MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 plasmid unnamed

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008042	T	7	7	6689	6695	0 %	100 %	0 %	0 %	99077904
2	NC_008042	A	6	6	14405	14410	100 %	0 %	0 %	0 %	99077906
3	NC_008042	G	6	6	16207	16212	0 %	0 %	100 %	0 %	99077908
4	NC_008042	G	6	6	17114	17119	0 %	0 %	100 %	0 %	99077908
5	NC_008042	C	6	6	17675	17680	0 %	0 %	0 %	100 %	99077909
6	NC_008042	T	6	6	17990	17995	0 %	100 %	0 %	0 %	99077909
7	NC_008042	G	6	6	18294	18299	0 %	0 %	100 %	0 %	99077909
8	NC_008042	C	7	7	18543	18549	0 %	0 %	0 %	100 %	99077909
9	NC_008042	G	6	6	33915	33920	0 %	0 %	100 %	0 %	99077921
10	NC_008042	A	6	6	44809	44814	100 %	0 %	0 %	0 %	99077929
11	NC_008042	G	6	6	45098	45103	0 %	0 %	100 %	0 %	99077929
12	NC_008042	T	6	6	56226	56231	0 %	100 %	0 %	0 %	99077939
13	NC_008042	C	6	6	59415	59420	0 %	0 %	0 %	100 %	99077942
14	NC_008042	T	6	6	59785	59790	0 %	100 %	0 %	0 %	99077943
15	NC_008042	G	6	6	70167	70172	0 %	0 %	100 %	0 %	99077954
16	NC_008042	G	6	6	70624	70629	0 %	0 %	100 %	0 %	99077955
17	NC_008042	G	6	6	71212	71217	0 %	0 %	100 %	0 %	99077957
18	NC_008042	C	6	6	77683	77688	0 %	0 %	0 %	100 %	99077966
19	NC_008042	T	6	6	79679	79684	0 %	100 %	0 %	0 %	99077967
20	NC_008042	A	6	6	82505	82510	100 %	0 %	0 %	0 %	99077969
21	NC_008042	C	8	8	89685	89692	0 %	0 %	0 %	100 %	99077974
22	NC_008042	A	8	8	90429	90436	100 %	0 %	0 %	0 %	99077976
23	NC_008042	A	6	6	91660	91665	100 %	0 %	0 %	0 %	99077976
24	NC_008042	C	7	7	97588	97594	0 %	0 %	0 %	100 %	99077980
25	NC_008042	A	6	6	99633	99638	100 %	0 %	0 %	0 %	99077980
26	NC_008042	T	8	8	100485	100492	0 %	100 %	0 %	0 %	99077981
27	NC_008042	A	6	6	100905	100910	100 %	0 %	0 %	0 %	99077981
28	NC_008042	A	6	6	101846	101851	100 %	0 %	0 %	0 %	99077981
29	NC_008042	A	6	6	101966	101971	100 %	0 %	0 %	0 %	99077981
30	NC_008042	T	8	8	103470	103477	0 %	100 %	0 %	0 %	99077984
31	NC_008042	T	6	6	103943	103948	0 %	100 %	0 %	0 %	99077984
32	NC_008042	A	6	6	107550	107555	100 %	0 %	0 %	0 %	99077988
33	NC_008042	C	6	6	109036	109041	0 %	0 %	0 %	100 %	99077989
34	NC_008042	T	7	7	109131	109137	0 %	100 %	0 %	0 %	99077990
35	NC_008042	C	6	6	110392	110397	0 %	0 %	0 %	100 %	99077991
36	NC_008042	A	7	7	110881	110887	100 %	0 %	0 %	0 %	99077991
37	NC_008042	A	6	6	111734	111739	100 %	0 %	0 %	0 %	99077992
38	NC_008042	A	7	7	114466	114472	100 %	0 %	0 %	0 %	99077995
39	NC_008042	C	6	6	114719	114724	0 %	0 %	0 %	100 %	99077995
40	NC_008042	A	6	6	114840	114845	100 %	0 %	0 %	0 %	99077995
41	NC_008042	C	7	7	115124	115130	0 %	0 %	0 %	100 %	99077995
42	NC_008042	C	7	7	115338	115344	0 %	0 %	0 %	100 %	99077996
43	NC_008042	A	6	6	115421	115426	100 %	0 %	0 %	0 %	99077996
44	NC_008042	A	8	8	115695	115702	100 %	0 %	0 %	0 %	99077996
45	NC_008042	A	6	6	118332	118337	100 %	0 %	0 %	0 %	99077998
46	NC_008042	G	7	7	118990	118996	0 %	0 %	100 %	0 %	99077999
47	NC_008042	A	6	6	123227	123232	100 %	0 %	0 %	0 %	99078001
48	NC_008042	T	6	6	125513	125518	0 %	100 %	0 %	0 %	99078004
49	NC_008042	A	6	6	126923	126928	100 %	0 %	0 %	0 %	99078004
50	NC_008042	C	7	7	128517	128523	0 %	0 %	0 %	100 %	99078006
51	NC_008042	C	6	6	130329	130334	0 %	0 %	0 %	100 %	99078007
52	NC_008042	G	6	6	130404	130409	0 %	0 %	100 %	0 %	99078007

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.