MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 2007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008043	CG	4	8	1000	1007	0 %	0 %	50 %	50 %	99078011
2	NC_008043	CG	3	6	1052	1057	0 %	0 %	50 %	50 %	99078011
3	NC_008043	CT	3	6	1373	1378	0 %	50 %	0 %	50 %	99078011
4	NC_008043	GC	3	6	1461	1466	0 %	0 %	50 %	50 %	99078011
5	NC_008043	GC	3	6	1500	1505	0 %	0 %	50 %	50 %	99078011
6	NC_008043	GC	3	6	1706	1711	0 %	0 %	50 %	50 %	99078011
7	NC_008043	GC	3	6	1937	1942	0 %	0 %	50 %	50 %	99078012
8	NC_008043	GA	3	6	2002	2007	50 %	0 %	50 %	0 %	99078012
9	NC_008043	AG	3	6	2578	2583	50 %	0 %	50 %	0 %	99078012
10	NC_008043	CG	3	6	3041	3046	0 %	0 %	50 %	50 %	99078013
11	NC_008043	CG	3	6	3585	3590	0 %	0 %	50 %	50 %	99078014
12	NC_008043	CT	3	6	3716	3721	0 %	50 %	0 %	50 %	99078014
13	NC_008043	GC	3	6	3891	3896	0 %	0 %	50 %	50 %	99078014
14	NC_008043	GC	3	6	4107	4112	0 %	0 %	50 %	50 %	99078014
15	NC_008043	GC	3	6	4320	4325	0 %	0 %	50 %	50 %	99078014
16	NC_008043	TC	3	6	4476	4481	0 %	50 %	0 %	50 %	99078015
17	NC_008043	TG	3	6	4499	4504	0 %	50 %	50 %	0 %	99078015
18	NC_008043	GC	3	6	4524	4529	0 %	0 %	50 %	50 %	99078015
19	NC_008043	GC	3	6	4582	4587	0 %	0 %	50 %	50 %	99078015
20	NC_008043	GC	3	6	4778	4783	0 %	0 %	50 %	50 %	99078015
21	NC_008043	CG	3	6	4843	4848	0 %	0 %	50 %	50 %	99078015
22	NC_008043	GC	3	6	5627	5632	0 %	0 %	50 %	50 %	99078016
23	NC_008043	GC	3	6	5729	5734	0 %	0 %	50 %	50 %	99078016
24	NC_008043	GC	3	6	5993	5998	0 %	0 %	50 %	50 %	99078016
25	NC_008043	GC	3	6	6261	6266	0 %	0 %	50 %	50 %	99078017
26	NC_008043	CT	3	6	6655	6660	0 %	50 %	0 %	50 %	99078017
27	NC_008043	CG	3	6	7303	7308	0 %	0 %	50 %	50 %	99078018
28	NC_008043	GC	3	6	8942	8947	0 %	0 %	50 %	50 %	99078019
29	NC_008043	GC	3	6	9039	9044	0 %	0 %	50 %	50 %	99078019
30	NC_008043	GC	3	6	10838	10843	0 %	0 %	50 %	50 %	99078019
31	NC_008043	GC	3	6	10889	10894	0 %	0 %	50 %	50 %	99078019
32	NC_008043	CG	3	6	11261	11266	0 %	0 %	50 %	50 %	99078020
33	NC_008043	CG	3	6	11432	11437	0 %	0 %	50 %	50 %	99078020
34	NC_008043	CA	3	6	13035	13040	50 %	0 %	0 %	50 %	99078021
35	NC_008043	CG	3	6	13198	13203	0 %	0 %	50 %	50 %	99078021
36	NC_008043	CT	3	6	13515	13520	0 %	50 %	0 %	50 %	99078022
37	NC_008043	CG	3	6	14095	14100	0 %	0 %	50 %	50 %	99078022
38	NC_008043	GC	3	6	14275	14280	0 %	0 %	50 %	50 %	99078022
39	NC_008043	GC	3	6	14541	14546	0 %	0 %	50 %	50 %	99078022
40	NC_008043	CT	3	6	14643	14648	0 %	50 %	0 %	50 %	99078023
41	NC_008043	CG	3	6	14960	14965	0 %	0 %	50 %	50 %	99078023
42	NC_008043	GC	3	6	15513	15518	0 %	0 %	50 %	50 %	99078024
43	NC_008043	CG	5	10	15658	15667	0 %	0 %	50 %	50 %	99078024
44	NC_008043	CG	3	6	15714	15719	0 %	0 %	50 %	50 %	99078024
45	NC_008043	GC	3	6	15971	15976	0 %	0 %	50 %	50 %	99078025
46	NC_008043	CG	3	6	16307	16312	0 %	0 %	50 %	50 %	99078025
47	NC_008043	CG	3	6	16341	16346	0 %	0 %	50 %	50 %	99078025
48	NC_008043	GC	3	6	16796	16801	0 %	0 %	50 %	50 %	99078025
49	NC_008043	AG	3	6	16882	16887	50 %	0 %	50 %	0 %	99078025
50	NC_008043	GC	3	6	17267	17272	0 %	0 %	50 %	50 %	99078026
