MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 1137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008023	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	94991499
2	NC_008023	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	94991500
3	NC_008023	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	94991501
4	NC_008023	GATTT	2	10	6138	6147	20 %	60 %	20 %	0 %	94991503
5	NC_008023	ATTAA	2	10	11967	11976	60 %	40 %	0 %	0 %	94991508
6	NC_008023	TTTAT	2	10	15288	15297	20 %	80 %	0 %	0 %	94991512
7	NC_008023	TACAC	2	10	15917	15926	40 %	20 %	0 %	40 %	94991512
8	NC_008023	TAAAT	2	10	15927	15936	60 %	40 %	0 %	0 %	94991512
9	NC_008023	AGTGA	2	10	32909	32918	40 %	20 %	40 %	0 %	94991516
10	NC_008023	ATTTT	2	10	33608	33617	20 %	80 %	0 %	0 %	94991517
11	NC_008023	TTGAT	2	10	33797	33806	20 %	60 %	20 %	0 %	94991517
12	NC_008023	TGGTG	2	10	35881	35890	0 %	40 %	60 %	0 %	94991520
13	NC_008023	AGCAG	2	10	43129	43138	40 %	0 %	40 %	20 %	94991524
14	NC_008023	GGTCA	2	10	43493	43502	20 %	20 %	40 %	20 %	94991524
15	NC_008023	TTGGG	2	10	43889	43898	0 %	40 %	60 %	0 %	94991525
16	NC_008023	GCAGG	2	10	47969	47978	20 %	0 %	60 %	20 %	94991527
17	NC_008023	CTCAG	2	10	49326	49335	20 %	20 %	20 %	40 %	94991529
18	NC_008023	TACTA	2	10	50964	50973	40 %	40 %	0 %	20 %	94991530
19	NC_008023	AAATT	2	10	51257	51266	60 %	40 %	0 %	0 %	94991531
20	NC_008023	TCGGA	2	10	54230	54239	20 %	20 %	40 %	20 %	94991534
21	NC_008023	GCTTT	2	10	56976	56985	0 %	60 %	20 %	20 %	94991537
22	NC_008023	TTTTC	2	10	57174	57183	0 %	80 %	0 %	20 %	94991537
23	NC_008023	AAACC	2	10	57239	57248	60 %	0 %	0 %	40 %	94991537
24	NC_008023	ATGGT	2	10	59013	59022	20 %	40 %	40 %	0 %	94991538
25	NC_008023	ATTCA	2	10	59697	59706	40 %	40 %	0 %	20 %	94991538
26	NC_008023	TTTTA	2	10	63469	63478	20 %	80 %	0 %	0 %	94991542
27	NC_008023	AAAGC	2	10	63662	63671	60 %	0 %	20 %	20 %	94991542
28	NC_008023	TTTGG	2	10	67656	67665	0 %	60 %	40 %	0 %	94991550
29	NC_008023	TTCAC	2	10	68012	68021	20 %	40 %	0 %	40 %	94991551
30	NC_008023	GAAAT	2	10	69093	69102	60 %	20 %	20 %	0 %	94991553
31	NC_008023	TCCAA	2	10	74795	74804	40 %	20 %	0 %	40 %	162139139
32	NC_008023	CTTGG	2	10	89004	89013	0 %	40 %	40 %	20 %	94991579
33	NC_008023	TCTTA	2	10	89422	89431	20 %	60 %	0 %	20 %	94991579
34	NC_008023	CACTC	2	10	90968	90977	20 %	20 %	0 %	60 %	94991581
35	NC_008023	GATTG	2	10	93229	93238	20 %	40 %	40 %	0 %	94991582
36	NC_008023	TTGAT	2	10	103370	103379	20 %	60 %	20 %	0 %	94991587
37	NC_008023	AAATC	2	10	103538	103547	60 %	20 %	0 %	20 %	94991587
38	NC_008023	TGAAG	2	10	108854	108863	40 %	20 %	40 %	0 %	94991596
39	NC_008023	TTTAG	2	10	110713	110722	20 %	60 %	20 %	0 %	94991599
40	NC_008023	GTGTT	2	10	115117	115126	0 %	60 %	40 %	0 %	94991605
41	NC_008023	TAGGT	2	10	115940	115949	20 %	40 %	40 %	0 %	94991606
42	NC_008023	TAAAT	2	10	116073	116082	60 %	40 %	0 %	0 %	94991606
43	NC_008023	AAATC	2	10	116950	116959	60 %	20 %	0 %	20 %	94991606
44	NC_008023	GAGAG	2	10	117112	117121	40 %	0 %	60 %	0 %	94991607
45	NC_008023	TAAAA	2	10	120722	120731	80 %	20 %	0 %	0 %	94991610
