MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008048	GTCC	2	8	1542	1549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008048	TTGT	2	8	20472	20479	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008048	GCTT	2	8	20656	20663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008048	GTAG	2	8	24504	24511	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008048	TGGT	2	8	30627	30634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008048	ACGA	2	8	30749	30756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008048	CCCG	2	8	31798	31805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_008048	GAAA	2	8	32374	32381	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008048	GAAA	2	8	32438	32445	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008048	GACC	2	8	32791	32798	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008048	GATC	2	8	32811	32818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008048	AAAG	2	8	32969	32976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008048	CCCG	2	8	44406	44413	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008048	CCAG	2	8	48764	48771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008048	GTGG	2	8	48864	48871	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008048	GTTC	2	8	51077	51084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008048	TTCG	2	8	64983	64990	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008048	CTGA	2	8	65025	65032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008048	CCAT	2	8	65190	65197	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008048	TGAA	2	8	71400	71407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008048	TTCA	2	8	71418	71425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008048	CCGG	2	8	72245	72252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008048	GGGA	2	8	72827	72834	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008048	ATCG	2	8	79301	79308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008048	TGAC	2	8	83769	83776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008048	CCGA	2	8	87747	87754	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008048	GACA	2	8	95395	95402	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008048	AGCC	2	8	97088	97095	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008048	TGAC	2	8	98322	98329	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008048	CGAC	2	8	98543	98550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008048	CTGG	2	8	98567	98574	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008048	CGGA	2	8	98644	98651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008048	CGTC	2	8	99286	99293	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008048	GGTC	2	8	99460	99467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008048	TCGA	2	8	106696	106703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008048	CGCA	2	8	106749	106756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008048	AGCG	2	8	112464	112471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008048	ATGA	2	8	113663	113670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008048	ATTG	2	8	114338	114345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008048	GAAA	2	8	114393	114400	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008048	TCGC	2	8	117324	117331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008048	GCAA	2	8	120896	120903	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008048	GCCC	2	8	124361	124368	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_008048	GCTG	2	8	125095	125102	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008048	CTTT	2	8	125150	125157	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008048	TTGA	2	8	125597	125604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008048	CGGT	2	8	127552	127559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008048	CGAC	2	8	127686	127693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008048	TCGA	3	12	129161	129172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008048	ACGA	2	8	129743	129750	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008048	CCGA	2	8	129757	129764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008048	AACG	2	8	129789	129796	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008048	AAGT	2	8	131775	131782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008048	CGAA	2	8	131802	131809	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008048	GACC	2	8	136817	136824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008048	GCCC	2	8	140201	140208	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_008048	GCGG	2	8	140458	140465	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008048	AGTG	2	8	140593	140600	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008048	CCAG	2	8	140689	140696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008048	GGCA	2	8	141838	141845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008048	AGGG	2	8	147178	147185	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008048	CCCG	2	8	147372	147379	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_008048	CCCT	2	8	166887	166894	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_008048	GCTT	2	8	173375	173382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008048	GCGG	2	8	175891	175898	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008048	GAAG	2	8	175944	175951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008048	CAGC	2	8	177564	177571	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008048	TCGT	2	8	178324	178331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008048	ATTA	2	8	181331	181338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008048	CCTG	2	8	185201	185208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008048	GGCG	2	8	195034	195041	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008048	GCCA	2	8	200445	200452	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008048	CCTT	2	8	229525	229532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008048	GCTT	2	8	229603	229610	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008048	GGAG	2	8	232697	232704	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008048	TGTC	2	8	236359	236366	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008048	AGGA	2	8	239175	239182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008048	GTTT	2	8	248828	248835	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008048	TAAT	2	8	250876	250883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008048	GGCG	2	8	253682	253689	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008048	CACC	2	8	255230	255237	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_008048	AGGG	2	8	255257	255264	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008048	CGTT	2	8	260475	260482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008048	CGAG	2	8	260484	260491	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008048	GCGA	2	8	262194	262201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008048	CGCC	2	8	265992	265999	