MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 291

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008023	ACATT	2	10	16494	16503	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008023	TCGTG	2	10	18116	18125	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008023	GTTAA	2	10	19012	19021	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008023	GGGAG	2	10	19531	19540	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008023	AGGGA	2	10	21742	21751	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008023	GCTTA	2	10	22108	22117	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008023	TCGTG	2	10	24117	24126	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008023	GTTAA	2	10	25013	25022	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008023	GGGAG	2	10	25532	25541	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008023	AGGGA	2	10	27743	27752	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008023	GCTTA	2	10	28109	28118	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008023	TTTTC	2	10	29941	29950	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008023	CTTTT	2	10	30049	30058	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008023	TATAA	2	10	32162	32171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008023	CAAAT	2	10	51471	51480	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008023	ATTTT	2	10	60962	60971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008023	AAATA	2	10	62230	62239	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008023	TATAT	2	10	62315	62324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008023	AAGGA	2	10	70176	70185	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008023	GTTTC	2	10	77444	77453	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008023	TCGTG	2	10	80702	80711	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008023	GTTAA	2	10	81598	81607	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008023	GGGAG	2	10	82117	82126	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008023	AGGGA	2	10	84328	84337	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008023	GCTTA	2	10	84694	84703	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008023	ATTAT	2	10	84984	84993	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008023	TATAT	2	10	85067	85076	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008023	AGAAA	2	10	110295	110304	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008023	TTTAG	2	10	110564	110573	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008023	TTAAG	2	10	115317	115326	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008023	TTGGC	2	10	139704	139713	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008023	AAGGA	2	10	144948	144957	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008023	AAGCT	2	10	159151	159160	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008023	AAGCA	2	10	159198	159207	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008023	CTTTT	2	10	160363	160372	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008023	ATTAT	2	10	160694	160703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008023	CGTCA	2	10	165509	165518	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_008023	AACAA	2	10	168216	168225	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008023	AAAAG	2	10	182700	182709	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008023	TCTAA	2	10	198267	198276	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008023	TTAAA	2	10	203052	203061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008023	TGTCT	2	10	213493	213502	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008023	TAAGA	2	10	215011	215020	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008023	GTAAA	2	10	218170	218179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008023	CCTTT	2	10	227288	227297	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_008023	AATAA	2	10	234355	234364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008023	GTTCA	2	10	235386	235395	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008023	TCATT	2	10	264995	265004	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008023	TCGTG	2	10	273624	273633	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008023	GTTAA	2	10	274520	274529	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008023	GGGAG	2	10	275039	275048	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008023	AGGGA	2	10	277250	277259	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008023	AAAAG	2	10	277926	277935	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008023	TTATC	2	10	278726	278735	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008023	GTTAT	2	10	287072	287081	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008023	TAGCA	2	10	287214	287223	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008023	AGTAA	2	10	290591	290600	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008023	ATTAT	2	10	291662	291671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008023	ATTAT	2	10	291799	291808	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008023	TGTGT	2	10	305051	305060	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008023	AAAAG	2	10	313447	313456	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008023	TGCTA	2	10	324683	324692	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008023	CAGGG	2	10	324703	324712	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_008023	TAAAA	2	10	330350	330359	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008023	TTGAT	2	10	356139	356148	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008023	TTGCT	2	10	357439	357448	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_008023	AGTAG	2	10	359942	359951	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008023	TGAAA	2	10	365130	365139	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008023	AGAAA	2	10	365869	365878	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008023	TGAAA	2	10	366107	366116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008023	AATTA	2	10	366706	366715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008023	TTTAG	2	10	370223	370232	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008023	TATAG	2	10	370290	370299	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008023	TGAGA	2	10	372864	372873	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008023	TTGAT	2	10	372887	372896	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008023	TTTAT	2	10	382288	382297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008023	AAATC	2	10	386042	386051	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008023	AGAAA	2	10	387828	387837	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008023	AAGGA	2	10	396500	396509	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008023	TAGAG	2	10	401011	401020	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008023	AAAGC	2	10	404818	404827	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_008023	AGCTT	2	10	429362	429371	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008023	TTTTC	2	10	429406	429415	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_008023	