MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 9580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008043	GCG	2	6	39	44	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078010
2	NC_008043	CCA	2	6	55	60	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078010
3	NC_008043	CCA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078010
4	NC_008043	TGC	2	6	136	141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078010
5	NC_008043	GAG	2	6	261	266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078010
6	NC_008043	TCG	2	6	271	276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078010
7	NC_008043	TCG	2	6	328	333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078010
8	NC_008043	GCC	2	6	381	386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078010
9	NC_008043	TGA	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078010
10	NC_008043	CAA	2	6	611	616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078010
11	NC_008043	GAT	2	6	648	653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078010
12	NC_008043	GAA	2	6	750	755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078010
13	NC_008043	CGC	2	6	770	775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078010
14	NC_008043	TTC	2	6	801	806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078010
15	NC_008043	GCC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078011
16	NC_008043	TGC	2	6	940	945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078011
17	NC_008043	GCC	2	6	975	980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078011
18	NC_008043	CGG	2	6	1067	1072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078011
19	NC_008043	GCT	2	6	1124	1129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078011
20	NC_008043	AGC	2	6	1223	1228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078011
21	NC_008043	CGA	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078011
22	NC_008043	GCT	2	6	1452	1457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078011
23	NC_008043	GAG	2	6	1614	1619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078011
24	NC_008043	TGG	2	6	1630	1635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078011
25	NC_008043	CGC	2	6	1807	1812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078012
26	NC_008043	ACG	2	6	1864	1869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078012
27	NC_008043	GCA	2	6	2027	2032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078012
28	NC_008043	ACC	2	6	2128	2133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078012
29	NC_008043	TCA	2	6	2179	2184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078012
30	NC_008043	GCA	2	6	2210	2215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078012
31	NC_008043	GCC	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078012
32	NC_008043	CAC	2	6	2490	2495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078012
33	NC_008043	GCC	3	9	2538	2546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078012
34	NC_008043	CTC	2	6	2602	2607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078013
35	NC_008043	CCG	2	6	2610	2615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078013
36	NC_008043	ACC	2	6	2714	2719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078013
37	NC_008043	GCG	2	6	2737	2742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078013
38	NC_008043	ATC	2	6	2842	2847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078013
39	NC_008043	GCC	2	6	2956	2961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078013
40	NC_008043	GAT	2	6	3025	3030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078013
41	NC_008043	GCA	2	6	3105	3110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078013
42	NC_008043	GCA	2	6	3530	3535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078014
43	NC_008043	TTG	2	6	3539	3544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078014
44	NC_008043	TGA	2	6	3561	3566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078014
45	NC_008043	GCT	2	6	3575	3580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078014
46	NC_008043	TGG	2	6	3669	3674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078014
47	NC_008043	GAT	2	6	3808	3813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078014
48	NC_008043	AAT	2	6	3898	3903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99078014
49	NC_008043	GCG	2	6	3933	3938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078014
50	NC_008043	TCT	2	6	4074	4079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078014
51	NC_008043	GCC	2	6	4156	4161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078014
52	NC_008043	CCA	2	6	4326	4331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078014
53	NC_008043	GCG	2	6	4361	4366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078014
54	NC_008043	GCG	3	9	4379	4387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078014
55	NC_008043	AGC	2	6	4514	4519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078015
56	NC_008043	CGG	2	6	4631	4636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078015
57	NC_008043	ATG	2	6	4703	4708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078015
58	NC_008043	ATC	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078015
59	NC_008043	TGG	2	6	4793	4798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078015
60	NC_008043	CGC	2	6	4827	4832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078015
61	NC_008043	CAT	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078015
62	NC_008043	CCA	2	6	4950	4955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078015
63	NC_008043	CCA	2	6	4965	4970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078015
64	NC_008043	CCA	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078015
65	NC_008043	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078015
66	NC_008043	CAA	2	6	5103	5108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078015
67	NC_008043	GCG	2	6	5128	5133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078015
68	NC_008043	GAA	2	6	5409	5414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078016
69	NC_008043	CGC	2	6	5442	5447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078016
70	NC_008043	CGG	2	6	5493	5498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078016
71	NC_008043	TCA	2	6	5555	5560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078016
72	NC_008043	GCC	2	6	5569	5574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078016
73	NC_008043	TGA	2	6	5583	5588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078016
74	NC_008043	GGT	3	9	5736	5744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078016
75	NC_008043	GAG	2	6	5827	5832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078016
76	NC_008043	CTG	2	6	5833	5838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078016
77	NC_008043	GCG	2	6	6073	6078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078016
