MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 plasmid unnamed

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008042	CTGGT	2	10	6093	6102	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008042	TGTTT	2	10	8354	8363	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008042	GTTTT	2	10	8715	8724	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008042	GATCA	2	10	8755	8764	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008042	GATGA	2	10	9124	9133	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008042	CAATT	2	10	9621	9630	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008042	TGATC	2	10	11586	11595	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008042	GAAGA	2	10	11730	11739	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008042	ACTTG	2	10	11776	11785	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008042	CACGA	2	10	12882	12891	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_008042	AATCC	2	10	13966	13975	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_008042	CCGTT	2	10	14755	14764	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008042	TGCTT	2	10	24664	24673	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008042	GGCAG	2	10	27501	27510	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008042	CTTTT	2	10	30010	30019	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008042	CATTC	2	10	32690	32699	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_008042	GGGAC	2	10	32950	32959	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008042	GCTTC	2	10	39757	39766	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008042	GTTTT	2	10	48952	48961	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008042	CGAAC	2	10	52411	52420	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008042	CTGCA	2	10	76593	76602	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008042	CCGGC	2	10	100189	100198	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_008042	CCGCC	2	10	111196	111205	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
24	NC_008042	TCGTC	2	10	115785	115794	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.