MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 1756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008043	AAGA	2	8	450	457	75 %	0 %	25 %	0 %	99078010
2	NC_008043	AGCC	2	8	1075	1082	25 %	0 %	25 %	50 %	99078011
3	NC_008043	CCGC	2	8	1091	1098	0 %	0 %	25 %	75 %	99078011
4	NC_008043	ATGG	2	8	1185	1192	25 %	25 %	50 %	0 %	99078011
5	NC_008043	AGCG	2	8	2089	2096	25 %	0 %	50 %	25 %	99078012
6	NC_008043	CGGT	2	8	3593	3600	0 %	25 %	50 %	25 %	99078014
7	NC_008043	CGAC	2	8	4029	4036	25 %	0 %	25 %	50 %	99078014
8	NC_008043	AAGC	2	8	4347	4354	50 %	0 %	25 %	25 %	99078014
9	NC_008043	TGTC	2	8	4402	4409	0 %	50 %	25 %	25 %	99078014
10	NC_008043	TTGA	2	8	4448	4455	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008043	GTTG	2	8	4935	4942	0 %	50 %	50 %	0 %	99078015
12	NC_008043	GCAG	2	8	5463	5470	25 %	0 %	50 %	25 %	99078016
13	NC_008043	TGGC	2	8	5987	5994	0 %	25 %	50 %	25 %	99078016
14	NC_008043	CGAA	2	8	6031	6038	50 %	0 %	25 %	25 %	99078016
15	NC_008043	AGAA	2	8	6702	6709	75 %	0 %	25 %	0 %	99078017
16	NC_008043	ACCT	2	8	6809	6816	25 %	25 %	0 %	50 %	99078017
17	NC_008043	ACGC	2	8	7199	7206	25 %	0 %	25 %	50 %	99078018
18	NC_008043	CGGG	2	8	7271	7278	0 %	0 %	75 %	25 %	99078018
19	NC_008043	GGGC	2	8	8426	8433	0 %	0 %	75 %	25 %	99078019
20	NC_008043	GGGC	2	8	9131	9138	0 %	0 %	75 %	25 %	99078019
21	NC_008043	CGGG	2	8	10297	10304	0 %	0 %	75 %	25 %	99078019
22	NC_008043	GGGT	2	8	10388	10395	0 %	25 %	75 %	0 %	99078019
23	NC_008043	CTGC	2	8	11542	11549	0 %	25 %	25 %	50 %	99078020
24	NC_008043	ACCC	2	8	12182	12189	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_008043	TCGT	2	8	12722	12729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008043	CTGG	2	8	13287	13294	0 %	25 %	50 %	25 %	99078021
27	NC_008043	GGAT	2	8	13827	13834	25 %	25 %	50 %	0 %	99078022
28	NC_008043	GGAA	2	8	14233	14240	50 %	0 %	50 %	0 %	99078022
29	NC_008043	GAAA	2	8	14830	14837	75 %	0 %	25 %	0 %	99078023
30	NC_008043	GACG	2	8	16757	16764	25 %	0 %	50 %	25 %	99078025
31	NC_008043	CGCC	2	8	17506	17513	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_008043	CGAG	2	8	17984	17991	25 %	0 %	50 %	25 %	99078027
33	NC_008043	GTTG	2	8	18236	18243	0 %	50 %	50 %	0 %	99078027
34	NC_008043	ATCA	2	8	18693	18700	50 %	25 %	0 %	25 %	99078027
35	NC_008043	GGCT	2	8	19235	19242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008043	TTTG	2	8	19248	19255	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008043	TGGC	2	8	19554	19561	0 %	25 %	50 %	25 %	99078028
38	NC_008043	AAAG	2	8	19858	19865	75 %	0 %	25 %	0 %	99078028
39	NC_008043	GCCC	2	8	20340	20347	0 %	0 %	25 %	75 %	99078029
40	NC_008043	AGCC	2	8	22191	22198	25 %	0 %	25 %	50 %	99078030
41	NC_008043	CCAG	2	8	23024	23031	25 %	0 %	25 %	50 %	99078031
42	NC_008043	CCGC	2	8	24511	24518	0 %	0 %	25 %	75 %	99078033
43	NC_008043	TGCG	2	8	24750	24757	0 %	25 %	50 %	25 %	99078033
44	NC_008043	TCCG	2	8	24955	24962	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008043	CCGC	2	8	25465	25472	0 %	0 %	25 %	75 %	99078035
46	NC_008043	CATC	2	8	25706	25713	25 %	25 %	0 %	50 %	99078035
47	NC_008043	CGCC	2	8	26249	26256	0 %	0 %	25 %	75 %	99078036
48	NC_008043	ACCA	2	8	26499	26506	50 %	0 %	0 %	50 %	99078036