AATCA	2	10	449248	449257	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_008023	TTATT	2	10	457485	457494	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008023	TCCTT	2	10	476626	476635	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_008023	GTTAT	2	10	479870	479879	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008023	TTTCC	2	10	481437	481446	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_008023	AAAAT	2	10	481520	481529	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008023	AGAAA	2	10	481575	481584	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008023	TTAGT	2	10	485990	485999	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008023	TATAA	2	10	487017	487026	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008023	CTTTT	2	10	496308	496317	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008023	ATGGG	2	10	499714	499723	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008023	TTTAG	2	10	499757	499766	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008023	TAAAA	2	10	502063	502072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008023	TTAAT	2	10	511976	511985	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008023	AGCTG	2	10	516554	516563	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008023	TTTTG	2	10	520799	520808	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008023	AAGCC	2	10	521786	521795	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_008023	TGATA	2	10	531419	531428	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008023	TACTA	2	10	532986	532995	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008023	TTTTC	2	10	543959	543968	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_008023	TTTCT	2	10	543993	544002	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008023	CAAAA	2	10	546029	546038	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008023	CAAAA	2	10	546139	546148	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008023	TATTT	2	10	546748	546757	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008023	ACGTA	2	10	582390	582399	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_008023	TAAAT	2	10	583057	583066	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008023	AGGAA	2	10	583259	583268	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008023	AAAAG	2	10	607384	607393	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008023	ATAAA	2	10	611220	611229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008023	GAATA	2	10	614575	614584	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008023	ATAGA	2	10	623698	623707	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008023	AGCAC	2	10	630329	630338	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_008023	TATAA	2	10	631414	631423	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008023	AGCAT	2	10	640092	640101	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008023	GAAAG	2	10	643345	643354	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008023	ATTTA	2	10	677028	677037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008023	AAAGA	2	10	680112	680121	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008023	TCTTT	2	10	680166	680175	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_008023	AAATA	2	10	680193	680202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008023	TTCGG	2	10	691296	691305	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008023	AAAAG	2	10	693193	693202	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008023	CACTT	2	10	694349	694358	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_008023	TTTTA	2	10	712274	712283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008023	ATGTT	2	10	717165	717174	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008023	AAAGG	2	10	741926	741935	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008023	ATTGA	2	10	741953	741962	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008023	ATGTT	2	10	747099	747108	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008023	AGAAT	2	10	757926	757935	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008023	CTAAT	2	10	759460	759469	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008023	CATCT	2	10	761829	761838	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_008023	TAAAA	2	10	775426	775435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008023	GGAAA	2	10	779559	779568	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008023	TAAGG	2	10	792850	792859	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008023	CACCT	2	10	795073	795082	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_008023	ATGAT	2	10	805257	805266	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008023	TAGAA	2	10	812687	812696	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008023	ATTTA	2	10	813050	813059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008023	AACAA	13	65	823314	823378	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008023	TAAAA	2	10	836377	836386	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008023	AATGT	2	10	837046	837055	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008023	AATAA	2	10	858402	858411	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008023	CAAAA	2	10	908846	908855	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_008023	TAAGA	2	10	914874	914883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008023	CTTGT	2	10	922026	922035	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_008023	AGTTG	2	10	927564	927573	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008023	CATAA	2	10	930308	930317	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_008023	ATGGG	2	10	933620	933629	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008023	AATTG	2	10	936670	936679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008023	CCATT	2	10	941352	941361	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
153	NC_008023	TTAAA	2	10	946194	946203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008023	TCATA	2	10	950389	950398	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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157	NC_008023	ATTTA	2	10	994605	994614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008023	TATAA	2	10	999010	999019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008023	TTGTT	2	10	1024039	1024048	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_008023	CTTTA	2	10	1033475	1033484	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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163	NC_008023	ATGTT	2	10	1035661	1035670	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_008023	TATAA	2	10	1038796	1038805	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_008023	CTTTT	2	10	1090245	1090254	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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289	NC_008023	GTCAA	2	10	1856287	1856296	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
290	NC_008023	AAAAG	2	10	1858128	1858137	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
291	NC_008023	CTTTT	2	10	1858159	1858168	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.