MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 1428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008023	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	94991499
2	NC_008023	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	94991500
3	NC_008023	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	94991501
4	NC_008023	GATTT	2	10	6138	6147	20 %	60 %	20 %	0 %	94991503
5	NC_008023	ATTAA	2	10	11967	11976	60 %	40 %	0 %	0 %	94991508
6	NC_008023	TTTAT	2	10	15288	15297	20 %	80 %	0 %	0 %	94991512
7	NC_008023	TACAC	2	10	15917	15926	40 %	20 %	0 %	40 %	94991512
8	NC_008023	TAAAT	2	10	15927	15936	60 %	40 %	0 %	0 %	94991512
9	NC_008023	ACATT	2	10	16494	16503	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008023	TCGTG	2	10	18116	18125	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008023	GTTAA	2	10	19012	19021	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008023	GGGAG	2	10	19531	19540	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008023	AGGGA	2	10	21742	21751	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008023	GCTTA	2	10	22108	22117	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008023	TCGTG	2	10	24117	24126	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008023	GTTAA	2	10	25013	25022	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008023	GGGAG	2	10	25532	25541	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008023	AGGGA	2	10	27743	27752	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008023	GCTTA	2	10	28109	28118	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008023	TTTTC	2	10	29941	29950	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008023	CTTTT	2	10	30049	30058	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008023	TATAA	2	10	32162	32171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008023	AGTGA	2	10	32909	32918	40 %	20 %	40 %	0 %	94991516
24	NC_008023	ATTTT	2	10	33608	33617	20 %	80 %	0 %	0 %	94991517
25	NC_008023	TTGAT	2	10	33797	33806	20 %	60 %	20 %	0 %	94991517
26	NC_008023	TGGTG	2	10	35881	35890	0 %	40 %	60 %	0 %	94991520
27	NC_008023	AGCAG	2	10	43129	43138	40 %	0 %	40 %	20 %	94991524
28	NC_008023	GGTCA	2	10	43493	43502	20 %	20 %	40 %	20 %	94991524
29	NC_008023	TTGGG	2	10	43889	43898	0 %	40 %	60 %	0 %	94991525
30	NC_008023	GCAGG	2	10	47969	47978	20 %	0 %	60 %	20 %	94991527
31	NC_008023	CTCAG	2	10	49326	49335	20 %	20 %	20 %	40 %	94991529
32	NC_008023	TACTA	2	10	50964	50973	40 %	40 %	0 %	20 %	94991530
33	NC_008023	AAATT	2	10	51257	51266	60 %	40 %	0 %	0 %	94991531
34	NC_008023	CAAAT	2	10	51471	51480	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008023	TCGGA	2	10	54230	54239	20 %	20 %	40 %	20 %	94991534
36	NC_008023	GCTTT	2	10	56976	56985	0 %	60 %	20 %	20 %	94991537
37	NC_008023	TTTTC	2	10	57174	57183	0 %	80 %	0 %	20 %	94991537
38	NC_008023	AAACC	2	10	57239	57248	60 %	0 %	0 %	40 %	94991537
39	NC_008023	ATGGT	2	10	59013	59022	20 %	40 %	40 %	0 %	94991538
40	NC_008023	ATTCA	2	10	59697	59706	40 %	40 %	0 %	20 %	94991538
41	NC_008023	ATTTT	2	10	60962	60971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008023	AAATA	2	10	62230	62239	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008023	TATAT	2	10	62315	62324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008023	TTTTA	2	10	63469	63478	20 %	80 %	0 %	0 %	94991542
45	NC_008023	AAAGC	2	10	63662	63671	60 %	0 %	20 %	20 %	94991542
46	NC_008023	TTTGG	2	10	67656	67665	0 %	60 %	40 %	0 %	94991550
47	NC_008023	TTCAC	2	10	68012	68021	20 %	40 %	0 %	40 %	94991551
48	NC_008023	GAAAT	2	10	69093	69102	60 %	20 %	20 %	0 %	94991553
49	NC_008023	AAGGA	2	10	70176	70185	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008023	TCCAA	2	10	74795	74804	40 %	20 %	0 %	40 %	162139139
51	NC_008023	GTTTC	2	10	77444	77453	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_008023	TCGTG	2	10	80702	80711	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008023	GTTAA	2	10	81598	81607	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008023	GGGAG	2	10	82117	82126	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008023	AGGGA	2	10	84328	84337	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008023	GCTTA	2	10	84694	84703	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008023	ATTAT	2	10	84984	84993	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008023	TATAT	2	10	85067	85076	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008023	CTTGG	2	10	89004	89013	0 %	40 %	40 %	20 %	94991579
