MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Ruegeria sp. TM1040 plasmid unnamed

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008042	T	7	7	6689	6695	0 %	100 %	0 %	0 %	99077904
2	NC_008042	T	7	7	8361	8367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008042	G	6	6	8872	8877	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008042	C	6	6	10705	10710	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_008042	C	6	6	12525	12530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_008042	T	6	6	12692	12697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008042	A	6	6	14405	14410	100 %	0 %	0 %	0 %	99077906
8	NC_008042	G	6	6	16207	16212	0 %	0 %	100 %	0 %	99077908
9	NC_008042	G	6	6	17114	17119	0 %	0 %	100 %	0 %	99077908
10	NC_008042	A	7	7	17358	17364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008042	T	7	7	17426	17432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008042	C	6	6	17602	17607	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_008042	C	6	6	17675	17680	0 %	0 %	0 %	100 %	99077909
14	NC_008042	T	6	6	17990	17995	0 %	100 %	0 %	0 %	99077909
15	NC_008042	G	6	6	18294	18299	0 %	0 %	100 %	0 %	99077909
16	NC_008042	C	7	7	18543	18549	0 %	0 %	0 %	100 %	99077909
17	NC_008042	A	6	6	23710	23715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008042	G	6	6	24155	24160	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008042	T	6	6	24653	24658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008042	T	7	7	24947	24953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008042	A	6	6	29101	29106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008042	A	6	6	31203	31208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008042	T	6	6	31214	31219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008042	A	6	6	31222	31227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008042	G	6	6	33915	33920	0 %	0 %	100 %	0 %	99077921
26	NC_008042	C	6	6	35642	35647	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_008042	A	6	6	37499	37504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008042	C	6	6	38285	38290	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_008042	C	6	6	40229	40234	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_008042	A	6	6	44809	44814	100 %	0 %	0 %	0 %	99077929
31	NC_008042	G	6	6	45098	45103	0 %	0 %	100 %	0 %	99077929
32	NC_008042	A	6	6	49386	49391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008042	C	6	6	49542	49547	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_008042	A	7	7	52437	52443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008042	T	6	6	56226	56231	0 %	100 %	0 %	0 %	99077939
36	NC_008042	C	6	6	59415	59420	0 %	0 %	0 %	100 %	99077942
37	NC_008042	T	6	6	59785	59790	0 %	100 %	0 %	0 %	99077943
38	NC_008042	G	6	6	70167	70172	0 %	0 %	100 %	0 %	99077954
39	NC_008042	G	6	6	70624	70629	0 %	0 %	100 %	0 %	99077955
40	NC_008042	G	6	6	71212	71217	0 %	0 %	100 %	0 %	99077957
41	NC_008042	T	6	6	74514	74519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008042	C	6	6	77683	77688	0 %	0 %	0 %	100 %	99077966
43	NC_008042	T	6	6	79679	79684	0 %	100 %	0 %	0 %	99077967
44	NC_008042	A	6	6	82505	82510	100 %	0 %	0 %	0 %	99077969
45	NC_008042	A	6	6	85998	86003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008042	C	8	8	89685	89692	0 %	0 %	0 %	100 %	99077974
47	NC_008042	A	8	8	90429	90436	100 %	0 %	0 %	0 %	99077976
48	NC_008042	A	6	6	91660	91665	100 %	0 %	0 %	0 %	99077976
49	NC_008042	C	7	7	97588	97594	0 %	0 %	0 %	100 %	99077980
50	NC_008042	A	6	6	99633	99638	100 %	0 %	0 %	0 %	99077980
51	NC_008042	A	6	6	100407	100412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008042	T	8	8	100485	100492	0 %	100 %	0 %	0 %	99077981
53	NC_008042	A	6	6	100905	100910	100 %	0 %	0 %	0 %	99077981
54	NC_008042	A	6	6	101846	101851	100 %	0 %	0 %	0 %	99077981
55	NC_008042	A	6	6	101966	101971	100 %	0 %	0 %	0 %	99077981
56	NC_008042	A	6	6	102279	102284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008042	C	6	6	102717	102722	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_008042	T	8	8	103470	103477	0 %	100 %	0 %	0 %	99077984
59	NC_008042	T	6	6	103943	103948	0 %	100 %	0 %	0 %	99077984
60	NC_008042	T	7	7	107269	107275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008042	A	6	6	107287	107292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008042	A	6	6	107550	107555	100 %	0 %	0 %	0 %	99077988
63	NC_008042	C	6	6	109036	109041	0 %	0 %	0 %	100 %	99077989
64	NC_008042	T	7	7	109131	109137	0 %	100 %	0 %	0 %	99077990
65	NC_008042	C	6	6	110392	110397	0 %	0 %	0 %	100 %	99077991
66	NC_008042	A	7	7	110881	110887	100 %	0 %	0 %	0 %	99077991
67	NC_008042	A	6	6	111734	111739	100 %	0 %	0 %	0 %	99077992
68	NC_008042	A	7	7	114466	114472	100 %	0 %	0 %	0 %	99077995
69	NC_008042	C	6	6	114719	114724	0 %	0 %	0 %	100 %	99077995
70	NC_008042	A	6	6	114840	114845	100 %	0 %	0 %	0 %	99077995
71	NC_008042	C	7	7	115124	115130	0 %	0 %	0 %	100 %	99077995
72	NC_008042	C	7	7	115338	115344	0 %	0 %	0 %	100 %	99077996
73	NC_008042	A	6	6	115421	115426	100 %	0 %	0 %	0 %	99077996
74	NC_008042	A	8	8	115695	115702	100 %	0 %	0 %	0 %	99077996
75	NC_008042	A	6	6	118332	118337	100 %	0 %	0 %	0 %	99077998
76	NC_008042	G	7	7	118990	118996	0 %	0 %	100 %	0 %	99077999
77	NC_008042	A	6	6	123227	123232	100 %	0 %	0 %	0 %	99078001
78	NC_008042	T	6	6	125513	125518	0 %	100 %	0 %	0 %	99078004
79	NC_008042	A	6	6	126923	126928	100 %	0 %	0 %	0 %	99078004
80	NC_008042	C	7	7	128517	128523	0 %	0 %	0 %	100 %	99078006
81	NC_008042	C	6	6	130329	130334	0 %	0 %	0 %	100 %	99078007
82	NC_008042	G	6	6	130404	130409	0 %	0 %	100 %	0 %	99078007

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.