MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 1146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008043	CGA	2	6	3378	3383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008043	TCC	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008043	CTG	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008043	AGA	2	6	5248	5253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008043	ATT	2	6	7774	7779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008043	CTG	2	6	7834	7839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008043	GCG	2	6	7900	7905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008043	CAT	2	6	7932	7937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008043	TCT	2	6	7997	8002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008043	TAC	2	6	8009	8014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008043	CCA	2	6	11194	11199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008043	GCC	2	6	11214	11219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_008043	GTC	2	6	12159	12164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008043	TAA	2	6	12263	12268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008043	GCG	2	6	12440	12445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008043	TCA	2	6	12714	12719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008043	CCG	2	6	12808	12813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008043	GCG	2	6	17521	17526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008043	TCC	2	6	24362	24367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008043	TGG	2	6	24875	24880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008043	GCA	2	6	24901	24906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008043	CTC	2	6	26758	26763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_008043	TCA	2	6	28665	28670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008043	CGG	2	6	37830	37835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008043	GTC	2	6	38684	38689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008043	AGC	2	6	39648	39653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008043	GCG	2	6	39660	39665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008043	CCT	2	6	39687	39692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008043	CCT	2	6	39710	39715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_008043	GCC	2	6	41293	41298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008043	CGG	2	6	43308	43313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008043	TTG	2	6	43349	43354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008043	GTT	2	6	43393	43398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008043	GTC	2	6	43428	43433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008043	GGC	2	6	43436	43441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008043	GGC	2	6	44060	44065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008043	GCC	2	6	44076	44081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_008043	GTT	2	6	44441	44446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008043	CAC	2	6	44476	44481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008043	GCG	2	6	44539	44544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008043	GTC	2	6	45970	45975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008043	GTG	2	6	46032	46037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008043	GAC	2	6	49217	49222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008043	GCA	2	6	52068	52073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008043	GCA	2	6	52089	52094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008043	GCC	2	6	52095	52100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008043	ACT	2	6	52123	52128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008043	ATG	2	6	54319	54324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008043	GCT	2	6	54378	54383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008043	GCG	2	6	54481	54486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008043	CAA	2	6	55999	56004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008043	TGA	2	6	56025	56030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008043	GAG	2	6	56305	56310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008043	AGA	2	6	56401	56406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008043	AGA	2	6	56422	56427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008043	ATG	2	6	56476	56481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008043	CTG	2	6	57201	57206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008043	TGC	2	6	57266	57271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008043	GAC	2	6	57320	57325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008043	CAC	2	6	57352	57357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_008043	TTG	2	6	57525	57530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008043	GTA	2	6	57543	57548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008043	ACA	2	6	61269	61274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008043	ACG	2	6	61307	61312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008043	TGC	2	6	61347	61352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008043	CCG	2	6	61374	61379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008043	CGG	2	6	63726	63731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008043	GCG	2	6	69417	69422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008043	TTA	2	6	75996	76001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008043	TGA	2	6	76008	76013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008043	CCT	2	6	79194	79199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_008043	GGC	2	6	79207	79212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008043	CTC	2	6	79288	79293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_008043	TTG	2	6	79312	79317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008043	CTC	2	6	81775	81780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_008043	CAC	2	6	81833	81838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_008043	GCC	2	6	81877	81882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_008043	GCT	2	6	81934	81939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008043	ACC	2	6	84609	84614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_008043	GCC	2	6	86451	86456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_008043	GGA	2	6	86457	86462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008043	TGA	2	6	91160	91165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008043	GGA	2	6	91327	91332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008043	GCG	2	6	92031	92036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008043	GAT	2	6	92098	92103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008043	CAT	2	6	92722	92727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008043	TGC	2	6	92841	92846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008043	TGC	2	6	92904	92909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008043	GCA	2	6	93724	93729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008043	GCT	2	6	93735	93740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008043	GCT	2	6	93863	93868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008043	AGC	2	6	93901	93906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008043	CAT	2	6	93935	93940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008043	ATG	2	6	94590	94595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008043	GAT	2	6	94660	94665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008043	GCA	2	6	94720	94725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008043	GCG	2	6	94762	94767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008043	CCG	2	6	94797	94802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_008043	TCG	2	6	94905	94910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008043	TGC	2	6	94932	94937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008043	CGT	2	6	95043	95048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008043	CAG	2	6	95127	95132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008043	TGA	2	6	96350	96355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008043	CTC	2	6	97229	97234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_008043	TGT	2	6	97545	97550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008043	TGA	2	6	97591	97596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008043	TGC	2	6	97652	97657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008043	CTG	2	6	97666	97671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008043	CGG	2	6	97679	97684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008043	TGC	2	6	97810	97815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008043	CCG	2	6	97816	97821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_008043	GAC	2	6	97885	97890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008043	CTT	2	6	97947	97952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008043	CGG	2	6	97971	97976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008043	CAA	2	6	99431	99436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008043	TGG	3	9	99450	99458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008043	CGG	2	6	99683	99688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008043	GCG	2	6	99697	99702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008043	GCC	2	6	99749	99754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_008043	ACA	2	6	99812	99817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008043	GTT	2	6	100330	100335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008043	CTC	2	6	101466	101471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_008043	CAA	2	6	101536	101541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008043	CAA	2	6	101566	101571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008043	AGG	2	6	101759	101764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008043	GCT	2	6	101767	101772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008043	TCA	2	6	101840	101845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008043	TCC	2	6	101867	101872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_008043	TCC	2	6	106243	106248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_008043	CTC	2	6	106270	106275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_008043	CGT	2	6	106339	106344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008043	TGG	2	6	106392	106397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008043	CTC	2	6	108487	108492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008043	TGA	2	6	108669	108674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008043	CGC	2	6	108726	108731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_008043	CAA	2	6	111376	111381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008043	CCA	2	6	111571	111576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_008043	GTT	2	6	111724	111729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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