60	NC_008023	TCTTA	2	10	89422	89431	20 %	60 %	0 %	20 %	94991579
61	NC_008023	CACTC	2	10	90968	90977	20 %	20 %	0 %	60 %	94991581
62	NC_008023	GATTG	2	10	93229	93238	20 %	40 %	40 %	0 %	94991582
63	NC_008023	TTGAT	2	10	103370	103379	20 %	60 %	20 %	0 %	94991587
64	NC_008023	AAATC	2	10	103538	103547	60 %	20 %	0 %	20 %	94991587
65	NC_008023	TGAAG	2	10	108854	108863	40 %	20 %	40 %	0 %	94991596
66	NC_008023	AGAAA	2	10	110295	110304	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008023	TTTAG	2	10	110564	110573	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008023	TTTAG	2	10	110713	110722	20 %	60 %	20 %	0 %	94991599
69	NC_008023	GTGTT	2	10	115117	115126	0 %	60 %	40 %	0 %	94991605
70	NC_008023	TTAAG	2	10	115317	115326	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008023	TAGGT	2	10	115940	115949	20 %	40 %	40 %	0 %	94991606
72	NC_008023	TAAAT	2	10	116073	116082	60 %	40 %	0 %	0 %	94991606
73	NC_008023	AAATC	2	10	116950	116959	60 %	20 %	0 %	20 %	94991606
74	NC_008023	GAGAG	2	10	117112	117121	40 %	0 %	60 %	0 %	94991607
75	NC_008023	TAAAA	2	10	120722	120731	80 %	20 %	0 %	0 %	94991610
76	NC_008023	GACCT	2	10	129139	129148	20 %	20 %	20 %	40 %	94991616
77	NC_008023	TCAGG	2	10	130444	130453	20 %	20 %	40 %	20 %	94991616
78	NC_008023	TTTTA	2	10	132327	132336	20 %	80 %	0 %	0 %	94991618
79	NC_008023	GCTTT	3	15	132903	132917	0 %	60 %	20 %	20 %	94991618
80	NC_008023	GTCAT	2	10	133222	133231	20 %	40 %	20 %	20 %	94991618
81	NC_008023	TAGTG	2	10	134165	134174	20 %	40 %	40 %	0 %	94991619
82	NC_008023	GTTAA	2	10	134568	134577	40 %	40 %	20 %	0 %	94991619
83	NC_008023	AATAA	2	10	134597	134606	80 %	20 %	0 %	0 %	94991619
84	NC_008023	TTGAT	2	10	135684	135693	20 %	60 %	20 %	0 %	94991620
85	NC_008023	TACCT	2	10	137087	137096	20 %	40 %	0 %	40 %	94991622
86	NC_008023	AATCA	2	10	137866	137875	60 %	20 %	0 %	20 %	94991624
87	NC_008023	TCATG	2	10	138473	138482	20 %	40 %	20 %	20 %	94991625
88	NC_008023	AACAA	2	10	139619	139628	80 %	0 %	0 %	20 %	94991626
89	NC_008023	TTGGC	2	10	139704	139713	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_008023	CAAAA	2	10	140836	140845	80 %	0 %	0 %	20 %	94991628
91	NC_008023	TTTTA	2	10	141909	141918	20 %	80 %	0 %	0 %	94991628
92	NC_008023	AAAGC	2	10	143098	143107	60 %	0 %	20 %	20 %	94991630
93	NC_008023	AGTTC	2	10	143348	143357	20 %	40 %	20 %	20 %	94991630
94	NC_008023	GCTGA	2	10	143368	143377	20 %	20 %	40 %	20 %	94991630
95	NC_008023	AAGGA	2	10	144948	144957	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008023	ATCGC	2	10	146742	146751	20 %	20 %	20 %	40 %	94991633
97	NC_008023	TTGGG	2	10	148145	148154	0 %	40 %	60 %	0 %	94991634
98	NC_008023	TCGCT	2	10	148431	148440	0 %	40 %	20 %	40 %	94991635
99	NC_008023	GAAAA	2	10	153456	153465	80 %	0 %	20 %	0 %	94991640
100	NC_008023	GGATT	2	10	153573	153582	20 %	40 %	40 %	0 %	94991640
101	NC_008023	TTTTG	2	10	154093	154102	0 %	80 %	20 %	0 %	94991640
102	NC_008023	TCATG	2	10	155598	155607	20 %	40 %	20 %	20 %	94991643
103	NC_008023	GTATC	2	10	156859	156868	20 %	40 %	20 %	20 %	94991644
104	NC_008023	GTCGC	2	10	157298	157307	0 %	20 %	40 %	40 %	94991645
105	NC_008023	AAGCT	2	10	159151	159160	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008023	AAGCA	2	10	159198	159207	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008023	CTTTT	2	10	160363	160372	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008023	ATTAT	2	10	160694	160703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008023	CTTGT	2	10	162697	162706	0 %	60 %	20 %	20 %	94991650
110	NC_008023	GCAAC	2	10	163630	163639	40 %	0 %	20 %	40 %	94991651
111	NC_008023	AAGGT	2	10	165312	165321	40 %	20 %	40 %	0 %	94991651
112	NC_008023	CGTCA	2	10	165509	165518	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_008023	AACAA	2	10	168216	168225	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008023	ATTTG	2	10	172564	172573	20 %	60 %	20 %	0 %	94991660
