MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 6587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008044	CCCG	2	8	295	302	0 %	0 %	25 %	75 %	99079842
2	NC_008044	CAAC	2	8	306	313	50 %	0 %	0 %	50 %	99079842
3	NC_008044	ATGC	2	8	582	589	25 %	25 %	25 %	25 %	99079842
4	NC_008044	CGCT	2	8	1311	1318	0 %	25 %	25 %	50 %	99079842
5	NC_008044	CGCT	2	8	1440	1447	0 %	25 %	25 %	50 %	99079842
6	NC_008044	GCTG	2	8	2674	2681	0 %	25 %	50 %	25 %	99079843
7	NC_008044	GCGG	2	8	2973	2980	0 %	0 %	75 %	25 %	99079844
8	NC_008044	TCGC	2	8	3260	3267	0 %	25 %	25 %	50 %	99079844
9	NC_008044	TGGT	2	8	3274	3281	0 %	50 %	50 %	0 %	99079844
10	NC_008044	CATC	2	8	3492	3499	25 %	25 %	0 %	50 %	99079844
11	NC_008044	CTGG	2	8	4094	4101	0 %	25 %	50 %	25 %	99079845
12	NC_008044	GGCG	2	8	4367	4374	0 %	0 %	75 %	25 %	99079845
13	NC_008044	GGCC	2	8	6188	6195	0 %	0 %	50 %	50 %	99079848
14	NC_008044	GTGA	2	8	6243	6250	25 %	25 %	50 %	0 %	99079848
15	NC_008044	TCGC	2	8	6457	6464	0 %	25 %	25 %	50 %	99079848
16	NC_008044	GAGC	2	8	6677	6684	25 %	0 %	50 %	25 %	99079848
17	NC_008044	GATG	2	8	6746	6753	25 %	25 %	50 %	0 %	99079848
18	NC_008044	ATCA	2	8	7707	7714	50 %	25 %	0 %	25 %	99079848
19	NC_008044	GCCT	2	8	9760	9767	0 %	25 %	25 %	50 %	99079850
20	NC_008044	GAGC	2	8	9829	9836	25 %	0 %	50 %	25 %	99079850
21	NC_008044	TCGA	2	8	10866	10873	25 %	25 %	25 %	25 %	99079851
22	NC_008044	GCGG	2	8	11124	11131	0 %	0 %	75 %	25 %	99079851
23	NC_008044	GGGC	2	8	12844	12851	0 %	0 %	75 %	25 %	99079852
24	NC_008044	GATC	2	8	13484	13491	25 %	25 %	25 %	25 %	99079853
25	NC_008044	ACGC	2	8	14064	14071	25 %	0 %	25 %	50 %	99079853
26	NC_008044	TGAA	2	8	14082	14089	50 %	25 %	25 %	0 %	99079853
27	NC_008044	AAGC	2	8	14215	14222	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008044	AGGC	2	8	14596	14603	25 %	0 %	50 %	25 %	99079854
29	NC_008044	CGCC	2	8	14629	14636	0 %	0 %	25 %	75 %	99079854
30	NC_008044	ACTG	2	8	15140	15147	25 %	25 %	25 %	25 %	99079855
31	NC_008044	GCGG	2	8	16698	16705	0 %	0 %	75 %	25 %	99079856
32	NC_008044	CGCA	2	8	17060	17067	25 %	0 %	25 %	50 %	99079857
33	NC_008044	CAGG	2	8	17083	17090	25 %	0 %	50 %	25 %	99079857
34	NC_008044	GACC	2	8	17172	17179	25 %	0 %	25 %	50 %	99079857
35	NC_008044	GCGG	2	8	17451	17458	0 %	0 %	75 %	25 %	99079857
36	NC_008044	GCGG	2	8	17619	17626	0 %	0 %	75 %	25 %	99079857
37	NC_008044	GATT	2	8	18352	18359	25 %	50 %	25 %	0 %	99079858
38	NC_008044	TGCG	2	8	19245	19252	0 %	25 %	50 %	25 %	99079859
39	NC_008044	TGGC	2	8	19446	19453	0 %	25 %	50 %	25 %	99079859
40	NC_008044	CCAC	2	8	19920	19927	25 %	0 %	0 %	75 %	99079859
41	NC_008044	GTCG	2	8	20071	20078	0 %	25 %	50 %	25 %	99079859
42	NC_008044	ATCT	2	8	20476	20483	25 %	50 %	0 %	25 %	99079860
43	NC_008044	CCTG	2	8	20495	20502	0 %	25 %	25 %	50 %	99079860
44	NC_008044	CCGG	2	8	20719	20726	0 %	0 %	50 %	50 %	99079860
45	NC_008044	GCTG	2	8	21251	21258	0 %	25 %	50 %	25 %	99079860
46	NC_008044	CACG	2	8	22607	22614	25 %	0 %	25 %	50 %	99079861
47	NC_008044	ACGG	2	8	23846	23853	25 %	0 %	50 %	25 %	99079862
48	NC_008044	GATC	2	8	23945	23952	25 %	25 %	25 %	25 %	99079863
49	NC_008044	ACCG	2	8	24063	24070	25 %	0 %	25 %	50 %	99079863
