MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 plasmid unnamed

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008042	GA	3	6	13	18	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008042	AG	3	6	5356	5361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008042	CG	3	6	5518	5523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008042	GT	3	6	5682	5687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008042	CG	3	6	6507	6512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008042	CG	3	6	7628	7633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008042	AG	3	6	8372	8377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008042	CG	3	6	9358	9363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008042	TC	3	6	9964	9969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008042	TC	3	6	10225	10230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008042	TC	3	6	10272	10277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008042	GT	3	6	10617	10622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008042	TC	3	6	11928	11933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008042	CG	3	6	11994	11999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008042	GT	3	6	12584	12589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008042	GT	3	6	12731	12736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008042	TC	3	6	12945	12950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008042	GT	3	6	13100	13105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008042	CT	3	6	13294	13299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008042	CG	3	6	13379	13384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008042	CG	4	8	21842	21849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008042	CG	3	6	22073	22078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008042	AT	4	8	22229	22236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008042	CG	4	8	22348	22355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008042	TG	3	6	23497	23502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008042	CT	3	6	23732	23737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008042	TC	3	6	23985	23990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008042	GC	3	6	24216	24221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008042	GT	3	6	24996	25001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008042	AG	3	6	26759	26764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008042	GA	3	6	26908	26913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008042	TG	3	6	26967	26972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008042	TG	3	6	27059	27064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008042	GA	3	6	27113	27118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008042	AT	3	6	27192	27197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008042	GA	3	6	27451	27456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008042	GC	3	6	27660	27665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008042	CG	3	6	28986	28991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008042	GA	3	6	31189	31194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008042	TC	3	6	37415	37420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008042	CA	3	6	37681	37686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008042	GT	3	6	39068	39073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008042	GC	3	6	39490	39495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008042	GC	3	6	39552	39557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008042	TG	3	6	45457	45462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008042	CG	3	6	45499	45504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008042	AG	4	8	47722	47729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008042	CA	3	6	48527	48532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008042	CA	3	6	48578	48583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008042	CG	3	6	48859	48864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008042	CG	3	6	48933	48938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008042	AC	3	6	49429	49434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008042	GC	3	6	52356	52361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008042	GC	3	6	60529	60534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008042	AG	3	6	70836	70841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008042	AC	3	6	76496	76501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008042	TC	3	6	76623	76628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008042	TG	3	6	76774	76779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008042	AG	3	6	78259	78264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008042	GT	3	6	81139	81144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008042	GC	3	6	83717	83722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008042	CA	3	6	84045	84050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008042	CG	3	6	84053	84058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008042	CA	3	6	84118	84123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008042	GT	3	6	97343	97348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008042	CG	3	6	97429	97434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008042	AT	3	6	102614	102619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008042	GC	3	6	103234	103239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008042	GC	3	6	103341	103346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008042	CA	3	6	104876	104881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008042	CT	3	6	105533	105538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008042	CG	3	6	107207	107212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008042	GA	3	6	107427	107432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008042	CA	3	6	115814	115819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008042	CT	3	6	124006	124011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.