MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 354

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008043	C	6	6	862	867	0 %	0 %	0 %	100 %	99078011
2	NC_008043	T	6	6	1670	1675	0 %	100 %	0 %	0 %	99078011
3	NC_008043	A	6	6	3212	3217	100 %	0 %	0 %	0 %	99078013
4	NC_008043	T	6	6	4336	4341	0 %	100 %	0 %	0 %	99078014
5	NC_008043	C	6	6	7512	7517	0 %	0 %	0 %	100 %	99078018
6	NC_008043	T	6	6	8763	8768	0 %	100 %	0 %	0 %	99078019
7	NC_008043	G	6	6	9482	9487	0 %	0 %	100 %	0 %	99078019
8	NC_008043	A	6	6	11780	11785	100 %	0 %	0 %	0 %	99078020
9	NC_008043	C	6	6	14582	14587	0 %	0 %	0 %	100 %	99078022
10	NC_008043	G	6	6	15681	15686	0 %	0 %	100 %	0 %	99078024
11	NC_008043	G	7	7	16256	16262	0 %	0 %	100 %	0 %	99078025
12	NC_008043	C	6	6	17202	17207	0 %	0 %	0 %	100 %	99078026
13	NC_008043	A	6	6	18372	18377	100 %	0 %	0 %	0 %	99078027
14	NC_008043	C	6	6	19012	19017	0 %	0 %	0 %	100 %	99078027
15	NC_008043	C	6	6	20345	20350	0 %	0 %	0 %	100 %	99078029
16	NC_008043	C	7	7	26967	26973	0 %	0 %	0 %	100 %	99078037
17	NC_008043	C	6	6	30215	30220	0 %	0 %	0 %	100 %	99078039
18	NC_008043	C	6	6	30945	30950	0 %	0 %	0 %	100 %	99078040
19	NC_008043	C	6	6	34505	34510	0 %	0 %	0 %	100 %	99078044
20	NC_008043	T	6	6	35293	35298	0 %	100 %	0 %	0 %	99078044
21	NC_008043	G	7	7	37282	37288	0 %	0 %	100 %	0 %	99078044
22	NC_008043	C	6	6	39752	39757	0 %	0 %	0 %	100 %	99078048
23	NC_008043	C	6	6	44263	44268	0 %	0 %	0 %	100 %	99078053
24	NC_008043	C	6	6	45665	45670	0 %	0 %	0 %	100 %	99078054
25	NC_008043	C	6	6	46378	46383	0 %	0 %	0 %	100 %	99078055
26	NC_008043	G	6	6	49662	49667	0 %	0 %	100 %	0 %	99078059
27	NC_008043	C	6	6	51161	51166	0 %	0 %	0 %	100 %	99078059
28	NC_008043	C	6	6	52369	52374	0 %	0 %	0 %	100 %	99078062
29	NC_008043	C	6	6	55416	55421	0 %	0 %	0 %	100 %	99078065
30	NC_008043	T	7	7	57672	57678	0 %	100 %	0 %	0 %	99078067
31	NC_008043	C	7	7	58788	58794	0 %	0 %	0 %	100 %	99078067
32	NC_008043	A	6	6	59303	59308	100 %	0 %	0 %	0 %	99078067
33	NC_008043	G	7	7	59490	59496	0 %	0 %	100 %	0 %	99078067
34	NC_008043	G	6	6	60191	60196	0 %	0 %	100 %	0 %	99078068
35	NC_008043	G	6	6	60369	60374	0 %	0 %	100 %	0 %	99078068
36	NC_008043	C	6	6	61482	61487	0 %	0 %	0 %	100 %	99078070
37	NC_008043	C	6	6	61859	61864	0 %	0 %	0 %	100 %	99078070
38	NC_008043	G	6	6	66844	66849	0 %	0 %	100 %	0 %	99078075
39	NC_008043	C	7	7	69853	69859	0 %	0 %	0 %	100 %	99078078
40	NC_008043	C	6	6	72717	72722	0 %	0 %	0 %	100 %	99078081
41	NC_008043	G	7	7	72930	72936	0 %	0 %	100 %	0 %	99078081
42	NC_008043	A	7	7	72950	72956	100 %	0 %	0 %	0 %	99078081
43	NC_008043	T	6	6	73324	73329	0 %	100 %	0 %	0 %	99078082
44	NC_008043	G	6	6	74216	74221	0 %	0 %	100 %	0 %	99078082
45	NC_008043	C	6	6	74572	74577	0 %	0 %	0 %	100 %	99078083