50	NC_008044	TCGG	3	12	24394	24405	0 %	25 %	50 %	25 %	99079863
51	NC_008044	AGGA	2	8	24578	24585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008044	CGGA	2	8	24691	24698	25 %	0 %	50 %	25 %	99079864
53	NC_008044	TCGA	2	8	25169	25176	25 %	25 %	25 %	25 %	99079865
54	NC_008044	ACGC	2	8	28645	28652	25 %	0 %	25 %	50 %	99079869
55	NC_008044	CCAC	2	8	29606	29613	25 %	0 %	0 %	75 %	99079870
56	NC_008044	TCGA	2	8	29959	29966	25 %	25 %	25 %	25 %	99079870
57	NC_008044	ACCG	2	8	30229	30236	25 %	0 %	25 %	50 %	99079870
58	NC_008044	TGAA	2	8	30391	30398	50 %	25 %	25 %	0 %	99079870
59	NC_008044	GAAG	2	8	30444	30451	50 %	0 %	50 %	0 %	99079871
60	NC_008044	CGGA	2	8	30618	30625	25 %	0 %	50 %	25 %	99079871
61	NC_008044	GGCA	2	8	30649	30656	25 %	0 %	50 %	25 %	99079871
62	NC_008044	CGGG	2	8	31948	31955	0 %	0 %	75 %	25 %	99079872
63	NC_008044	CAGC	2	8	33651	33658	25 %	0 %	25 %	50 %	99079873
64	NC_008044	GAAA	2	8	33786	33793	75 %	0 %	25 %	0 %	99079873
65	NC_008044	TCGA	2	8	34019	34026	25 %	25 %	25 %	25 %	99079873
66	NC_008044	TCGC	2	8	34157	34164	0 %	25 %	25 %	50 %	99079873
67	NC_008044	AGCC	2	8	34379	34386	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008044	TGGA	2	8	34397	34404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008044	GCCA	2	8	34845	34852	25 %	0 %	25 %	50 %	99079874
70	NC_008044	CCGA	2	8	35010	35017	25 %	0 %	25 %	50 %	99079874
71	NC_008044	GCTC	2	8	35180	35187	0 %	25 %	25 %	50 %	99079874
72	NC_008044	CATT	2	8	35423	35430	25 %	50 %	0 %	25 %	99079874
73	NC_008044	GGCT	2	8	35515	35522	0 %	25 %	50 %	25 %	99079874
74	NC_008044	TCAG	2	8	35803	35810	25 %	25 %	25 %	25 %	99079874
75	NC_008044	GTGA	2	8	37910	37917	25 %	25 %	50 %	0 %	99079877
76	NC_008044	AGCC	2	8	38336	38343	25 %	0 %	25 %	50 %	99079877
77	NC_008044	GAAC	2	8	38760	38767	50 %	0 %	25 %	25 %	99079878
78	NC_008044	ACAT	2	8	40217	40224	50 %	25 %	0 %	25 %	99079879
79	NC_008044	GTCG	2	8	40609	40616	0 %	25 %	50 %	25 %	99079879
80	NC_008044	GCCT	2	8	40858	40865	0 %	25 %	25 %	50 %	99079879
81	NC_008044	CGTC	2	8	41396	41403	0 %	25 %	25 %	50 %	99079880
82	NC_008044	CGGT	2	8	41474	41481	0 %	25 %	50 %	25 %	99079880
83	NC_008044	GATC	2	8	42524	42531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008044	ATCG	2	8	43542	43549	25 %	25 %	25 %	25 %	99079881
85	NC_008044	TGGC	2	8	43890	43897	0 %	25 %	50 %	25 %	99079882
86	NC_008044	GGCA	2	8	44335	44342	25 %	0 %	50 %	25 %	99079882
87	NC_008044	CTGC	2	8	44806	44813	0 %	25 %	25 %	50 %	99079882
88	NC_008044	GAGG	2	8	46110	46117	25 %	0 %	75 %	0 %	99079884
89	NC_008044	GAAA	2	8	46309	46316	75 %	0 %	25 %	0 %	99079884
90	NC_008044	CAGC	2	8	46423	46430	25 %	0 %	25 %	50 %	99079884
91	NC_008044	GGGC	2	8	46503	46510	0 %	0 %	75 %	25 %	99079884
92	NC_008044	GCAG	2	8	47002	47009	25 %	0 %	50 %	25 %	99079885
93	NC_008044	CTCG	2	8	47825	47832	0 %	25 %	25 %	50 %	99079886
94	NC_008044	TCGG	2	8	48069	48076	0 %	25 %	50 %	25 %	99079886
95	NC_008044	GGGC	2	8	48157	48164	0 %	0 %	75 %	25 %	99079886
96	NC_008044	GGCA	2	8	48178	48185	25 %	0 %	50 %	25 %	99079886
97	NC_008044	TCTT	2	8	48285	48292	0 %	75 %	0 %	25 %	99079886
98	NC_008044	GGCA	2	8	48622	48629	25 %	0 %	50 %	25 %	99079886
