MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS9429 chromosome

Total Repeats: 275

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008021	ACATT	2	10	16493	16502	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008021	TCGTG	2	10	18114	18123	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008021	GTTAA	2	10	19010	19019	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008021	GGGAG	2	10	19529	19538	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008021	AGGGA	2	10	21740	21749	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008021	GCTTA	2	10	22106	22115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008021	TCGTG	2	10	24115	24124	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008021	GTTAA	2	10	25011	25020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008021	GGGAG	2	10	25530	25539	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008021	AGGGA	2	10	27741	27750	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008021	GCTTA	2	10	28107	28116	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008021	TTTTC	2	10	29939	29948	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008021	CTTTT	2	10	30047	30056	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008021	TATAA	2	10	32160	32169	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008021	CAAAT	2	10	51496	51505	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008021	ATTTT	2	10	60988	60997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008021	AAATA	2	10	62255	62264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008021	TATAT	2	10	62340	62349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008021	AAGGA	2	10	70199	70208	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008021	GTTTC	2	10	77468	77477	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008021	TCGTG	2	10	80726	80735	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008021	GTTAA	2	10	81622	81631	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008021	GGGAG	2	10	82141	82150	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008021	AGGGA	2	10	84352	84361	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008021	GCTTA	2	10	84718	84727	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008021	ATTAT	2	10	85008	85017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008021	TATAT	2	10	85091	85100	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008021	AGAAA	2	10	110343	110352	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008021	TTTAG	2	10	110612	110621	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008021	TTAAG	2	10	115365	115374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008021	TTGGC	2	10	139752	139761	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008021	AAGGA	2	10	144996	145005	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008021	AAGCT	2	10	159198	159207	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008021	AAGCA	2	10	159245	159254	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008021	CTTTT	2	10	160386	160395	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008021	ATTAT	2	10	160717	160726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008021	CGTCA	2	10	165531	165540	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_008021	AACAA	2	10	167270	167279	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008021	AAAAG	2	10	181767	181776	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008021	TCTAA	2	10	197335	197344	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008021	TTAAA	2	10	202120	202129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008021	TGTCT	2	10	212562	212571	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008021	TAAGA	2	10	214080	214089	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008021	GTAAA	2	10	217222	217231	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008021	CCTTT	2	10	226340	226349	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_008021	AATAA	2	10	233407	233416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008021	GTTCA	2	10	234438	234447	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008021	TCATT	2	10	264072	264081	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008021	TCGTG	2	10	272701	272710	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008021	GTTAA	2	10	273597	273606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008021	GGGAG	2	10	274116	274125	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008021	AGGGA	2	10	276327	276336	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008021	AAAAG	2	10	277003	277012	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008021	TTATC	2	10	277803	277812	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008021	GTTAT	2	10	286147	286156	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008021	TAGCA	2	10	286289	286298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008021	ATTAT	2	10	290734	290743	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008021	ATTAT	2	10	290871	290880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008021	TGTGT	2	10	304124	304133	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008021	AAAAG	2	10	312520	312529	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008021	TGCTA	2	10	323757	323766	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_008021	CAGGG	2	10	323777	323786	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008021	TAAAA	2	10	329424	329433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008021	TTGAT	2	10	355209	355218	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008021	TTGCT	2	10	356509	356518	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_008021	AGTAG	2	10	359011	359020	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008021	TGAAA	2	10	364193	364202	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008021	AATTA	2	10	364792	364801	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008021	TTTAG	2	10	368309	368318	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008021	TATAG	2	10	368376	368385	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008021	TGAGA	2	10	370950	370959	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008021	TTGAT	2	10	370973	370982	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008021	TTTAT	2	10	380375	380384	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008021	AAATC	2	10	384130	384139	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008021	AGAAA	2	10	385916	385925	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008021	AAGGA	2	10	394591	394600	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008021	TAGAG	2	10	399102	399111	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008021	AAAGC	2	10	402908	402917	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_008021	AGCTT	2	10	427451	427460	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_008021	TTTTC	2	10	427495	427504	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008021	AATCA	2	10	447337	447346	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_008021	TTATT	2	10	455573	