49	NC_008043	GGTG	2	8	26532	26539	0 %	25 %	75 %	0 %	99078036
50	NC_008043	GCGG	2	8	26750	26757	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008043	CGGG	2	8	27111	27118	0 %	0 %	75 %	25 %	99078037
52	NC_008043	AGCC	2	8	27691	27698	25 %	0 %	25 %	50 %	99078037
53	NC_008043	AGGC	2	8	28156	28163	25 %	0 %	50 %	25 %	99078037
54	NC_008043	CGGG	2	8	28321	28328	0 %	0 %	75 %	25 %	99078037
55	NC_008043	CCGA	2	8	28821	28828	25 %	0 %	25 %	50 %	99078038
56	NC_008043	CGGG	2	8	29317	29324	0 %	0 %	75 %	25 %	99078038
57	NC_008043	TCCG	2	8	29436	29443	0 %	25 %	25 %	50 %	99078038
58	NC_008043	CAGG	2	8	30048	30055	25 %	0 %	50 %	25 %	99078039
59	NC_008043	CTCA	2	8	30527	30534	25 %	25 %	0 %	50 %	99078040
60	NC_008043	TGTT	2	8	31518	31525	0 %	75 %	25 %	0 %	99078041
61	NC_008043	CGAC	2	8	31878	31885	25 %	0 %	25 %	50 %	99078042
62	NC_008043	CGGG	2	8	32022	32029	0 %	0 %	75 %	25 %	99078042
63	NC_008043	AGCC	2	8	32407	32414	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008043	GTCA	2	8	33022	33029	25 %	25 %	25 %	25 %	99078043
65	NC_008043	GCCC	2	8	33894	33901	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_008043	GGTG	2	8	34467	34474	0 %	25 %	75 %	0 %	99078044
67	NC_008043	CCAG	2	8	34532	34539	25 %	0 %	25 %	50 %	99078044
68	NC_008043	GCGG	2	8	34940	34947	0 %	0 %	75 %	25 %	99078044
69	NC_008043	GCCA	2	8	35578	35585	25 %	0 %	25 %	50 %	99078044
70	NC_008043	GGGC	2	8	36193	36200	0 %	0 %	75 %	25 %	99078044
71	NC_008043	CAGC	2	8	36372	36379	25 %	0 %	25 %	50 %	99078044
72	NC_008043	ATCT	2	8	36616	36623	25 %	50 %	0 %	25 %	99078044
73	NC_008043	GCAG	2	8	37152	37159	25 %	0 %	50 %	25 %	99078044
74	NC_008043	CTGC	2	8	37204	37211	0 %	25 %	25 %	50 %	99078044
75	NC_008043	GCCC	2	8	37655	37662	0 %	0 %	25 %	75 %	99078045
76	NC_008043	GGTC	2	8	38554	38561	0 %	25 %	50 %	25 %	99078046
77	NC_008043	CAAG	2	8	38636	38643	50 %	0 %	25 %	25 %	99078046
78	NC_008043	TGGC	2	8	39295	39302	0 %	25 %	50 %	25 %	99078047
79	NC_008043	GATG	2	8	39403	39410	25 %	25 %	50 %	0 %	99078047
80	NC_008043	CCCG	2	8	39556	39563	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_008043	GACC	2	8	39673	39680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008043	CGCA	2	8	39926	39933	25 %	0 %	25 %	50 %	99078048
83	NC_008043	GCGG	2	8	40675	40682	0 %	0 %	75 %	25 %	99078048
84	NC_008043	CCCG	2	8	41038	41045	0 %	0 %	25 %	75 %	99078049
85	NC_008043	CCTG	2	8	41316	41323	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008043	CGCC	2	8	41371	41378	0 %	0 %	25 %	75 %	99078050
87	NC_008043	GATC	2	8	41380	41387	25 %	25 %	25 %	25 %	99078050
88	NC_008043	CATC	2	8	42150	42157	25 %	25 %	0 %	50 %	99078050
89	NC_008043	CTGC	2	8	42664	42671	0 %	25 %	25 %	50 %	99078051
90	NC_008043	CTGG	2	8	42972	42979	0 %	25 %	50 %	25 %	99078051
91	NC_008043	CGCC	2	8	43224	43231	0 %	0 %	25 %	75 %	99078051
92	NC_008043	CTGC	2	8	44820	44827	0 %	25 %	25 %	50 %	99078054
93	NC_008043	ACCC	2	8	44932	44939	25 %	0 %	0 %	75 %	99078054
94	NC_008043	GGTG	2	8	45597	45604	0 %	25 %	75 %	0 %	99078054
95	NC_008043	ATGG	2	8	45625	45632	25 %	25 %	50 %	0 %	99078054
96	NC_008043	CCGA	2	8	46755	46762	25 %	0 %	25 %	50 %	99078056
