MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008044	AAGC	2	8	14215	14222	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008044	AGGA	2	8	24578	24585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008044	AGCC	2	8	34379	34386	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008044	TGGA	2	8	34397	34404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008044	GATC	2	8	42524	42531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008044	CGAG	2	8	50412	50419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008044	GGGC	2	8	51466	51473	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008044	GCAA	2	8	57205	57212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008044	CGGG	2	8	66292	66299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008044	CTTG	2	8	69904	69911	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008044	ACTC	2	8	70918	70925	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008044	TCCC	2	8	76284	76291	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_008044	TGTC	2	8	76411	76418	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008044	GAGG	2	8	78830	78837	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008044	TCTT	2	8	83258	83265	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008044	AGAA	2	8	83327	83334	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008044	GGGC	2	8	84968	84975	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008044	CGGG	2	8	87320	87327	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008044	GGCC	2	8	90547	90554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008044	CCCG	2	8	92287	92294	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_008044	CGGG	2	8	92343	92350	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008044	TGAT	2	8	96395	96402	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008044	TGTT	2	8	116231	116238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008044	GATC	2	8	119297	119304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008044	CACT	2	8	123848	123855	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008044	GCCC	2	8	131711	131718	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_008044	CGCT	2	8	132990	132997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008044	GAAA	2	8	133041	133048	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008044	TCAG	2	8	133067	133074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008044	CGGC	2	8	133085	133092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008044	TTGG	2	8	133217	133224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008044	GAAA	2	8	136494	136501	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008044	GCGG	2	8	137770	137777	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008044	CACC	2	8	140434	140441	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_008044	AACG	2	8	140486	140493	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008044	ATTG	2	8	142512	142519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008044	CGTG	3	12	142660	142671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008044	ACAG	2	8	144811	144818	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008044	GAAC	2	8	144981	144988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008044	CGAG	2	8	145017	145024	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008044	GTGA	2	8	145326	145333	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008044	CAAA	2	8	146479	146486	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008044	GTCT	2	8	146548	146555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008044	GTCA	2	8	146643	146650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008044	TGCC	2	8	147045	147052	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008044	GCGA	2	8	147613	147620	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008044	GGGC	2	8	148851	148858	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008044	GCCT	2	8	149606	149613	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008044	ACAT	2	8	150285	150292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008044	AAAT	2	8	150527	150534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008044	ACAA	2	8	150557	150564	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008044	TCAA	2	8	154655	154662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008044	ACAG	2	8	180786	180793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008044	GCAG	2	8	181573	181580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008044	CCCG	2	8	185246	185253	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_008044	TCTG	2	8	185476	185483	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008044	TGTT	2	8	187784	187791	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008044	AAAT	2	8	187954	187961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008044	CTGC	2	8	198028	198035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008044	CCTG	2	8	202071	202078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008044	AATG	2	8	202264	202271	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008044	CTTT	2	8	205269	205276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008044	ATTG	2	8	205367	205374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008044	CTTT	2	8	205429	205436	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008044	GAAG	2	8	205545	205552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008044	GGAC	2	8	206483	206490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008044	AAAG	2	8	213552	213559	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008044	ATTT	2	8	215116	215123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008044	GTCG	2	8	217744	217751	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008044	GCAA	2	8	217981	217988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008044	GTCC	2	8	218001	218008	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008044	GGAC	2	8	218168	218175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008044	TGTT	2	8	218208	218215	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008044	GACC	2	8	218249	218256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008044	CCCG	2	8	223519	223526	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_008044	GACA	2	8	227645	227652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008044	GGGC	2	8	233195	233202	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008044	GGGC	2	8	235845	235852	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008044	CTGG	2	8	235902	235909	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008044	TGCC	2	8	238382	238389	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008044	CGTG	2	8	239071	239078	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008044	GAAG	2	8	240290	240297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008044	GCGG	2	8	241355	241362	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008044	CTGA	2	8	245139	245146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008044	TTGT	2	8	247677	247684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008044	GGCG	2	8	256288	256295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008044	CTCC	2	8	262149	262156	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_008044	GGCG	2	8	264046	264053	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008044	ACCG	2	8	267026	267033	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008044	CGGA	2	8	291332	291339	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008044	CCAC	2	8	297022	297029	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_008044	ACGT	2	8	300204	300211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008044	GGGT	2	8	300281	300288	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008044	CATG	2	8	313940	313947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008044	GGTC	2	8	313973	313980	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008044	GTGC	2	8	314115	314122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008044	GGCG	3	12	314235	314246	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008044	CGGC	2	8	314250	314257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008044	CTGA	2	8	315951	315958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008044	CGGG	2	8	317900	317907	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008044	GCCC	2	8	317946	317953	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_008044	GGGT	2	8	319043	319050	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008044	TTGC	2	8	324115	324122	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008044	CATT	2	8	325486	325493	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008044	CAGA	2	8	335614	335621	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008044	CAGA	2	8	335626	335633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008044	ATTG	2	8	337486	