	CACCG	2	10	13643	13652	20 %	0 %	20 %	60 %	103485516
8	NC_008048	CCGCG	2	10	15349	15358	0 %	0 %	40 %	60 %	103485519
9	NC_008048	CTCTC	2	10	17092	17101	0 %	40 %	0 %	60 %	103485521
10	NC_008048	GCGCT	2	10	17622	17631	0 %	20 %	40 %	40 %	103485521
11	NC_008048	TGGCG	2	10	18042	18051	0 %	20 %	60 %	20 %	103485521
12	NC_008048	CGGCG	2	10	19570	19579	0 %	0 %	60 %	40 %	103485523
13	NC_008048	ATGGC	2	10	21538	21547	20 %	20 %	40 %	20 %	103485524
14	NC_008048	ACCGA	2	10	23188	23197	40 %	0 %	20 %	40 %	103485525
15	NC_008048	GCGCC	2	10	24560	24569	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_008048	CCAAC	2	10	24755	24764	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_008048	GGATT	2	10	29077	29086	20 %	40 %	40 %	0 %	103485528
18	NC_008048	GCCGG	2	10	29998	30007	0 %	0 %	60 %	40 %	103485528
19	NC_008048	ATGAA	2	10	31274	31283	60 %	20 %	20 %	0 %	103485529
20	NC_008048	GCGCG	2	10	31665	31674	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008048	CGGGA	2	10	33463	33472	20 %	0 %	60 %	20 %	103485532
22	NC_008048	CGATG	2	10	35264	35273	20 %	20 %	40 %	20 %	103485534
23	NC_008048	CGGCG	2	10	35663	35672	0 %	0 %	60 %	40 %	103485534
24	NC_008048	GCGCC	2	10	35901	35910	0 %	0 %	40 %	60 %	103485534
25	NC_008048	AGGGG	2	10	36005	36014	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008048	GGGAG	2	10	36080	36089	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008048	GCGCC	2	10	37114	37123	0 %	0 %	40 %	60 %	103485535
28	NC_008048	TCGGG	2	10	37191	37200	0 %	20 %	60 %	20 %	103485535
29	NC_008048	GCAGC	2	10	39935	39944	20 %	0 %	40 %	40 %	103485537
30	NC_008048	CCGCG	2	10	41837	41846	0 %	0 %	40 %	60 %	103485540
31	NC_008048	CCCAG	2	10	41915	41924	20 %	0 %	20 %	60 %	103485540
32	NC_008048	GCAAG	2	10	42933	42942	40 %	0 %	40 %	20 %	103485541
33	NC_008048	GCGCC	2	10	43008	43017	0 %	0 %	40 %	60 %	103485541
34	NC_008048	CCGCG	2	10	44950	44959	0 %	0 %	40 %	60 %	103485542
35	NC_008048	GCACG	2	10	45343	45352	20 %	0 %	40 %	40 %	103485542
36	NC_008048	GCGCA	2	10	45650	45659	20 %	0 %	40 %	40 %	103485542
37	NC_008048	GCCGC	2	10	46249	46258	0 %	0 %	40 %	60 %	103485543
38	NC_008048	AGGGC	2	10	47684	47693	20 %	0 %	60 %	20 %	103485545
39	NC_008048	CGCGC	2	10	48123	48132	0 %	0 %	40 %	60 %	103485545
40	NC_008048	CGCGA	2	10	48351	48360	20 %	0 %	40 %	40 %	103485545
41	NC_008048	GCCGC	2	10	48598	48607	0 %	0 %	40 %	60 %	103485545
42	NC_008048	CTGGT	2	10	50357	50366	0 %	40 %	40 %	20 %	103485546
43	NC_008048	GCGCG	2	10	50911	50920	0 %	0 %	60 %	40 %	103485546
44	NC_008048	ATGCT	2	10	53770	53779	20 %	40 %	20 %	20 %	103485547
45	NC_008048	CCGGC	2	10	57220	57229	0 %	0 %	40 %	60 %	103485549
46	NC_008048	GCCCG	2	10	57720	57729	0 %	0 %	40 %	60 %	103485550
47	NC_008048	CGGCG	2	10	58462	58471	0 %	0 %	60 %	40 %	103485552
48	NC_008048	CGGCC	2	10	58854	58863	0 %	0 %	40 %	60 %	103485553
49	NC_008048	CGCGC	2	10	60802	60811	0 %	0 %	40 %	60 %	103485553
50	NC_008048	TGCGG	2	10	68707	68716	0 %	20 %	60 %	20 %	103485558
51	NC_008048	GCGCC	2	10	68824	68833	0 %	0 %	40 %	60 %	103485558
52	NC_008048	TGCGG	2	10	69073	69082	0 %	20 %	60 %	20 %	103485558