78	NC_008043	GAC	2	6	6081	6086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078016
79	NC_008043	TCA	2	6	6339	6344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078017
80	NC_008043	CTT	2	6	6346	6351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078017
81	NC_008043	CGC	2	6	6360	6365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078017
82	NC_008043	GTT	2	6	6376	6381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078017
83	NC_008043	CGA	2	6	6444	6449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078017
84	NC_008043	GCC	2	6	6536	6541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078017
85	NC_008043	GAT	2	6	6568	6573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078017
86	NC_008043	ATC	2	6	6581	6586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078017
87	NC_008043	GCC	2	6	6596	6601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078017
88	NC_008043	ACT	2	6	6627	6632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078017
89	NC_008043	GCC	2	6	6710	6715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078017
90	NC_008043	CTT	2	6	6739	6744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078017
91	NC_008043	GCC	2	6	6749	6754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078017
92	NC_008043	CAA	2	6	6817	6822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078017
93	NC_008043	TGC	2	6	6896	6901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078018
94	NC_008043	TCA	2	6	6941	6946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078018
95	NC_008043	CGC	2	6	7047	7052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078018
96	NC_008043	CAA	2	6	7128	7133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078018
97	NC_008043	GCG	2	6	7261	7266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078018
98	NC_008043	CAG	3	9	7279	7287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078018
99	NC_008043	GCG	2	6	7395	7400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078018
100	NC_008043	GCG	3	9	7487	7495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078018
101	NC_008043	GCT	2	6	8079	8084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078019
102	NC_008043	GAA	2	6	8091	8096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078019
103	NC_008043	TGA	2	6	8162	8167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078019
104	NC_008043	AGG	2	6	8203	8208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078019
105	NC_008043	GAA	3	9	8214	8222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078019
106	NC_008043	TTC	2	6	8250	8255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078019
107	NC_008043	CGC	2	6	8321	8326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078019
108	NC_008043	GCG	2	6	8374	8379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078019
109	NC_008043	GAC	2	6	8385	8390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078019
110	NC_008043	CGT	2	6	8417	8422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078019
111	NC_008043	GCG	2	6	8455	8460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078019
112	NC_008043	CCG	2	6	8743	8748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078019
113	NC_008043	ACT	2	6	8833	8838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078019
114	NC_008043	ATG	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078019
115	NC_008043	AAC	2	6	8964	8969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078019
116	NC_008043	TTA	2	6	9019	9024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99078019
117	NC_008043	GCT	2	6	9125	9130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078019
118	NC_008043	TCA	2	6	9151	9156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078019
119	NC_008043	GGC	2	6	9165	9170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078019
120	NC_008043	TGG	2	6	9275	9280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078019
121	NC_008043	GGC	2	6	9294	9299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078019
122	NC_008043	CGA	2	6	9305	9310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078019
123	NC_008043	TGG	2	6	9320	9325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078019
124	NC_008043	CGA	2	6	9332	9337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078019
125	NC_008043	GCT	2	6	9368	9373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078019
126	NC_008043	GAC	2	6	9414	9419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078019
127	NC_008043	TTG	2	6	9424	9429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078019
128	NC_008043	GCG	2	6	9430	9435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078019
129	NC_008043	CGA	2	6	9440	9445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078019
130	NC_008043	TGG	2	6	9536	9541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078019
131	NC_008043	CAT	2	6	9581	9586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078019
132	NC_008043	CGG	4	12	9590	9601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078019
133	NC_008043	GGC	2	6	9618	9623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078019
134	NC_008043	TGG	2	6	9644	9649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078019
135	NC_008043	CGA	2	6	9650	9655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078019
136	NC_008043	GAC	2	6	9657	9662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078019
137	NC_008043	TGG	2	6	9671	9676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078019
138	NC_008043	CGA	2	6	9683	9688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078019
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140	NC_008043	ACC	2	6	9723	9728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078019
141	NC_008043	GGC	2	6	9753	9758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078019
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147	NC_008043	TCG	2	6	9997	10002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078019
148	NC_008043	GAC	2	6	10158	10163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078019
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154	NC_008043	CGA	2	6	10439	10444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078019
155	NC_008043	ACC	2	6	10521	10526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078019
156	NC_008043	CTG	2	6	10731	10736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078019
157	NC_008043	CGG	2	6	10742	10747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078019
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161	NC_008043	GGA	2	6	10883	10888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078019
162	NC_008043	TGA	2	6	10918	10923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078019
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254	NC_008043	CGA	2	6	20352	20357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078029
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