115	NC_008023	CAAGA	2	10	174486	174495	60 %	0 %	20 %	20 %	94991661
116	NC_008023	TTTGG	2	10	175652	175661	0 %	60 %	40 %	0 %	94991663
117	NC_008023	TGGAT	2	10	176601	176610	20 %	40 %	40 %	0 %	94991665
118	NC_008023	TTGCC	2	10	176976	176985	0 %	40 %	20 %	40 %	94991665
119	NC_008023	ACCTA	2	10	177672	177681	40 %	20 %	0 %	40 %	94991666
120	NC_008023	ATTTT	2	10	182536	182545	20 %	80 %	0 %	0 %	94991670
121	NC_008023	AAAAG	2	10	182700	182709	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008023	TCTAT	2	10	183524	183533	20 %	60 %	0 %	20 %	94991671
123	NC_008023	GTTTG	2	10	184064	184073	0 %	60 %	40 %	0 %	94991671
124	NC_008023	TGAAA	2	10	184239	184248	60 %	20 %	20 %	0 %	94991672
125	NC_008023	TTGAT	2	10	184487	184496	20 %	60 %	20 %	0 %	94991672
126	NC_008023	TAGGT	2	10	185456	185465	20 %	40 %	40 %	0 %	94991675
127	NC_008023	CCAAA	2	10	186833	186842	60 %	0 %	0 %	40 %	94991677
128	NC_008023	TCCCA	2	10	187035	187044	20 %	20 %	0 %	60 %	94991677
129	NC_008023	GCCAA	2	10	187882	187891	40 %	0 %	20 %	40 %	94991678
130	NC_008023	GGAAA	2	10	190832	190841	60 %	0 %	40 %	0 %	94991681
131	NC_008023	TAATC	2	10	193658	193667	40 %	40 %	0 %	20 %	94991685
132	NC_008023	TCTAA	2	10	198267	198276	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008023	TTTAC	2	10	199116	199125	20 %	60 %	0 %	20 %	94991692
134	NC_008023	CAAAC	2	10	201638	201647	60 %	0 %	0 %	40 %	94991696
135	NC_008023	AGATA	2	10	201752	201761	60 %	20 %	20 %	0 %	94991696
136	NC_008023	ATATA	2	10	202541	202550	60 %	40 %	0 %	0 %	94991696
137	NC_008023	TTAAA	2	10	203052	203061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008023	TTTTG	2	10	207752	207761	0 %	80 %	20 %	0 %	94991703
139	NC_008023	ATCGC	2	10	209070	209079	20 %	20 %	20 %	40 %	94991705
140	NC_008023	TTTTA	2	10	210238	210247	20 %	80 %	0 %	0 %	94991706
141	NC_008023	CTAAT	2	10	210476	210485	40 %	40 %	0 %	20 %	94991706
142	NC_008023	GAATG	2	10	210999	211008	40 %	20 %	40 %	0 %	94991706
143	NC_008023	TGTCT	2	10	213493	213502	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_008023	TAAGA	2	10	215011	215020	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008023	CCTTC	2	10	215427	215436	0 %	40 %	0 %	60 %	94991711
146	NC_008023	TAAGA	2	10	215472	215481	60 %	20 %	20 %	0 %	94991711
147	NC_008023	TGGAT	2	10	217576	217585	20 %	40 %	40 %	0 %	94991715
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149	NC_008023	GTAAA	2	10	218170	218179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008023	GAGAA	2	10	219118	219127	60 %	0 %	40 %	0 %	94991716
151	NC_008023	GTTAT	2	10	220143	220152	20 %	60 %	20 %	0 %	94991717
152	NC_008023	AAGAT	2	10	220229	220238	60 %	20 %	20 %	0 %	94991717
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155	NC_008023	CCTTT	2	10	227288	227297	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
156	NC_008023	CTCAT	2	10	227366	227375	20 %	40 %	0 %	40 %	94991729
157	NC_008023	TTTTC	2	10	227586	227595	0 %	80 %	0 %	20 %	94991729
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162	NC_008023	GTTCA	2	10	235386	235395	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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183	NC_008023	AAAAG	2	10	277926	277935	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_008023	TTATC	2	10	278726	278735	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_008023	TAGCA	2	10	287214	287223	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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196	NC_008023	ATTAT	2	10	291799	291808	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_008023	ATTTT	2	10	293472	293481	20 %	80 %	0 %	0 %	94991790
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267	NC_008023	TGTTT	2	10	366579	366588	0 %	80 %	20 %	0 %	94991869
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271	NC_008023	CAAAT	2	10	368570	368579	60 %	20 %	0 %	20 %	94991872
272	NC_008023	TTTAG	2	10	370223	370232	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_008023	TGTTT	2	10	522748	522757	0 %	80 %	20 %	0 %	94992044
404	NC_008023	TCCAA	2	10	526105	526114	40 %	20 %	0 %	40 %	94992045
405	NC_008023	ATTCC	2	10	528105	528114	20 %	40 %	0 %	40 %	94992046
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