46	NC_008023	GACCT	2	10	129139	129148	20 %	20 %	20 %	40 %	94991616
47	NC_008023	TCAGG	2	10	130444	130453	20 %	20 %	40 %	20 %	94991616
48	NC_008023	TTTTA	2	10	132327	132336	20 %	80 %	0 %	0 %	94991618
49	NC_008023	GCTTT	3	15	132903	132917	0 %	60 %	20 %	20 %	94991618
50	NC_008023	GTCAT	2	10	133222	133231	20 %	40 %	20 %	20 %	94991618
51	NC_008023	TAGTG	2	10	134165	134174	20 %	40 %	40 %	0 %	94991619
52	NC_008023	GTTAA	2	10	134568	134577	40 %	40 %	20 %	0 %	94991619
53	NC_008023	AATAA	2	10	134597	134606	80 %	20 %	0 %	0 %	94991619
54	NC_008023	TTGAT	2	10	135684	135693	20 %	60 %	20 %	0 %	94991620
55	NC_008023	TACCT	2	10	137087	137096	20 %	40 %	0 %	40 %	94991622
56	NC_008023	AATCA	2	10	137866	137875	60 %	20 %	0 %	20 %	94991624
57	NC_008023	TCATG	2	10	138473	138482	20 %	40 %	20 %	20 %	94991625
58	NC_008023	AACAA	2	10	139619	139628	80 %	0 %	0 %	20 %	94991626
59	NC_008023	CAAAA	2	10	140836	140845	80 %	0 %	0 %	20 %	94991628
60	NC_008023	TTTTA	2	10	141909	141918	20 %	80 %	0 %	0 %	94991628
61	NC_008023	AAAGC	2	10	143098	143107	60 %	0 %	20 %	20 %	94991630
62	NC_008023	AGTTC	2	10	143348	143357	20 %	40 %	20 %	20 %	94991630
63	NC_008023	GCTGA	2	10	143368	143377	20 %	20 %	40 %	20 %	94991630
64	NC_008023	ATCGC	2	10	146742	146751	20 %	20 %	20 %	40 %	94991633
65	NC_008023	TTGGG	2	10	148145	148154	0 %	40 %	60 %	0 %	94991634
66	NC_008023	TCGCT	2	10	148431	148440	0 %	40 %	20 %	40 %	94991635
67	NC_008023	GAAAA	2	10	153456	153465	80 %	0 %	20 %	0 %	94991640
68	NC_008023	GGATT	2	10	153573	153582	20 %	40 %	40 %	0 %	94991640
69	NC_008023	TTTTG	2	10	154093	154102	0 %	80 %	20 %	0 %	94991640
70	NC_008023	TCATG	2	10	155598	155607	20 %	40 %	20 %	20 %	94991643
71	NC_008023	GTATC	2	10	156859	156868	20 %	40 %	20 %	20 %	94991644
72	NC_008023	GTCGC	2	10	157298	157307	0 %	20 %	40 %	40 %	94991645
73	NC_008023	CTTGT	2	10	162697	162706	0 %	60 %	20 %	20 %	94991650
74	NC_008023	GCAAC	2	10	163630	163639	40 %	0 %	20 %	40 %	94991651
75	NC_008023	AAGGT	2	10	165312	165321	40 %	20 %	40 %	0 %	94991651
76	NC_008023	ATTTG	2	10	172564	172573	20 %	60 %	20 %	0 %	94991660
77	NC_008023	CAAGA	2	10	174486	174495	60 %	0 %	20 %	20 %	94991661
78	NC_008023	TTTGG	2	10	175652	175661	0 %	60 %	40 %	0 %	94991663
79	NC_008023	TGGAT	2	10	176601	176610	20 %	40 %	40 %	0 %	94991665
80	NC_008023	TTGCC	2	10	176976	176985	0 %	40 %	20 %	40 %	94991665
81	NC_008023	ACCTA	2	10	177672	177681	40 %	20 %	0 %	40 %	94991666
82	NC_008023	ATTTT	2	10	182536	182545	20 %	80 %	0 %	0 %	94991670
83	NC_008023	TCTAT	2	10	183524	183533	20 %	60 %	0 %	20 %	94991671
84	NC_008023	GTTTG	2	10	184064	184073	0 %	60 %	40 %	0 %	94991671
85	NC_008023	TGAAA	2	10	184239	184248	60 %	20 %	20 %	0 %	94991672
86	NC_008023	TTGAT	2	10	184487	184496	20 %	60 %	20 %	0 %	94991672
87	NC_008023	TAGGT	2	10	185456	185465	20 %	40 %	40 %	0 %	94991675
88	NC_008023	CCAAA	2	10	186833	186842	60 %	0 %	0 %	40 %	94991677
89	NC_008023	TCCCA	2	10	187035	187044	20 %	20 %	0 %	60 %	94991677
90	NC_008023	GCCAA	2	10	187882	187891	40 %	0 %	20 %	40 %	94991678
91	NC_008023	GGAAA	2	10	190832	190841	60 %	0 %	40 %	0 %	94991681