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_008048	TCAA	2	8	267420	267427	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008048	TGGG	2	8	276107	276114	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008048	CGCC	2	8	276145	276152	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_008048	GATG	2	8	278505	278512	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008048	CGTG	2	8	282852	282859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008048	CGGT	2	8	303862	303869	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008048	TCCC	2	8	309301	309308	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_008048	TAAT	2	8	310932	310939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008048	TCGC	2	8	316670	316677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008048	CGAT	2	8	318332	318339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008048	AGAT	2	8	321255	321262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008048	CTTG	2	8	333803	333810	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008048	TGGT	2	8	342290	342297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008048	CTGG	2	8	342301	342308	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008048	ACCG	2	8	344568	344575	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008048	CCGC	2	8	345770	345777	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_008048	GATG	2	8	363321	363328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008048	CGAC	2	8	370939	370946	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008048	CCGC	2	8	371199	371206	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_008048	CGGG	2	8	371279	371286	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008048	CGTT	2	8	371293	371300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008048	CAGC	2	8	371301	371308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008048	TCCG	2	8	373662	373669	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008048	GCGG	2	8	376540	376547	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008048	CACC	2	8	396297	396304	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_008048	GCAA	2	8	397136	397143	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008048	GCCC	2	8	402297	402304	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_008048	GTCT	2	8	403693	403700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008048	GGCG	2	8	403814	403821	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008048	TCAA	2	8	404173	404180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008048	CATC	2	8	405222	405229	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008048	TGAG	2	8	405321	405328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008048	GACG	2	8	410133	410140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008048	GTCT	2	8	410397	410404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008048	CTTG	2	8	415305	415312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008048	TAGA	2	8	418600	418607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008048	ATAA	2	8	418628	418635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008048	AGAC	2	8	422759	422766	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008048	ACAG	2	8	423636	423643	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008048	GGCA	2	8	424410	424417	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008048	ACCC	2	8	426765	426772	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_008048	CACT	2	8	427215	427222	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008048	TGAC	2	8	431640	431647	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008048	CAGG	2	8	431706	431713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008048	GCCC	2	8	431795	431802	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_008048	TCAA	2	8	435516	435523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008048	GATC	2	8	435582	435589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008048	TTCG	2	8	440529	440536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008048	GGTC	2	8	440553	440560	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008048	AGGG	2	8	440787	440794	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008048	CTGG	2	8	440836	440843	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008048	TTTC	2	8	456076	456083	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008048	AGGC	2	8	456244	456251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008048	ATCT	2	8	459840	459847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008048	TAAT	2	8	460358	460365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008048	CAGG	2	8	460495	460502	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008048	CTAG	2	8	462822	462829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008048	CCGG	2	8	462874	462881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008048	GAAG	2	8	462952	462959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008048	GGCG	2	8	466630	466637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008048	CGAG	2	8	466866	466873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008048	TCAA	2	8	466884	466891	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008048	CCCG	2	8	467711	467718	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_008048	TTCG	2	8	467879	467886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008048	GAGC	2	8	469951	469958	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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176	NC_008048	CCGG	2	8	549832	549839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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181	NC_008048	GCCG	2	8	572525	572532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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186	NC_008048	GCTG	2	8	584259	584266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_008048	CCGG	2	8	1814439	1814446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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473	NC_008048	TCGA	2	8	1862579	1862586	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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483	NC_008048	AGGA	2	8	1874628	1874635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
484	NC_008048	CGTT	2	8	1875662	1875669	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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487	NC_008048	CTCC	2	8	1877421	1877428	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
488	NC_008048	GTCG	2	8	1877609	1877616	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
489	NC_008048	TGGC	2	8	1878114	1878121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
490	NC_008048	GGCG	2	8	1888043	1888050	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
491	NC_008048	CGTC	2	8	1888056	1888063	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
492	NC_008048	TCGA	2	8	1890323	1890330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_008048	CCTG	2	8	1914170	1914177	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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