MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 2959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008023	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008023	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008023	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008023	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008023	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008023	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008023	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008023	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008023	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008023	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008023	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008023	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008023	AAC	2	6	8719	8724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008023	TGC	2	6	8798	8803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008023	GAT	2	6	14860	14865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008023	TTA	2	6	14879	14884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008023	TAA	2	6	14964	14969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008023	AGA	2	6	14972	14977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008023	AGA	2	6	14980	14985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008023	ATA	2	6	16481	16486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008023	AGT	2	6	16531	16536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008023	TAA	2	6	16804	16809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008023	GGC	2	6	17077	17082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008023	CGA	2	6	17322	17327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008023	GCA	2	6	17396	17401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008023	CGC	2	6	17443	17448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_008023	TGT	2	6	17482	17487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008023	AGA	2	6	17491	17496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008023	ATG	2	6	17497	17502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008023	CCA	2	6	17518	17523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008023	CAG	2	6	17565	17570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008023	GGA	2	6	17755	17760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008023	GAA	2	6	18019	18024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008023	GGT	2	6	18093	18098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008023	GTC	2	6	18107	18112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008023	CAT	2	6	18175	18180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008023	TAA	2	6	18210	18215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008023	GGA	2	6	18219	18224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008023	ATC	2	6	18243	18248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008023	CGC	2	6	18409	18414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_008023	CAC	2	6	18454	18459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_008023	GAT	2	6	18525	18530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008023	CCT	2	6	18581	18586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008023	AGG	2	6	18680	18685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008023	CTA	2	6	18726	18731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008023	TAA	2	6	18974	18979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008023	TAA	2	6	19005	19010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008023	GAA	2	6	19058	19063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008023	ACG	2	6	19075	19080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008023	TAG	2	6	19246	19251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008023	AGG	2	6	19268	19273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008023	AGA	2	6	19334	19339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008023	GGA	2	6	19450	19455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008023	ACA	2	6	19568	19573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008023	ATG	2	6	19635	19640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008023	TGT	2	6	19705	19710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008023	GGA	2	6	19768	19773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008023	ATC	2	6	19975	19980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008023	ACC	2	6	20033	20038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_008023	AGC	2	6	20113	20118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008023	AAG	2	6	20250	20255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008023	GAG	2	6	20265	20270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008023	TAG	2	6	20578	20583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008023	GAT	2	6	20824	20829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008023	AGG	2	6	20869	20874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008023	CGG	2	6	20915	20920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008023	GTT	2	6	21175	21180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008023	TAC	2	6	21185	21190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008023	CCT	2	6	21273	21278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008023	GGT	2	6	21409	21414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008023	TCG	2	6	21524	21529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008023	CGT	2	6	21604	21609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008023	CAG	2	6	22045	22050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008023	AGT	2	6	22302	22307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008023	CGT	2	6	22642	22647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008023	GAG	2	6	22656	22661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008023	CTC	2	6	22821	22826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_008023	AGA	2	6	22918	22923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008023	GGC	2	6	23078	23083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008023	CGA	2	6	23323	23328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008023	GCA	2	6	23397	23402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008023	CGC	2	6	23444	23449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_008023	TGT	2	6	23483	23488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008023	AGA	2	6	23492	23497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008023	ATG	2	6	23498	23503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008023	CCA	2	6	23519	23524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_008023	CAG	2	6	23566	23571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008023	GGA	2	6	23756	23761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008023	GAA	2	6	24020	24025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008023	GGT	2	6	24094	24099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008023	GTC	2	6	24108	24113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008023	CAT	2	6	24176	24181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008023	TAA	2	6	24211	24216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008023	GGA	2	6	24220	24225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008023	ATC	2	6	24244	24249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008023	CGC	2	6	24410	24415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008023	CAC	2	6	24455	24460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_008023	GAT	2	6	24526	24531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008023	CCT	2	6	24582	24587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008023	AGG	2	6	24681	24686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008023	CTA	2	6	24727	24732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008023	TAA	2	6	24975	24980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008023	TAA	2	6	25006	25011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008023	GAA	2	6	25059	25064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008023	ACG	2	6	25076	25081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008023	TAG	2	6	25247	25252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008023	AGG	2	6	25269	25274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008023	AGA	2	6	25335	25340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008023	GGA	2	6	25451	25456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008023	ACA	2	6	25569	25574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008023	ATG	2	6	25636	25641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008023	TGT	2	6	25706	25711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008023	GGA	2	6	25769	25774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008023	ATC	2	6	25976	25981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008023	ACC	2	6	26034	26039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_008023	AGC	2	6	26114	26119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008023	AAG	2	6	26251	26256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008023	GAG	2	6	26266	26271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008023	TAG	2	6	26579	26584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008023	GAT	2	6	26825	26830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008023	AGG	2	6	26870	26875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008023	CGG	2	6	26916	26921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008023	GTT	2	6	27176	27181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008023	TAC	2	6	27186	27191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008023	CCT	2	6	27274	27279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_008023	GGT	2	6	27410	27415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008023	TCG	2	6	27525	27530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008023	CGT	2	6	27605	27610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008023	CAG	2	6	28046	28051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008023	AGT	2	6	28303	28308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008023	CGT	2	6	28643	28648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008023	GAG	2	6	28657	28662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008023	CTC	2	6	28822	28827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008023	CGC	2	6	28988	28993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008023	TAT	2	6	28994	28999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008023	ATT	2	6	29104	29109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008023	GGA	2	6	29112	29117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008023	TCC	2	6	29195	29200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_008023	TCG	2	6	29235	29240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008023	GTT	2	6	29299	29304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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