92	NC_008023	TAATC	2	10	193658	193667	40 %	40 %	0 %	20 %	94991685
93	NC_008023	TTTAC	2	10	199116	199125	20 %	60 %	0 %	20 %	94991692
94	NC_008023	CAAAC	2	10	201638	201647	60 %	0 %	0 %	40 %	94991696
95	NC_008023	AGATA	2	10	201752	201761	60 %	20 %	20 %	0 %	94991696
96	NC_008023	ATATA	2	10	202541	202550	60 %	40 %	0 %	0 %	94991696
97	NC_008023	TTTTG	2	10	207752	207761	0 %	80 %	20 %	0 %	94991703
98	NC_008023	ATCGC	2	10	209070	209079	20 %	20 %	20 %	40 %	94991705
99	NC_008023	TTTTA	2	10	210238	210247	20 %	80 %	0 %	0 %	94991706
100	NC_008023	CTAAT	2	10	210476	210485	40 %	40 %	0 %	20 %	94991706
101	NC_008023	GAATG	2	10	210999	211008	40 %	20 %	40 %	0 %	94991706
102	NC_008023	CCTTC	2	10	215427	215436	0 %	40 %	0 %	60 %	94991711
103	NC_008023	TAAGA	2	10	215472	215481	60 %	20 %	20 %	0 %	94991711
104	NC_008023	TGGAT	2	10	217576	217585	20 %	40 %	40 %	0 %	94991715
105	NC_008023	CTTTT	2	10	217746	217755	0 %	80 %	0 %	20 %	94991715
106	NC_008023	GAGAA	2	10	219118	219127	60 %	0 %	40 %	0 %	94991716
107	NC_008023	GTTAT	2	10	220143	220152	20 %	60 %	20 %	0 %	94991717
108	NC_008023	AAGAT	2	10	220229	220238	60 %	20 %	20 %	0 %	94991717
109	NC_008023	AAATG	2	10	221777	221786	60 %	20 %	20 %	0 %	94991718
110	NC_008023	CAAAT	2	10	222922	222931	60 %	20 %	0 %	20 %	94991720
111	NC_008023	CTCAT	2	10	227366	227375	20 %	40 %	0 %	40 %	94991729
112	NC_008023	TTTTC	2	10	227586	227595	0 %	80 %	0 %	20 %	94991729
113	NC_008023	TTGTC	2	10	229326	229335	0 %	60 %	20 %	20 %	94991731
114	NC_008023	GCAGC	2	10	233582	233591	20 %	0 %	40 %	40 %	94991735
115	NC_008023	ATTCC	2	10	234887	234896	20 %	40 %	0 %	40 %	94991737
116	NC_008023	AATCA	2	10	239429	239438	60 %	20 %	0 %	20 %	94991742
117	NC_008023	AGCTA	2	10	243101	243110	40 %	20 %	20 %	20 %	94991744
118	NC_008023	GAAAC	2	10	243549	243558	60 %	0 %	20 %	20 %	94991744
119	NC_008023	CCAAT	2	10	245802	245811	40 %	20 %	0 %	40 %	94991748
120	NC_008023	CAAGA	2	10	246576	246585	60 %	0 %	20 %	20 %	94991748
121	NC_008023	TTTGG	2	10	249566	249575	0 %	60 %	40 %	0 %	94991750
122	NC_008023	TTTTA	2	10	254071	254080	20 %	80 %	0 %	0 %	94991754
123	NC_008023	TGGTT	2	10	256009	256018	0 %	60 %	40 %	0 %	94991756
124	NC_008023	ATTAC	2	10	257404	257413	40 %	40 %	0 %	20 %	94991758
125	NC_008023	TGATT	2	10	258417	258426	20 %	60 %	20 %	0 %	94991759
126	NC_008023	CCAAT	2	10	258674	258683	40 %	20 %	0 %	40 %	94991759
127	NC_008023	GTGAT	2	10	260271	260280	20 %	40 %	40 %	0 %	94991761
128	NC_008023	GGTTC	2	10	264366	264375	0 %	40 %	40 %	20 %	94991766
129	NC_008023	ATAGT	2	10	264486	264495	40 %	40 %	20 %	0 %	94991766
130	NC_008023	CAAAA	2	10	266179	266188	80 %	0 %	0 %	20 %	94991767
131	NC_008023	GCTTG	2	10	279146	279155	0 %	40 %	40 %	20 %	94991775
132	NC_008023	TATCA	2	10	279495	279504	40 %	40 %	0 %	20 %	94991775
133	NC_008023	GCAGA	2	10	281720	281729	40 %	0 %	40 %	20 %	94991779
134	NC_008023	ATGGT	2	10	281937	281946	20 %	40 %	40 %	0 %	94991779
135	NC_008023	GATGA	2	10	284645	284654	40 %	20 %	40 %	0 %	94991782
136	NC_008023	AAGGC	2	10	286721	286730	40 %	0 %	40 %	20 %	94991785
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