MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10270 chromosome

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008022	AGTGTA	2	12	21850	21861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008022	ACTAAT	2	12	21878	21889	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008022	AGTGTA	2	12	27851	27862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008022	ACTAAT	2	12	27879	27890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008022	TATTTT	2	12	64870	64881	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008022	AGTGTA	2	12	84837	84848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008022	ACTAAT	2	12	84865	84876	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008022	TTCGGG	2	12	85807	85818	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008022	ATAAAA	2	12	112879	112890	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008022	AGATAA	2	12	140426	140437	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008022	CTTTAT	2	12	166035	166046	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008022	CTCTTT	2	12	167899	167910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008022	TGACAC	2	12	194763	194774	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008022	TTTAAA	2	12	201251	201262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008022	AGTGTA	2	12	274016	274027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008022	ACTAAT	2	12	274044	274055	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008022	TTAAAA	2	12	294431	294442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008022	TTTAAT	2	12	311511	311522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008022	TTTTAG	2	12	322865	322876	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008022	AAGACC	2	12	338006	338017	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008022	AGCTTA	2	12	360363	360374	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_008022	CATGGG	2	12	363788	363799	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008022	ATTTAA	2	12	374706	374717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008022	AGAAAT	2	12	407903	407914	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008022	ATTTTA	2	12	439161	439172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008022	GAGTAA	2	12	444950	444961	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008022	AGGACT	2	12	460852	460863	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008022	GAAAAA	2	12	508882	508893	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008022	TTAATA	2	12	540633	540644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008022	CCTTGT	2	12	590590	590601	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008022	TAAATA	2	12	705870	705881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008022	AGGTAA	2	12	716670	716681	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008022	TTCGGG	2	12	752656	752667	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008022	GAAAAA	2	12	844333	844344	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008022	TTATCA	2	12	876778	876789	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008022	TTTAAA	2	12	1036998	1037009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008022	TTGTTT	2	12	1066419	1066430	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008022	ATATGA	2	12	1099947	1099958	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008022	AGTCTT	2	12	1115991	1116002	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008022	CTTTTT	2	12	1157201	1157212	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008022	CCTTGG	2	12	1189193	1189204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008022	TGACTT	2	12	1212342	1212353	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008022	ATGATA	2	12	1218848	1218859	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008022	TAGAAT	2	12	1228692	1228703	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008022	AGCCTT	2	12	1273838	1273849	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008022	GAACAG	2	12	1282901	1282912	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008022	CTTTTT	2	12	1325745	1325756	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008022	TATTTT	2	12	1339046	1339057	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008022	AGTTTT	2	12	1339306	1339317	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008022	TTTTAT	2	12	1341912	1341923	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008022	TCCTTC	2	12	1374668	1374679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008022	CTCAAT	2	12	1378903	1378914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008022	TATTAG	2	12	1380196	1380207	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008022	TACACT	2	12	1380225	1380236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008022	GAAAAA	2	12	1385665	1385676	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008022	CAATTC	2	12	1404753	1404764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008022	TATTTT	2	12	1405826	1405837	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008022	AATACC	2	12	1414840	1414851	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008022	CTTTTC	2	12	1464890	1464901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008022	ATTCCA	2	12	1515954	1515965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008022	CTAGTC	2	12	1567234	1567245	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008022	AATATT	2	12	1585838	1585849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008022	TTGCTT	2	12	1605329	1605340	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008022	TATAAT	2	12	1608174	1608185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008022	TAACAA	2	12	1619275	1619286	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008022	TTTTTC	2	12	1621661	1621672	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008022	AGAAAA	2	12	1624357	1624368	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008022	TATTAG	2	12	1630687	1630698	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008022	TACACT	2	12	1630716	1630727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008022	GTTAAA	2	12	1645796	1645807	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008022	ATGTTT	2	12	1658177	1658188	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008022	TTAATA	2	12	1816789	1816800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008022	ATTTTA	2	12	1827215	1827226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008022	CGGTAA	2	12	1836399	1836410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_008022	TTTTCA	2	12	1848677	1848688	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008022	TAAAAA	2	12	1860658	1860669	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008022	CATTAT	2	12	1864763	1864774	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008022	AATTTA	3	18	1875682	1875699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008022	GAAAAA	2	12	1923765	1923776	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.