455582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008021	GAATG	2	10	456879	456888	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008021	TCCTT	2	10	474715	474724	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_008021	GTTAT	2	10	477959	477968	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008021	TTTCC	2	10	479526	479535	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_008021	AAAAT	2	10	479609	479618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008021	AGAAA	2	10	479664	479673	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008021	TTAGT	2	10	484079	484088	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008021	TATAA	2	10	485106	485115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008021	CTTTT	2	10	494396	494405	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_008021	TAAAA	2	10	500151	500160	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008021	TTAAT	2	10	510064	510073	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008021	AGCTG	2	10	514642	514651	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_008021	ATAAA	2	10	516021	516030	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008021	TTTTG	2	10	518889	518898	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008021	AAGCC	2	10	519876	519885	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_008021	TGATA	2	10	529509	529518	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008021	TACTA	2	10	531075	531084	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_008021	AGTTT	2	10	532813	532822	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008021	AGAAA	2	10	534602	534611	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008021	ACGTA	2	10	581003	581012	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008021	TAAAT	2	10	581659	581668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008021	AGGAA	2	10	581861	581870	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008021	AAAAG	2	10	605976	605985	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008021	ATAAA	2	10	609812	609821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008021	GAATA	2	10	613167	613176	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008021	ATAGA	2	10	622290	622299	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008021	AGCAC	2	10	628923	628932	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_008021	TATAA	2	10	630008	630017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008021	AGCAT	2	10	638687	638696	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008021	GAAAG	2	10	641940	641949	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008021	ATTTA	2	10	675621	675630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008021	AAAGA	2	10	678703	678712	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008021	TCTTT	2	10	678757	678766	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008021	AAATA	2	10	678784	678793	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008021	TTCGG	2	10	689887	689896	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008021	AAAAG	2	10	691784	691793	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008021	TGAAA	2	10	692408	692417	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008021	AGATT	2	10	692418	692427	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008021	CACTT	2	10	692940	692949	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_008021	TTTTA	2	10	710866	710875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008021	ATGTT	2	10	715757	715766	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008021	AAAGG	2	10	740517	740526	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008021	ATTGA	2	10	740544	740553	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008021	ATGTT	2	10	745690	745699	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008021	AGAAT	2	10	756517	756526	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008021	CTAAT	2	10	758053	758062	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008021	CATCT	2	10	760422	760431	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_008021	TAAAA	2	10	775355	775364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008021	CCTAA	2	10	781344	781353	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_008021	GAAAG	2	10	789075	789084	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008021	GGAAA	2	10	818982	818991	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008021	TAAGG	2	10	832273	832282	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008021	CACCT	2	10	834496	834505	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_008021	ATGAT	2	10	844681	844690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008021	TAGAA	2	10	852111	852120	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008021	TAAAA	2	10	875607	875616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008021	AATGT	2	10	876276	876285	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008021	AATAA	2	10	897629	897638	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008021	CAAAA	2	10	948077	948086	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008021	TAAGA	2	10	954105	954114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008021	CTTGT	2	10	961257	961266	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_008021	AGTTG	2	10	966795	966804	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008021	CATAA	2	10	969540	969549	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_008021	AATTG	2	10	975904	975913	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008021	CCATT	2	10	980586	980595	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_008021	TTAAA	2	10	985430	985439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008021	TCATA	2	10	989625	989634	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_008021	CTTTG	2	10	1005372	1005381	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_008021	ATTCT	2	10	1022997	1023006	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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158	NC_008021	TATAA	2	10	1077928	1077937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_008021	AATTA	2	10	1339385	1339394	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_008021	TTATT	2	10	1339474	1339483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_008021	TGACT	2	10	1350663	1350672	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
195	NC_008021	CTTTC	2	10	1350757	1350766	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
196	NC_008021	AGATA	2	10	1354405	1354414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
197	NC_008021	TCTAT	2	10	1356025	1356034	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_008021	TCTAT	2	10	1359026	1359035	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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273	NC_008021	TAAAC	2	10	1832693	1832702	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
274	NC_008021	AAAAG	2	10	1834240	1834249	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
275	NC_008021	CTTTT	2	10	1834271	1834280	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.