53	NC_008048	TCGCT	2	10	71702	71711	0 %	40 %	20 %	40 %	103485562
54	NC_008048	GTGCA	2	10	78317	78326	20 %	20 %	40 %	20 %	103485570
55	NC_008048	GTCCG	2	10	78603	78612	0 %	20 %	40 %	40 %	103485570
56	NC_008048	GAGTC	2	10	79561	79570	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008048	TGCCG	2	10	79614	79623	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_008048	GCTCG	2	10	80218	80227	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_008048	AGCTC	2	10	81979	81988	20 %	20 %	20 %	40 %	103485573
60	NC_008048	CAGTG	2	10	82055	82064	20 %	20 %	40 %	20 %	103485573
61	NC_008048	CGGGC	2	10	82724	82733	0 %	0 %	60 %	40 %	103485574
62	NC_008048	ACCCA	2	10	83159	83168	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_008048	CGGCC	2	10	84433	84442	0 %	0 %	40 %	60 %	103485576
64	NC_008048	GCGCG	2	10	85668	85677	0 %	0 %	60 %	40 %	103485579
65	NC_008048	TGCGG	2	10	86713	86722	0 %	20 %	60 %	20 %	103485579
66	NC_008048	CTGGA	2	10	86788	86797	20 %	20 %	40 %	20 %	103485579
67	NC_008048	CGATG	2	10	87295	87304	20 %	20 %	40 %	20 %	103485580
68	NC_008048	GATCA	2	10	87619	87628	40 %	20 %	20 %	20 %	103485580
69	NC_008048	CAGTC	2	10	87858	87867	20 %	20 %	20 %	40 %	103485581
70	NC_008048	CACAT	2	10	88125	88134	40 %	20 %	0 %	40 %	103485581
71	NC_008048	CGGCG	2	10	89745	89754	0 %	0 %	60 %	40 %	103485583
72	NC_008048	TCGGT	2	10	90080	90089	0 %	40 %	40 %	20 %	103485583
73	NC_008048	GCCCG	2	10	90216	90225	0 %	0 %	40 %	60 %	103485583
74	NC_008048	ATGTG	2	10	90937	90946	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008048	ACAGC	2	10	91305	91314	40 %	0 %	20 %	40 %	103485585
76	NC_008048	ACCAA	2	10	91768	91777	60 %	0 %	0 %	40 %	103485586
77	NC_008048	CGATC	2	10	94771	94780	20 %	20 %	20 %	40 %	103485589
78	NC_008048	GCGCG	2	10	96874	96883	0 %	0 %	60 %	40 %	103485592
79	NC_008048	CGCAT	2	10	97212	97221	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_008048	TCGCT	2	10	98746	98755	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_008048	ACGGC	2	10	100534	100543	20 %	0 %	40 %	40 %	103485595
82	NC_008048	AGTCC	2	10	101302	101311	20 %	20 %	20 %	40 %	103485596
83	NC_008048	GCCAG	2	10	103007	103016	20 %	0 %	40 %	40 %	103485598
84	NC_008048	CGCGA	2	10	104497	104506	20 %	0 %	40 %	40 %	103485601
85	NC_008048	TCGAT	2	10	104703	104712	20 %	40 %	20 %	20 %	103485601
86	NC_008048	CGACC	2	10	106173	106182	20 %	0 %	20 %	60 %	103485604
87	NC_008048	GCCGG	2	10	106374	106383	0 %	0 %	60 %	40 %	103485604
88	NC_008048	ATATC	2	10	106567	106576	40 %	40 %	0 %	20 %	103485604
89	NC_008048	TGAAG	2	10	107119	107128	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008048	GATCC	2	10	108318	108327	20 %	20 %	20 %	40 %	103485606
91	NC_008048	CCGAC	2	10	111795	111804	20 %	0 %	20 %	60 %	103485609
92	NC_008048	GACGC	2	10	113045	113054	20 %	0 %	40 %	40 %	103485611
93	NC_008048	CGCTG	2	10	116503	116512	0 %	20 %	40 %	40 %	103485615
94	NC_008048	GCAGC	2	10	117486	117495	20 %	0 %	40 %	40 %	103485617
95	NC_008048	GCGGA	2	10	119188	119197	20 %	0 %	60 %	20 %	103485618
96	NC_008048	GTCGG	2	10	119823	119832	0 %	20 %	60 %	20 %	103485618