46	NC_008043	A	6	6	76913	76918	100 %	0 %	0 %	0 %	99078084
47	NC_008043	G	6	6	77876	77881	0 %	0 %	100 %	0 %	99078084
48	NC_008043	A	6	6	82894	82899	100 %	0 %	0 %	0 %	99078089
49	NC_008043	G	6	6	83742	83747	0 %	0 %	100 %	0 %	99078090
50	NC_008043	A	6	6	84865	84870	100 %	0 %	0 %	0 %	99078091
51	NC_008043	T	6	6	89405	89410	0 %	100 %	0 %	0 %	99078094
52	NC_008043	A	6	6	94027	94032	100 %	0 %	0 %	0 %	99078099
53	NC_008043	A	6	6	95344	95349	100 %	0 %	0 %	0 %	99078100
54	NC_008043	A	6	6	99090	99095	100 %	0 %	0 %	0 %	99078102
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63	NC_008043	C	6	6	126922	126927	0 %	0 %	0 %	100 %	99078124
64	NC_008043	C	6	6	127773	127778	0 %	0 %	0 %	100 %	99078124
65	NC_008043	C	7	7	129765	129771	0 %	0 %	0 %	100 %	99078126
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104	NC_008043	A	7	7	246756	246762	100 %	0 %	0 %	0 %	99078221
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106	NC_008043	T	6	6	247400	247405	0 %	100 %	0 %	0 %	99078222
107	NC_008043	C	8	8	247651	247658	0 %	0 %	0 %	100 %	99078222
108	NC_008043	A	6	6	249869	249874	100 %	0 %	0 %	0 %	99078224
109	NC_008043	C	6	6	253074	253079	0 %	0 %	0 %	100 %	99078230
110	NC_008043	C	6	6	253163	253168	0 %	0 %	0 %	100 %	99078230
111	NC_008043	C	6	6	254000	254005	0 %	0 %	0 %	100 %	99078231
112	NC_008043	T	6	6	255072	255077	0 %	100 %	0 %	0 %	99078231
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119	NC_008043	A	6	6	262147	262152	100 %	0 %	0 %	0 %	99078239
120	NC_008043	G	7	7	266508	266514	0 %	0 %	100 %	0 %	99078242
121	NC_008043	G	6	6	269895	269900	0 %	0 %	100 %	0 %	99078245
122	NC_008043	G	6	6	270585	270590	0 %	0 %	100 %	0 %	99078246
123	NC_008043	A	6	6	272694	272699	100 %	0 %	0 %	0 %	99078248
124	NC_008043	C	6	6	278383	278388	0 %	0 %	0 %	100 %	99078255
125	NC_008043	C	6	6	279423	279428	0 %	0 %	0 %	100 %	99078255
126	NC_008043	T	6	6	279506	279511	0 %	100 %	0 %	0 %	99078255
127	NC_008043	A	6	6	279583	279588	100 %	0 %	0 %	0 %	99078255
128	NC_008043	A	6	6	279778	279783	100 %	0 %	0 %	0 %	99078255
129	NC_008043	C	7	7	284281	284287	0 %	0 %	0 %	100 %	99078261
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131	NC_008043	A	6	6	292587	292592	100 %	0 %	0 %	0 %	99078264
132	NC_008043	C	7	7	295246	295252	0 %	0 %	0 %	100 %	99078268
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134	NC_008043	G	6	6	301188	301193	0 %	0 %	100 %	0 %	99078273
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138	NC_008043	C	6	6	321275	321280	0 %	0 %	0 %	100 %	99078288
139	NC_008043	G	7	7	324463	324469	0 %	0 %	100 %	0 %	99078291
140	NC_008043	C	6	6	327331	327336	0 %	0 %	0 %	100 %	99078294
141	NC_008043	A	6	6	328559	328564	100 %	0 %	0 %	0 %	99078295
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.