99	NC_008044	GCCA	2	8	49108	49115	25 %	0 %	25 %	50 %	99079886
100	NC_008044	CAGG	2	8	49960	49967	25 %	0 %	50 %	25 %	99079887
101	NC_008044	CAGC	2	8	50170	50177	25 %	0 %	25 %	50 %	99079887
102	NC_008044	CGAG	2	8	50412	50419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008044	GCAG	2	8	51006	51013	25 %	0 %	50 %	25 %	99079888
104	NC_008044	CTTC	2	8	51233	51240	0 %	50 %	0 %	50 %	99079888
105	NC_008044	GGGC	2	8	51466	51473	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008044	TGAG	2	8	51564	51571	25 %	25 %	50 %	0 %	99079889
107	NC_008044	ATTG	2	8	51631	51638	25 %	50 %	25 %	0 %	99079889
108	NC_008044	AACG	2	8	51659	51666	50 %	0 %	25 %	25 %	99079889
109	NC_008044	ACAA	2	8	51797	51804	75 %	0 %	0 %	25 %	99079889
110	NC_008044	TTCA	2	8	51914	51921	25 %	50 %	0 %	25 %	99079889
111	NC_008044	CCCG	2	8	52033	52040	0 %	0 %	25 %	75 %	99079889
112	NC_008044	CCCG	2	8	52342	52349	0 %	0 %	25 %	75 %	99079890
113	NC_008044	CTGG	2	8	53151	53158	0 %	25 %	50 %	25 %	99079891
114	NC_008044	GCAG	2	8	53390	53397	25 %	0 %	50 %	25 %	99079891
115	NC_008044	CTCA	2	8	53458	53465	25 %	25 %	0 %	50 %	99079891
116	NC_008044	GAAG	2	8	54094	54101	50 %	0 %	50 %	0 %	99079892
117	NC_008044	GCAA	2	8	54174	54181	50 %	0 %	25 %	25 %	99079892
118	NC_008044	GTTG	2	8	54959	54966	0 %	50 %	50 %	0 %	99079893
119	NC_008044	TGGT	2	8	55299	55306	0 %	50 %	50 %	0 %	99079893
120	NC_008044	GCGG	2	8	55601	55608	0 %	0 %	75 %	25 %	99079893
121	NC_008044	CGCC	2	8	56488	56495	0 %	0 %	25 %	75 %	99079894
122	NC_008044	GCAA	2	8	57205	57212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008044	GATG	2	8	57336	57343	25 %	25 %	50 %	0 %	99079895
124	NC_008044	TGCG	2	8	57926	57933	0 %	25 %	50 %	25 %	99079895
125	NC_008044	AATG	2	8	58838	58845	50 %	25 %	25 %	0 %	99079896
126	NC_008044	TCGC	2	8	59413	59420	0 %	25 %	25 %	50 %	99079898
127	NC_008044	GAGC	2	8	60868	60875	25 %	0 %	50 %	25 %	99079899
128	NC_008044	CGGG	2	8	60948	60955	0 %	0 %	75 %	25 %	99079899
129	NC_008044	CGGG	2	8	61081	61088	0 %	0 %	75 %	25 %	99079899
130	NC_008044	TGCG	2	8	61986	61993	0 %	25 %	50 %	25 %	99079900
131	NC_008044	GGGA	2	8	63539	63546	25 %	0 %	75 %	0 %	99079901
132	NC_008044	GGCT	2	8	63713	63720	0 %	25 %	50 %	25 %	99079901
133	NC_008044	GTCC	2	8	64909	64916	0 %	25 %	25 %	50 %	99079901
134	NC_008044	CCGT	2	8	65749	65756	0 %	25 %	25 %	50 %	99079901
135	NC_008044	TTCC	2	8	65802	65809	0 %	50 %	0 %	50 %	99079901
136	NC_008044	CGGG	2	8	66292	66299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008044	CCAA	2	8	66621	66628	50 %	0 %	0 %	50 %	99079902
138	NC_008044	ACCC	2	8	68072	68079	25 %	0 %	0 %	75 %	99079904
139	NC_008044	ATCC	2	8	68928	68935	25 %	25 %	0 %	50 %	99079905
140	NC_008044	GTCG	2	8	69045	69052	0 %	25 %	50 %	25 %	99079905
141	NC_008044	AGGT	2	8	69244	69251	25 %	25 %	50 %	0 %	99079905
142	NC_008044	CTTG	2	8	69904	69911	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008044	ACTC	2	8	70918	70925	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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497	NC_008044	CGCC	2	8	238267	238274	0 %	0 %	25 %	75 %	161899031
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