97	NC_008048	GCAAG	2	10	120543	120552	40 %	0 %	40 %	20 %	103485619
98	NC_008048	TGGGC	2	10	121149	121158	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008048	TCCCC	2	10	121225	121234	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
100	NC_008048	GATCA	2	10	122613	122622	40 %	20 %	20 %	20 %	103485622
101	NC_008048	ATGAA	2	10	122963	122972	60 %	20 %	20 %	0 %	103485623
102	NC_008048	GCCGT	2	10	123518	123527	0 %	20 %	40 %	40 %	103485624
103	NC_008048	GCGGA	2	10	126926	126935	20 %	0 %	60 %	20 %	103485628
104	NC_008048	GCAAC	2	10	128764	128773	40 %	0 %	20 %	40 %	103485630
105	NC_008048	CCGCT	2	10	129339	129348	0 %	20 %	20 %	60 %	103485631
106	NC_008048	GGAGG	2	10	131195	131204	20 %	0 %	80 %	0 %	103485633
107	NC_008048	GTGCT	2	10	131683	131692	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008048	AGATG	2	10	132234	132243	40 %	20 %	40 %	0 %	103485634
109	NC_008048	GGCCG	2	10	133854	133863	0 %	0 %	60 %	40 %	103485636
110	NC_008048	GGCGC	2	10	134173	134182	0 %	0 %	60 %	40 %	103485636
111	NC_008048	GATTT	2	10	135280	135289	20 %	60 %	20 %	0 %	103485636
112	NC_008048	GGCGC	2	10	135950	135959	0 %	0 %	60 %	40 %	103485636
113	NC_008048	TGCGC	2	10	137456	137465	0 %	20 %	40 %	40 %	103485637
114	NC_008048	CGCAC	2	10	138472	138481	20 %	0 %	20 %	60 %	103485638
115	NC_008048	TCGCC	2	10	139154	139163	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_008048	GCTCG	2	10	139918	139927	0 %	20 %	40 %	40 %	103485640
117	NC_008048	TGGTG	2	10	141672	141681	0 %	40 %	60 %	0 %	103485641
118	NC_008048	GGCGC	2	10	142512	142521	0 %	0 %	60 %	40 %	103485642
119	NC_008048	CCCCA	2	10	142626	142635	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
120	NC_008048	GCCGC	2	10	146280	146289	0 %	0 %	40 %	60 %	103485647
121	NC_008048	CGTAC	2	10	147121	147130	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_008048	ATGCC	2	10	148944	148953	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_008048	GTAAA	2	10	150497	150506	60 %	20 %	20 %	0 %	103485650
124	NC_008048	CCCCT	2	10	150615	150624	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
125	NC_008048	AGGGG	2	10	150627	150636	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008048	TCGCT	2	10	151975	151984	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_008048	GCGCC	2	10	152050	152059	0 %	0 %	40 %	60 %	103485652
128	NC_008048	CGCGG	2	10	152840	152849	0 %	0 %	60 %	40 %	103485653
129	NC_008048	GCCGC	2	10	153129	153138	0 %	0 %	40 %	60 %	103485653
130	NC_008048	CAGCG	2	10	156386	156395	20 %	0 %	40 %	40 %	103485654
131	NC_008048	CGCGC	2	10	157177	157186	0 %	0 %	40 %	60 %	103485654
132	NC_008048	GGATC	2	10	159336	159345	20 %	20 %	40 %	20 %	103485655
133	NC_008048	TGCGC	2	10	159836	159845	0 %	20 %	40 %	40 %	103485656
134	NC_008048	CGAGG	2	10	159957	159966	20 %	0 %	60 %	20 %	103485656
135	NC_008048	CGCGG	2	10	162051	162060	0 %	0 %	60 %	40 %	103485658
136	NC_008048	GTCGC	2	10	163093	163102	0 %	20 %	40 %	40 %	103485658
137	NC_008048	GCGCC	2	10	165350	165359	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_008048	GCCCC	2	10	166272	166281	0 %	0 %	20 %	80 %	103485661
