MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 plasmid unnamed

Total Repeats: 233

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008042	CA	3	6	164	169	50 %	0 %	0 %	50 %	99077903
2	NC_008042	AC	3	6	994	999	50 %	0 %	0 %	50 %	99077903
3	NC_008042	TC	3	6	1013	1018	0 %	50 %	0 %	50 %	99077903
4	NC_008042	CT	3	6	1065	1070	0 %	50 %	0 %	50 %	99077903
5	NC_008042	GC	3	6	1494	1499	0 %	0 %	50 %	50 %	99077903
6	NC_008042	TC	3	6	3335	3340	0 %	50 %	0 %	50 %	99077903
7	NC_008042	CT	3	6	3351	3356	0 %	50 %	0 %	50 %	99077903
8	NC_008042	AC	3	6	4114	4119	50 %	0 %	0 %	50 %	99077903
9	NC_008042	CG	3	6	5154	5159	0 %	0 %	50 %	50 %	99077903
10	NC_008042	AG	3	6	6611	6616	50 %	0 %	50 %	0 %	99077904
11	NC_008042	CG	3	6	7872	7877	0 %	0 %	50 %	50 %	99077905
12	NC_008042	GC	3	6	8061	8066	0 %	0 %	50 %	50 %	99077905
13	NC_008042	TC	3	6	14284	14289	0 %	50 %	0 %	50 %	99077906
14	NC_008042	AG	3	6	14546	14551	50 %	0 %	50 %	0 %	99077906
15	NC_008042	GC	3	6	15341	15346	0 %	0 %	50 %	50 %	99077907
16	NC_008042	GC	3	6	15736	15741	0 %	0 %	50 %	50 %	99077907
17	NC_008042	GC	3	6	16233	16238	0 %	0 %	50 %	50 %	99077908
18	NC_008042	GC	3	6	16283	16288	0 %	0 %	50 %	50 %	99077908
19	NC_008042	GC	3	6	16523	16528	0 %	0 %	50 %	50 %	99077908
20	NC_008042	CA	3	6	16904	16909	50 %	0 %	0 %	50 %	99077908
21	NC_008042	GC	3	6	17140	17145	0 %	0 %	50 %	50 %	99077908
22	NC_008042	CG	3	6	17737	17742	0 %	0 %	50 %	50 %	99077909
23	NC_008042	GC	3	6	17766	17771	0 %	0 %	50 %	50 %	99077909
24	NC_008042	GC	3	6	18455	18460	0 %	0 %	50 %	50 %	99077909
25	NC_008042	GC	3	6	19416	19421	0 %	0 %	50 %	50 %	99077910
26	NC_008042	GC	3	6	19655	19660	0 %	0 %	50 %	50 %	99077910
27	NC_008042	GC	4	8	19848	19855	0 %	0 %	50 %	50 %	99077910
28	NC_008042	GA	3	6	19901	19906	50 %	0 %	50 %	0 %	99077910
29	NC_008042	GC	3	6	20525	20530	0 %	0 %	50 %	50 %	99077911
30	NC_008042	CG	3	6	21128	21133	0 %	0 %	50 %	50 %	99077911
31	NC_008042	GC	3	6	21545	21550	0 %	0 %	50 %	50 %	99077911
32	NC_008042	GC	3	6	23130	23135	0 %	0 %	50 %	50 %	99077912
33	NC_008042	CG	3	6	23187	23192	0 %	0 %	50 %	50 %	99077912
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40	NC_008042	CG	3	6	29579	29584	0 %	0 %	50 %	50 %	99077916
41	NC_008042	CG	3	6	29639	29644	0 %	0 %	50 %	50 %	99077916
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49	NC_008042	TG	3	6	34873	34878	0 %	50 %	50 %	0 %	99077921
50	NC_008042	TG	3	6	37031	37036	0 %	50 %	50 %	0 %	99077923
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53	NC_008042	CG	3	6	42041	42046	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
54	NC_008042	CG	3	6	42079	42084	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
55	NC_008042	GC	3	6	42097	42102	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
56	NC_008042	CG	3	6	42189	42194	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
57	NC_008042	GC	3	6	42403	42408	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
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59	NC_008042	GC	3	6	42535	42540	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
60	NC_008042	GC	3	6	42577	42582	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
61	NC_008042	CG	3	6	42670	42675	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
62	NC_008042	GC	3	6	42804	42809	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
63	NC_008042	GA	3	6	43037	43042	50 %	0 %	50 %	0 %	99077928
64	NC_008042	CG	3	6	43197	43202	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
65	NC_008042	CG	3	6	43393	43398	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
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70	NC_008042	CG	3	6	44288	44293	0 %	0 %	50 %	50 %	99077929
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110	NC_008042	CG	3	6	65349	65354	0 %	0 %	50 %	50 %	99077949
111	NC_008042	GC	3	6	66378	66383	0 %	0 %	50 %	50 %	99077951
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.