MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 F plasmid

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008036	CAATG	2	10	892	901	40 %	20 %	20 %	20 %	98152872
2	NC_008036	CGGAT	2	10	1688	1697	20 %	20 %	40 %	20 %	98152873
3	NC_008036	CGCAG	2	10	2071	2080	20 %	0 %	40 %	40 %	98152874
4	NC_008036	GCGAT	2	10	3446	3455	20 %	20 %	40 %	20 %	98152874
5	NC_008036	GGCTT	2	10	4282	4291	0 %	40 %	40 %	20 %	98152874
6	NC_008036	TGAAA	2	10	4670	4679	60 %	20 %	20 %	0 %	98152874
7	NC_008036	GCGCG	2	10	5062	5071	0 %	0 %	60 %	40 %	98152875
8	NC_008036	GGACT	2	10	6023	6032	20 %	20 %	40 %	20 %	98152877
9	NC_008036	TTCGC	2	10	6584	6593	0 %	40 %	20 %	40 %	98152877
10	NC_008036	GCGCG	2	10	7199	7208	0 %	0 %	60 %	40 %	98152878
11	NC_008036	TTACA	2	10	8346	8355	40 %	40 %	0 %	20 %	98152878
12	NC_008036	GATGG	2	10	12631	12640	20 %	20 %	60 %	0 %	98152884
13	NC_008036	CGCGG	2	10	12939	12948	0 %	0 %	60 %	40 %	98152884
14	NC_008036	TCCGA	2	10	17361	17370	20 %	20 %	20 %	40 %	98152890
15	NC_008036	TGGGC	2	10	18583	18592	0 %	20 %	60 %	20 %	98152890
16	NC_008036	CGGGC	2	10	20798	20807	0 %	0 %	60 %	40 %	98152893
17	NC_008036	GGGCT	2	10	21057	21066	0 %	20 %	60 %	20 %	98152893
18	NC_008036	GAGCG	2	10	21375	21384	20 %	0 %	60 %	20 %	98152894
19	NC_008036	GGCAT	2	10	22595	22604	20 %	20 %	40 %	20 %	98152895
20	NC_008036	ATTCG	2	10	24475	24484	20 %	40 %	20 %	20 %	98152898
21	NC_008036	CCGCC	2	10	26977	26986	0 %	0 %	20 %	80 %	98152901
22	NC_008036	GGCCA	2	10	27985	27994	20 %	0 %	40 %	40 %	98152901

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.