MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 9842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008044	CG	3	6	497	502	0 %	0 %	50 %	50 %	99079842
2	NC_008044	AC	3	6	573	578	50 %	0 %	0 %	50 %	99079842
3	NC_008044	GC	3	6	1154	1159	0 %	0 %	50 %	50 %	99079842
4	NC_008044	GC	3	6	1263	1268	0 %	0 %	50 %	50 %	99079842
5	NC_008044	CG	3	6	2594	2599	0 %	0 %	50 %	50 %	99079843
6	NC_008044	GA	3	6	2757	2762	50 %	0 %	50 %	0 %	99079843
7	NC_008044	GC	3	6	3087	3092	0 %	0 %	50 %	50 %	99079844
8	NC_008044	GC	3	6	3109	3114	0 %	0 %	50 %	50 %	99079844
9	NC_008044	GC	5	10	3793	3802	0 %	0 %	50 %	50 %	99079844
10	NC_008044	CG	3	6	3964	3969	0 %	0 %	50 %	50 %	99079844
11	NC_008044	CG	4	8	5022	5029	0 %	0 %	50 %	50 %	99079846
12	NC_008044	CG	3	6	5209	5214	0 %	0 %	50 %	50 %	99079846
13	NC_008044	GC	3	6	6898	6903	0 %	0 %	50 %	50 %	99079848
14	NC_008044	CG	4	8	6980	6987	0 %	0 %	50 %	50 %	99079848
15	NC_008044	TG	3	6	6999	7004	0 %	50 %	50 %	0 %	99079848
16	NC_008044	CT	3	6	7005	7010	0 %	50 %	0 %	50 %	99079848
17	NC_008044	AG	3	6	7085	7090	50 %	0 %	50 %	0 %	99079848
18	NC_008044	GC	3	6	7179	7184	0 %	0 %	50 %	50 %	99079848
19	NC_008044	GC	3	6	7200	7205	0 %	0 %	50 %	50 %	99079848
20	NC_008044	GC	5	10	7400	7409	0 %	0 %	50 %	50 %	99079848
21	NC_008044	GC	3	6	8076	8081	0 %	0 %	50 %	50 %	99079848
22	NC_008044	CG	3	6	9949	9954	0 %	0 %	50 %	50 %	99079850
23	NC_008044	GC	3	6	10133	10138	0 %	0 %	50 %	50 %	99079850
24	NC_008044	GC	4	8	10141	10148	0 %	0 %	50 %	50 %	99079850
25	NC_008044	CG	3	6	10150	10155	0 %	0 %	50 %	50 %	99079850
26	NC_008044	CG	3	6	11116	11121	0 %	0 %	50 %	50 %	99079851
27	NC_008044	CG	3	6	12430	12435	0 %	0 %	50 %	50 %	99079851
28	NC_008044	TA	3	6	12617	12622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008044	CG	3	6	12647	12652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008044	GC	3	6	13044	13049	0 %	0 %	50 %	50 %	99079852
31	NC_008044	CG	3	6	13362	13367	0 %	0 %	50 %	50 %	99079853
32	NC_008044	CG	3	6	14611	14616	0 %	0 %	50 %	50 %	99079854
33	NC_008044	CG	3	6	14896	14901	0 %	0 %	50 %	50 %	99079854
34	NC_008044	CG	3	6	15095	15100	0 %	0 %	50 %	50 %	99079855
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41	NC_008044	GC	3	6	18507	18512	0 %	0 %	50 %	50 %	99079858
42	NC_008044	GC	3	6	18660	18665	0 %	0 %	50 %	50 %	99079858
43	NC_008044	GC	3	6	18668	18673	0 %	0 %	50 %	50 %	99079858
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45	NC_008044	GC	3	6	19495	19500	0 %	0 %	50 %	50 %	99079859
46	NC_008044	CG	3	6	19938	19943	0 %	0 %	50 %	50 %	99079859
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49	NC_008044	GC	4	8	21259	21266	0 %	0 %	50 %	50 %	99079860
50	NC_008044	GC	3	6	21274	21279	0 %	0 %	50 %	50 %	99079860
51	NC_008044	AC	3	6	21413	21418	50 %	0 %	0 %	50 %	99079860
52	NC_008044	CG	3	6	21840	21845	0 %	0 %	50 %	50 %	99079860
53	NC_008044	GC	3	6	21874	21879	0 %	0 %	50 %	50 %	99079860
54	NC_008044	GA	3	6	22987	22992	50 %	0 %	50 %	0 %	99079861
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61	NC_008044	CG	3	6	25796	25801	0 %	0 %	50 %	50 %	99079866