337493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008044	CAGA	2	8	339294	339301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008044	ACGG	2	8	341974	341981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008044	AGCG	2	8	344835	344842	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008044	CTGC	2	8	347206	347213	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008044	AGCC	2	8	353877	353884	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008044	AGAA	2	8	353912	353919	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008044	GCCT	2	8	362979	362986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008044	TTTG	2	8	372759	372766	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008044	TTTA	3	12	377844	377855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008044	ACTG	2	8	377937	377944	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008044	AAAC	2	8	379141	379148	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008044	GGTT	2	8	382338	382345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008044	GTTG	2	8	383907	383914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008044	AGGC	2	8	395346	395353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008044	GAGC	2	8	395358	395365	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008044	GGAT	2	8	396663	396670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008044	TCCG	2	8	396731	396738	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008044	CCCG	2	8	396813	396820	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_008044	CTTG	2	8	404060	404067	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008044	CCGA	2	8	408614	408621	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008044	GCAA	2	8	408665	408672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008044	GCAG	2	8	414875	414882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008044	CTCC	2	8	418310	418317	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
131	NC_008044	GGCG	2	8	418379	418386	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008044	GAGG	2	8	428315	428322	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008044	CACC	2	8	430161	430168	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_008044	GGTG	2	8	430534	430541	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008044	CGTG	2	8	432789	432796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008044	CGGG	2	8	437280	437287	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008044	CTTT	2	8	437327	437334	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008044	GTGA	2	8	437416	437423	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008044	TCGG	2	8	442899	442906	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008044	GGGT	2	8	448348	448355	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008044	ATTG	2	8	451241	451248	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008044	CGTG	2	8	451931	451938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008044	CGGT	2	8	455249	455256	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008044	CAGA	2	8	456562	456569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008044	CAAA	2	8	459031	459038	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008044	ATTG	2	8	476413	476420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008044	TTCC	2	8	477098	477105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008044	CAGA	2	8	483141	483148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008044	ACTG	2	8	493287	493294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008044	CCGC	2	8	495109	495116	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_008044	GCAT	2	8	499475	499482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008044	GGCG	2	8	499725	499732	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
153	NC_008044	AGGG	2	8	499818	499825	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008044	GCGG	2	8	501850	501857	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
155	NC_008044	GATG	2	8	515363	515370	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008044	ATCA	2	8	525207	525214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_008044	GCAG	2	8	534344	534351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
158	NC_008044	AGGC	2	8	536211	536218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_008044	GCGA	2	8	536321	536328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_008044	CGGG	2	8	544089	544096	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
161	NC_008044	CAAT	2	8	553637	553644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_008044	GCCA	2	8	553672	553679	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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164	NC_008044	ACTT	2	8	562423	562430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
165	NC_008044	TTGC	2	8	569308	569315	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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168	NC_008044	GTTT	2	8	570416	570423	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_008044	TTAT	2	8	570529	570536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_008044	TTGT	2	8	570567	570574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_008044	CCAG	2	8	572568	572575	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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175	NC_008044	AAGT	2	8	588228	588235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_008044	CCGG	2	8	599317	599324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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185	NC_008044	AGGC	2	8	602158	602165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
186	NC_008044	CTAG	2	8	602247	602254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
187	NC_008044	AGCG	2	8	603346	603353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
188	NC_008044	GGCG	2	8	603373	603380	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
189	NC_008044	CTTC	2	8	603387	603394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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194	NC_008044	CTGG	2	8	632338	632345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
195	NC_008044	CTTT	2	8	633360	633367	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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232	NC_008044	GCAA	2	8	762736	762743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
233	NC_008044	TGTT	2	8	766151	766158	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_008044	CGGA	2	8	857705	857712	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
262	NC_008044	GAGC	2	8	872392	872399	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
263	NC_008044	CACC	2	8	872795	872802	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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279	NC_008044	AGGA	2	8	942734	942741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
280	NC_008044	CGAC	2	8	942793	942800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
281	NC_008044	GATG	2	8	943979	943986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
282	NC_008044	GAAA	2	8	944014	944021	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_008044	CGGG	2	8	944324	944331	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
284	NC_008044	AGCG	2	8	947759	947766	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
285	NC_008044	GCCC	2	8	949853	949860	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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294	NC_008044	ATTT	2	8	972986	972993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_008044	TGCC	2	8	978137	978144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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481	NC_008044	GAAA	2	8	1629273	1629280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
482	NC_008044	CCCG	2	8	1657906	1657913	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
483	NC_008044	GGTT	2	8	1660460	1660467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
484	NC_008044	GCAT	2	8	1661198	1661205	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
485	NC_008044	GCAC	2	8	1663971	1663978	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
486	NC_008044	TCGG	2	8	1670655	1670662	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_008044	CAGC	2	8	1671431	1671438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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491	NC_008044	CCCT	2	8	1680643	1680650	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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498	NC_008044	ACCA	2	8	1705668	1705675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
499	NC_008044	GTTT	2	8	1711900	1711907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_008044	GAAC	2	8	1725130	1725137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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