51	NC_008043	GC	3	6	17706	17711	0 %	0 %	50 %	50 %	99078027
52	NC_008043	TG	3	6	18450	18455	0 %	50 %	50 %	0 %	99078027
53	NC_008043	CG	3	6	18929	18934	0 %	0 %	50 %	50 %	99078027
54	NC_008043	GC	3	6	19416	19421	0 %	0 %	50 %	50 %	99078028
55	NC_008043	TG	3	6	19479	19484	0 %	50 %	50 %	0 %	99078028
56	NC_008043	GC	3	6	20044	20049	0 %	0 %	50 %	50 %	99078028
57	NC_008043	CG	3	6	20483	20488	0 %	0 %	50 %	50 %	99078029
58	NC_008043	CG	3	6	20590	20595	0 %	0 %	50 %	50 %	99078029
59	NC_008043	GC	3	6	21248	21253	0 %	0 %	50 %	50 %	99078029
60	NC_008043	GC	3	6	21389	21394	0 %	0 %	50 %	50 %	99078029
61	NC_008043	GC	3	6	21746	21751	0 %	0 %	50 %	50 %	99078030
62	NC_008043	CG	3	6	22159	22164	0 %	0 %	50 %	50 %	99078030
63	NC_008043	CG	3	6	22295	22300	0 %	0 %	50 %	50 %	99078030
64	NC_008043	CG	4	8	22519	22526	0 %	0 %	50 %	50 %	99078030
65	NC_008043	GC	3	6	22919	22924	0 %	0 %	50 %	50 %	99078031
66	NC_008043	AC	3	6	23240	23245	50 %	0 %	0 %	50 %	99078031
67	NC_008043	CG	3	6	23280	23285	0 %	0 %	50 %	50 %	99078031
68	NC_008043	GC	4	8	23349	23356	0 %	0 %	50 %	50 %	99078031
69	NC_008043	CG	3	6	23508	23513	0 %	0 %	50 %	50 %	99078031
70	NC_008043	CG	3	6	25173	25178	0 %	0 %	50 %	50 %	99078034
71	NC_008043	GC	3	6	25330	25335	0 %	0 %	50 %	50 %	99078035
72	NC_008043	CG	3	6	26051	26056	0 %	0 %	50 %	50 %	99078036
73	NC_008043	GC	3	6	26440	26445	0 %	0 %	50 %	50 %	99078036
74	NC_008043	CG	3	6	26923	26928	0 %	0 %	50 %	50 %	99078037
75	NC_008043	GC	3	6	27186	27191	0 %	0 %	50 %	50 %	99078037
76	NC_008043	GC	4	8	27451	27458	0 %	0 %	50 %	50 %	99078037
77	NC_008043	GC	3	6	27873	27878	0 %	0 %	50 %	50 %	99078037
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79	NC_008043	GC	3	6	29204	29209	0 %	0 %	50 %	50 %	99078038
80	NC_008043	CG	4	8	29371	29378	0 %	0 %	50 %	50 %	99078038
81	NC_008043	CG	3	6	29668	29673	0 %	0 %	50 %	50 %	99078038
82	NC_008043	GC	4	8	30019	30026	0 %	0 %	50 %	50 %	99078039
83	NC_008043	GC	3	6	30482	30487	0 %	0 %	50 %	50 %	99078039
84	NC_008043	GC	4	8	30660	30667	0 %	0 %	50 %	50 %	99078040
85	NC_008043	CG	3	6	30873	30878	0 %	0 %	50 %	50 %	99078040
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87	NC_008043	GC	3	6	31250	31255	0 %	0 %	50 %	50 %	99078041
88	NC_008043	CG	4	8	31462	31469	0 %	0 %	50 %	50 %	99078041
89	NC_008043	GC	5	10	31651	31660	0 %	0 %	50 %	50 %	99078041
90	NC_008043	GC	3	6	32667	32672	0 %	0 %	50 %	50 %	99078043
91	NC_008043	CG	3	6	32839	32844	0 %	0 %	50 %	50 %	99078043
92	NC_008043	GC	4	8	32987	32994	0 %	0 %	50 %	50 %	99078043
93	NC_008043	GC	4	8	33355	33362	0 %	0 %	50 %	50 %	99078043
94	NC_008043	GC	3	6	34239	34244	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
95	NC_008043	GC	4	8	34282	34289	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
96	NC_008043	GC	3	6	34362	34367	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
97	NC_008043	GC	4	8	36324	36331	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
98	NC_008043	CT	3	6	36541	36546	0 %	50 %	0 %	50 %	99078044