139	NC_008048	AGGGG	2	10	167480	167489	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008048	CCTTT	2	10	167538	167547	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_008048	TTCCC	2	10	167961	167970	0 %	40 %	0 %	60 %	103485663
142	NC_008048	GTACG	2	10	168859	168868	20 %	20 %	40 %	20 %	103485663
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151	NC_008048	CCGAC	2	10	177967	177976	20 %	0 %	20 %	60 %	103485669
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156	NC_008048	GCCTT	2	10	185182	185191	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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162	NC_008048	TGCGC	2	10	192742	192751	0 %	20 %	40 %	40 %	103485680
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169	NC_008048	CGCGC	2	10	202320	202329	0 %	0 %	40 %	60 %	103485687
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176	NC_008048	GCTTC	2	10	215118	215127	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_008048	CGGCG	2	10	220084	220093	0 %	0 %	60 %	40 %	103485701
182	NC_008048	GCCCC	2	10	221310	221319	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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185	NC_008048	AGGAA	2	10	223664	223673	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
186	NC_008048	CGACG	2	10	224485	224494	20 %	0 %	40 %	40 %	103485711
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243	NC_008048	CGGGC	2	10	273719	273728	0 %	0 %	60 %	40 %	103485770
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245	NC_008048	CGGGC	2	10	274492	274501	0 %	0 %	60 %	40 %	103485770
246	NC_008048	GCCGG	2	10	275653	275662	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
247	NC_008048	GCGCC	2	10	276721	276730	0 %	0 %	40 %	60 %	103485774
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249	NC_008048	CGCGG	2	10	279089	279098	0 %	0 %	60 %	40 %	103485776
250	NC_008048	GCGAT	2	10	279541	279550	20 %	20 %	40 %	20 %	103485776
251	NC_008048	CCACC	2	10	280389	280398	20 %	0 %	0 %	80 %	103485777
252	NC_008048	GCCGT	2	10	280904	280913	0 %	20 %	40 %	40 %	103485778
253	NC_008048	AGGCG	2	10	281418	281427	20 %	0 %	60 %	20 %	103485778
254	NC_008048	GGCGC	3	15	281493	281507	0 %	0 %	60 %	40 %	103485778
255	NC_008048	GCGCG	2	10	281730	281739	0 %	0 %	60 %	40 %	103485778
256	NC_008048	CGCGC	2	10	282079	282088	0 %	0 %	40 %	60 %	103485779
257	NC_008048	GCGCG	2	10	282193	282202	0 %	0 %	60 %	40 %	103485779
258	NC_008048	GCGGT	2	10	285871	285880	0 %	20 %	60 %	20 %	103485783
259	NC_008048	CGGTG	2	10	286895	286904	0 %	20 %	60 %	20 %	103485784
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261	NC_008048	GCGCC	2	10	287111	287120	0 %	0 %	40 %	60 %	103485784
262	NC_008048	GCGCG	2	10	287321	287330	0 %	0 %	60 %	40 %	103485784
263	NC_008048	GGATG	2	10	287331	287340	20 %	20 %	60 %	0 %	103485784
264	NC_008048	AGGGG	2	10	288055	288064	20 %	0 %	80 %	0 %	103485785
265	NC_008048	CCCCT	2	10	288117	288126	0 %	20 %	0 %	80 %	103485785
266	NC_008048	AGGGG	2	10	288129	288138	20 %	0 %	80 %	0 %	103485785
267	NC_008048	TTCGA	2	10	289283	289292	20 %	40 %	20 %	20 %	103485785
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