97	NC_008043	CGCA	2	8	47507	47514	25 %	0 %	25 %	50 %	99078057
98	NC_008043	AGGC	2	8	47988	47995	25 %	0 %	50 %	25 %	99078057
99	NC_008043	TACA	2	8	48164	48171	50 %	25 %	0 %	25 %	99078057
100	NC_008043	GTGG	2	8	48745	48752	0 %	25 %	75 %	0 %	99078058
101	NC_008043	AGGC	2	8	49788	49795	25 %	0 %	50 %	25 %	99078059
102	NC_008043	GGGC	2	8	49957	49964	0 %	0 %	75 %	25 %	99078059
103	NC_008043	ACCA	2	8	51415	51422	50 %	0 %	0 %	50 %	99078060
104	NC_008043	ATGT	2	8	51833	51840	25 %	50 %	25 %	0 %	99078061
105	NC_008043	TCGG	2	8	52652	52659	0 %	25 %	50 %	25 %	99078062
106	NC_008043	CCTG	2	8	52707	52714	0 %	25 %	25 %	50 %	99078062
107	NC_008043	CTGC	2	8	53350	53357	0 %	25 %	25 %	50 %	99078063
108	NC_008043	TTCT	2	8	53444	53451	0 %	75 %	0 %	25 %	99078063
109	NC_008043	TTAT	2	8	53484	53491	25 %	75 %	0 %	0 %	99078063
110	NC_008043	TCTG	2	8	53514	53521	0 %	50 %	25 %	25 %	99078063
111	NC_008043	CATG	2	8	53924	53931	25 %	25 %	25 %	25 %	99078064
112	NC_008043	ACCA	2	8	54012	54019	50 %	0 %	0 %	50 %	99078064
113	NC_008043	AGTG	2	8	54514	54521	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008043	GATC	2	8	54803	54810	25 %	25 %	25 %	25 %	99078065
115	NC_008043	GACG	2	8	55118	55125	25 %	0 %	50 %	25 %	99078065
116	NC_008043	TGAT	2	8	55159	55166	25 %	50 %	25 %	0 %	99078065
117	NC_008043	GGGC	2	8	55186	55193	0 %	0 %	75 %	25 %	99078065
118	NC_008043	CGTG	2	8	55793	55800	0 %	25 %	50 %	25 %	99078065
119	NC_008043	TACC	2	8	56737	56744	25 %	25 %	0 %	50 %	99078066
120	NC_008043	CGCC	2	8	56928	56935	0 %	0 %	25 %	75 %	99078066
121	NC_008043	ATTC	2	8	57628	57635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008043	GAAT	2	8	58647	58654	50 %	25 %	25 %	0 %	99078067
123	NC_008043	TGGA	2	8	59281	59288	25 %	25 %	50 %	0 %	99078067
124	NC_008043	AGAC	2	8	59426	59433	50 %	0 %	25 %	25 %	99078067
125	NC_008043	ATCT	2	8	59803	59810	25 %	50 %	0 %	25 %	99078067
126	NC_008043	TCAT	2	8	60204	60211	25 %	50 %	0 %	25 %	99078068
127	NC_008043	GCCA	2	8	60947	60954	25 %	0 %	25 %	50 %	99078069
128	NC_008043	AGAC	2	8	61456	61463	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008043	GCCA	2	8	61471	61478	25 %	0 %	25 %	50 %	99078070
130	NC_008043	CGCC	2	8	62094	62101	0 %	0 %	25 %	75 %	99078070
131	NC_008043	AAGA	2	8	62664	62671	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008043	TCCT	2	8	63078	63085	0 %	50 %	0 %	50 %	99078072
133	NC_008043	GCGG	2	8	63330	63337	0 %	0 %	75 %	25 %	99078072
134	NC_008043	GGAA	2	8	64442	64449	50 %	0 %	50 %	0 %	99078073
135	NC_008043	CCGC	2	8	65057	65064	0 %	0 %	25 %	75 %	99078073
136	NC_008043	CTGG	2	8	66682	66689	0 %	25 %	50 %	25 %	99078075
137	NC_008043	CGGG	2	8	67249	67256	0 %	0 %	75 %	25 %	99078075
138	NC_008043	CCAA	2	8	68325	68332	50 %	0 %	0 %	50 %	99078076
139	NC_008043	ACCA	2	8	68403	68410	50 %	0 %	0 %	50 %	99078076
140	NC_008043	TCAG	2	8	68706	68713	25 %	25 %	25 %	25 %	99078077
141	NC_008043	CGGG	2	8	69211	69218	0 %	0 %	75 %	25 %	99078077
142	NC_008043	GCCC	2	8	69733	69740	0 %	0 %	25 %	75 %	99078078
143	NC_008043	GGTC	2	8	70067	70074	0 %	25 %	50 %	25 %	99078078
144	NC_008043	GCAG	2	8	70081	70088	25 %	0 %	50 %	25 %	99078078
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