MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 F plasmid

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008036	AC	3	6	292	297	50 %	0 %	0 %	50 %	98152872
2	NC_008036	TC	3	6	798	803	0 %	50 %	0 %	50 %	98152872
3	NC_008036	GC	3	6	1464	1469	0 %	0 %	50 %	50 %	98152873
4	NC_008036	GC	3	6	1608	1613	0 %	0 %	50 %	50 %	98152873
5	NC_008036	GC	3	6	2025	2030	0 %	0 %	50 %	50 %	98152874
6	NC_008036	GC	3	6	2113	2118	0 %	0 %	50 %	50 %	98152874
7	NC_008036	GC	3	6	2306	2311	0 %	0 %	50 %	50 %	98152874
8	NC_008036	CG	3	6	2328	2333	0 %	0 %	50 %	50 %	98152874
9	NC_008036	GC	3	6	2933	2938	0 %	0 %	50 %	50 %	98152874
10	NC_008036	CG	3	6	2957	2962	0 %	0 %	50 %	50 %	98152874
11	NC_008036	CG	3	6	3539	3544	0 %	0 %	50 %	50 %	98152874
12	NC_008036	CG	3	6	3837	3842	0 %	0 %	50 %	50 %	98152874
13	NC_008036	GC	3	6	4151	4156	0 %	0 %	50 %	50 %	98152874
14	NC_008036	CG	3	6	4370	4375	0 %	0 %	50 %	50 %	98152874
15	NC_008036	GC	3	6	4950	4955	0 %	0 %	50 %	50 %	98152875
16	NC_008036	CG	3	6	6086	6091	0 %	0 %	50 %	50 %	98152877
17	NC_008036	AG	3	6	6544	6549	50 %	0 %	50 %	0 %	98152877
18	NC_008036	GC	3	6	6629	6634	0 %	0 %	50 %	50 %	98152877
19	NC_008036	GC	3	6	6680	6685	0 %	0 %	50 %	50 %	98152877
20	NC_008036	CG	3	6	7178	7183	0 %	0 %	50 %	50 %	98152878
21	NC_008036	CG	5	10	7354	7363	0 %	0 %	50 %	50 %	98152878
22	NC_008036	GC	3	6	7681	7686	0 %	0 %	50 %	50 %	98152878
23	NC_008036	GC	3	6	8316	8321	0 %	0 %	50 %	50 %	98152878
24	NC_008036	CG	3	6	9615	9620	0 %	0 %	50 %	50 %	98152880
25	NC_008036	GC	3	6	10060	10065	0 %	0 %	50 %	50 %	98152881
26	NC_008036	GC	3	6	10072	10077	0 %	0 %	50 %	50 %	98152881
27	NC_008036	CA	3	6	10080	10085	50 %	0 %	0 %	50 %	98152881
28	NC_008036	GC	3	6	11425	11430	0 %	0 %	50 %	50 %	98152881
29	NC_008036	GC	3	6	12655	12660	0 %	0 %	50 %	50 %	98152884
30	NC_008036	CG	4	8	12996	13003	0 %	0 %	50 %	50 %	98152885
31	NC_008036	CG	3	6	14084	14089	0 %	0 %	50 %	50 %	98152886
32	NC_008036	GC	3	6	14264	14269	0 %	0 %	50 %	50 %	98152886
33	NC_008036	CG	3	6	14361	14366	0 %	0 %	50 %	50 %	98152886
34	NC_008036	CG	3	6	15791	15796	0 %	0 %	50 %	50 %	98152889
35	NC_008036	CG	3	6	15866	15871	0 %	0 %	50 %	50 %	98152889
36	NC_008036	CG	3	6	16376	16381	0 %	0 %	50 %	50 %	98152889
37	NC_008036	GC	3	6	17048	17053	0 %	0 %	50 %	50 %	98152890
38	NC_008036	CG	3	6	17419	17424	0 %	0 %	50 %	50 %	98152890
39	NC_008036	CG	3	6	17574	17579	0 %	0 %	50 %	50 %	98152890
40	NC_008036	GC	3	6	17640	17645	0 %	0 %	50 %	50 %	98152890
41	NC_008036	GC	3	6	17732	17737	0 %	0 %	50 %	50 %	98152890
42	NC_008036	TC	3	6	17867	17872	0 %	50 %	0 %	50 %	98152890
43	NC_008036	CG	5	10	18021	18030	0 %	0 %	50 %	50 %	98152890
44	NC_008036	CG	3	6	18070	18075	0 %	0 %	50 %	50 %	98152890
45	NC_008036	GC	3	6	18958	18963	0 %	0 %	50 %	50 %	98152890
46	NC_008036	GA	3	6	19226	19231	50 %	0 %	50 %	0 %	98152890
47	NC_008036	CG	3	6	19505	19510	0 %	0 %	50 %	50 %	98152891
48	NC_008036	CG	3	6	21860	21865	0 %	0 %	50 %	50 %	98152894
49	NC_008036	CG	3	6	21922	21927	0 %	0 %	50 %	50 %	98152894
50	NC_008036	GC	3	6	22282	22287	0 %	0 %	50 %	50 %	98152894
51	NC_008036	CG	3	6	22305	22310	0 %	0 %	50 %	50 %	98152894
52	NC_008036	CG	3	6	24483	24488	0 %	0 %	50 %	50 %	98152898
53	NC_008036	TC	3	6	24813	24818	0 %	50 %	0 %	50 %	98152899
54	NC_008036	CG	3	6	27298	27303	0 %	0 %	50 %	50 %	98152901
55	NC_008036	CG	3	6	27507	27512	0 %	0 %	50 %	50 %	98152901
56	NC_008036	GC	3	6	28085	28090	0 %	0 %	50 %	50 %	98152901

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.