99	NC_008043	CT	3	6	36574	36579	0 %	50 %	0 %	50 %	99078044
100	NC_008043	GC	3	6	36583	36588	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
101	NC_008043	CG	3	6	37056	37061	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
102	NC_008043	GC	3	6	37122	37127	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
103	NC_008043	GC	3	6	37257	37262	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
104	NC_008043	GC	3	6	37366	37371	0 %	0 %	50 %	50 %	99078045
105	NC_008043	GC	3	6	38310	38315	0 %	0 %	50 %	50 %	99078046
106	NC_008043	GC	3	6	38486	38491	0 %	0 %	50 %	50 %	99078046
107	NC_008043	AT	3	6	39127	39132	50 %	50 %	0 %	0 %	99078047
108	NC_008043	GC	3	6	40198	40203	0 %	0 %	50 %	50 %	99078048
109	NC_008043	GC	3	6	40265	40270	0 %	0 %	50 %	50 %	99078048
110	NC_008043	GC	3	6	40664	40669	0 %	0 %	50 %	50 %	99078048
111	NC_008043	GC	4	8	40739	40746	0 %	0 %	50 %	50 %	99078049
112	NC_008043	GC	3	6	40814	40819	0 %	0 %	50 %	50 %	99078049
113	NC_008043	GC	3	6	40998	41003	0 %	0 %	50 %	50 %	99078049
114	NC_008043	GC	4	8	41713	41720	0 %	0 %	50 %	50 %	99078050
115	NC_008043	CG	3	6	41871	41876	0 %	0 %	50 %	50 %	99078050
116	NC_008043	CT	3	6	41936	41941	0 %	50 %	0 %	50 %	99078050
117	NC_008043	CG	5	10	42088	42097	0 %	0 %	50 %	50 %	99078050
118	NC_008043	CA	3	6	42299	42304	50 %	0 %	0 %	50 %	99078050
119	NC_008043	TC	3	6	43173	43178	0 %	50 %	0 %	50 %	99078051
120	NC_008043	GC	4	8	44744	44751	0 %	0 %	50 %	50 %	99078054
121	NC_008043	AT	3	6	45134	45139	50 %	50 %	0 %	0 %	99078054
122	NC_008043	CG	3	6	45439	45444	0 %	0 %	50 %	50 %	99078054
123	NC_008043	CG	3	6	45867	45872	0 %	0 %	50 %	50 %	99078054
124	NC_008043	GC	3	6	46267	46272	0 %	0 %	50 %	50 %	99078055
125	NC_008043	CG	3	6	46307	46312	0 %	0 %	50 %	50 %	99078055
126	NC_008043	GC	3	6	46410	46415	0 %	0 %	50 %	50 %	99078055
127	NC_008043	CA	3	6	46444	46449	50 %	0 %	0 %	50 %	99078055
128	NC_008043	CG	4	8	46555	46562	0 %	0 %	50 %	50 %	99078055
129	NC_008043	GC	3	6	46670	46675	0 %	0 %	50 %	50 %	99078056
130	NC_008043	CG	3	6	46736	46741	0 %	0 %	50 %	50 %	99078056
131	NC_008043	GC	3	6	46770	46775	0 %	0 %	50 %	50 %	99078056
132	NC_008043	CG	3	6	46986	46991	0 %	0 %	50 %	50 %	99078056
133	NC_008043	CG	3	6	47009	47014	0 %	0 %	50 %	50 %	99078056
134	NC_008043	CG	3	6	47874	47879	0 %	0 %	50 %	50 %	99078057
135	NC_008043	CG	3	6	48072	48077	0 %	0 %	50 %	50 %	99078057
136	NC_008043	GC	3	6	48395	48400	0 %	0 %	50 %	50 %	99078058
137	NC_008043	GC	3	6	48429	48434	0 %	0 %	50 %	50 %	99078058
138	NC_008043	GC	3	6	49057	49062	0 %	0 %	50 %	50 %	99078058
139	NC_008043	CG	4	8	50091	50098	0 %	0 %	50 %	50 %	99078059
140	NC_008043	GC	3	6	50722	50727	0 %	0 %	50 %	50 %	99078059
141	NC_008043	GC	3	6	50777	50782	0 %	0 %	50 %	50 %	99078059
142	NC_008043	GC	5	10	50923	50932	0 %	0 %	50 %	50 %	99078059
143	NC_008043	GC	3	6	50957	50962	0 %	0 %	50 %	50 %	99078059
144	NC_008043	GC	3	6	51447	51452	0 %	0 %	50 %	50 %	99078060
145	NC_008043	GC	4	8	51752	51759	0 %	0 %	50 %	50 %	99078061
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