62	NC_008044	GC	3	6	27608	27613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008044	GC	3	6	27670	27675	0 %	0 %	50 %	50 %	99079869
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65	NC_008044	GC	3	6	28178	28183	0 %	0 %	50 %	50 %	99079869
66	NC_008044	GC	3	6	28273	28278	0 %	0 %	50 %	50 %	99079869
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72	NC_008044	CT	3	6	31149	31154	0 %	50 %	0 %	50 %	99079871
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79	NC_008044	AC	3	6	33231	33236	50 %	0 %	0 %	50 %	99079873
80	NC_008044	GA	3	6	33357	33362	50 %	0 %	50 %	0 %	99079873
81	NC_008044	GC	4	8	34508	34515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008044	GC	3	6	34540	34545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008044	CG	3	6	35653	35658	0 %	0 %	50 %	50 %	99079874
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104	NC_008044	GC	3	6	43232	43237	0 %	0 %	50 %	50 %	99079881
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107	NC_008044	GC	3	6	43794	43799	0 %	0 %	50 %	50 %	99079882
108	NC_008044	GC	3	6	43941	43946	0 %	0 %	50 %	50 %	99079882
109	NC_008044	AC	3	6	44044	44049	50 %	0 %	0 %	50 %	99079882
110	NC_008044	CG	3	6	44227	44232	0 %	0 %	50 %	50 %	99079882
111	NC_008044	AG	3	6	44609	44614	50 %	0 %	50 %	0 %	99079882
112	NC_008044	GA	3	6	44761	44766	50 %	0 %	50 %	0 %	99079882
113	NC_008044	CG	4	8	44889	44896	0 %	0 %	50 %	50 %	99079883
114	NC_008044	AG	3	6	45072	45077	50 %	0 %	50 %	0 %	99079883
115	NC_008044	GC	4	8	45192	45199	0 %	0 %	50 %	50 %	99079883
116	NC_008044	CG	3	6	45407	45412	0 %	0 %	50 %	50 %	99079883
117	NC_008044	GA	3	6	45487	45492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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123	NC_008044	CG	3	6	47969	47974	0 %	0 %	50 %	50 %	99079886
124	NC_008044	AT	3	6	48027	48032	50 %	50 %	0 %	0 %	99079886
125	NC_008044	CG	4	8	48083	48090	0 %	0 %	50 %	50 %	99079886
126	NC_008044	GA	3	6	48853	48858	50 %	0 %	50 %	0 %	99079886
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128	NC_008044	GA	3	6	49287	49292	50 %	0 %	50 %	0 %	99079886
129	NC_008044	GC	3	6	49448	49453	0 %	0 %	50 %	50 %	99079886
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131	NC_008044	GA	4	8	49762	49769	50 %	0 %	50 %	0 %	99079887
132	NC_008044	GC	4	8	49842	49849	0 %	0 %	50 %	50 %	99079887
133	NC_008044	CG	3	6	49880	49885	0 %	0 %	50 %	50 %	99079887
134	NC_008044	CT	3	6	50295	50300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008044	GT	3	6	51419	51424	0 %	50 %	50 %	0 %	99079888
136	NC_008044	GC	4	8	52441	52448	0 %	0 %	50 %	50 %	99079890
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140	NC_008044	CG	3	6	53556	53561	0 %	0 %	50 %	50 %	99079891
141	NC_008044	CG	3	6	53580	53585	0 %	0 %	50 %	50 %	99079891
142	NC_008044	GA	3	6	53950	53955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008044	GC	3	6	54088	54093	0 %	0 %	50 %	50 %	99079892
144	NC_008044	GA	3	6	54701	54706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008044	GC	3	6	55548	55553	0 %	0 %	50 %	50 %	99079893
146	NC_008044	GT	3	6	55931	55936	0 %	50 %	50 %	0 %	99079893
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