MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 253

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008014	AT	3	6	83	88	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008014	TA	4	8	92	99	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008014	AT	3	6	402	407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008014	AT	3	6	422	427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008014	TA	3	6	1619	1624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008014	AT	3	6	1983	1988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008014	TA	8	16	2528	2543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008014	TA	3	6	2611	2616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008014	TA	3	6	3623	3628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008014	AT	3	6	3693	3698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008014	AG	3	6	6654	6659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008014	TA	3	6	16352	16357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008014	TA	3	6	22925	22930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008014	TA	3	6	26424	26429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008014	CT	3	6	26492	26497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008014	TA	3	6	26551	26556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008014	AT	3	6	26665	26670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008014	AG	3	6	29943	29948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008014	TC	3	6	31125	31130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008014	GA	3	6	32012	32017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008014	TA	3	6	32034	32039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008014	TA	3	6	32084	32089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008014	TA	3	6	32150	32155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008014	TA	3	6	32161	32166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008014	TA	3	6	32184	32189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008014	TA	3	6	32205	32210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008014	GT	3	6	34176	34181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008014	TA	3	6	35867	35872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008014	TA	3	6	36063	36068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008014	TA	4	8	36157	36164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008014	AT	3	6	37536	37541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008014	TA	3	6	41260	41265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008014	AC	3	6	41321	41326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008014	TA	3	6	41742	41747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008014	TA	3	6	41798	41803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008014	TC	3	6	42839	42844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008014	TA	3	6	44276	44281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008014	AT	3	6	46180	46185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008014	TA	3	6	46648	46653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008014	AC	3	6	51724	51729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008014	AT	3	6	51815	51820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008014	TA	3	6	55686	55691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008014	TA	3	6	55796	55801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008014	TA	3	6	58047	58052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008014	GT	3	6	58581	58586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008014	AT	3	6	58672	58677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008014	TA	3	6	58703	58708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008014	CT	3	6	59398	59403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008014	AC	3	6	60001	60006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008014	AT	3	6	65140	65145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008014	TA	3	6	65194	65199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008014	AT	3	6	67219	67224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008014	AT	4	8	67239	67246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008014	TA	3	6	67252	67257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008014	TA	3	6	67264	67269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008014	TA	4	8	67308	67315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008014	TA	3	6	67437	67442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008014	AT	6	12	69480	69491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008014	AT	6	12	69620	69631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008014	AT	6	12	69642	69653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008014	GT	3	6	69679	69684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008014	AT	3	6	69687	69692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008014	TA	3	6	69799	69804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008014	TA	3	6	70300	70305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008014	AT	3	6	72865	72870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008014	TA	3	6	72872	72877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008014	TA	3	6	72951	72956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008014	AT	3	6	73020	73025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008014	TA	3	6	73048	73053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008014	TA	3	6	73244	73249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008014	TA	3	6	73309	73314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008014	TA	3	6	76091	76096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008014	AT	3	6	76147	76152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008014	TA	3	6	76156	76161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008014	TA	3	6	77466	77471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008014	AT	3	6	80920	80925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008014	TA	3	6	80950	80955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008014	TA	3	6	80969	80974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008014	AT	3	6	81000	81005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008014	TA	3	6	81202	81207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008014	GT	17	34	81500	81533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008014	TA	3	6	81634	81639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008014	GA	4	8	83781	83788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008014	TA	3	6	86416	86421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008014	AT	3	6	86467	86472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008014	AT	3	6	86495	86500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008014	TA	3	6	86532	86537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008014	AT	3	6	88655	88660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008014	TA	3	6	88922	88927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008014	TA	3	6	88979	88984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008014	TA	3	6	88990	88995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008014	AT	3	6	89056	89061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008014	TG	3	6	91313	91318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008014	AT	3	6	91461	91466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008014	AT	3	6	91536	91541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008014	AT	3	6	93670	93675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008014	TA	3	6	93761	93766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008014	AT	3	6	93881	93886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008014	TA	6	12	98012	98023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008014	TA	3	6	98047	98052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008014	TA	3	6	98101	98106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008014	TA	3	6	98264	98269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008014	TA	3	6	98314	98319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008014	TA	3	6	98360	98365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008014	AT	3	6	98408	98413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008014	TA	4	8	98445	98452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008014	TC	3	6	98667	98672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008014	AT	3	6	98770	98775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008014	TA	3	6	99190	99195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008014	AT	3	6	99298	99303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008014	AT	3	6	99394	99399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008014	AT	3	6	99404	99409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008014	AT	3	6	99421	99426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008014	TA	3	6	101644	101649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008014	TA	3	6	101702	101707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008014	TA	4	8	101739	101746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008014	TA	4	8	101756	101763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008014	TA	7	14	101769	101782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008014	AT	3	6	101792	101797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008014	TA	7	14	101806	101819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008014	TA	4	8	101853	101860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008014	AT	4	8	101933	101940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008014	AT	3	6	101953	101958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008014	AT	3	6	105403	105408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008014	AT	3	6	105638	105643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008014	AT	3	6	107514	107519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008014	AT	3	6	107574	107579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008014	AT	3	6	107582	107587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008014	TA	3	6	107613	107618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008014	TG	3	6	107630	107635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008014	AG	3	6	107654	107659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008014	TA	3	6	107700	107705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008014	TA	3	6	107735	107740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008014	TA	3	6	107845	107850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008014	TA	3	6	107896	107901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008014	AT	3	6	107931	107936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008014	AT	3	6	107939	107944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008014	TA	3	6	107989	107994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008014	TA	3	6	109918	109923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008014	TA	7	14	109966	109979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008014	AT	3	6	109986	109991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008014	TA	3	6	110001	110006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008014	TA	3	6	110053	110058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008014	AT	3	6	110145	110150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008014	TA	3	6	110164	110169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008014	TA	3	6	110183	110188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008014	TA	3	6	110191	110196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008014	AT	3	6	110370	110375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008014	TA	3	6	110382	110387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008014	AT	4	8	110406	110413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008014	AT	3	6	110422	110427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008014	AT	6	12	110430	110441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008014	TA	3	6	110507	110512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008014	TG	3	6	110545	110550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008014	AT	3	6	110584	110589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008014	GT	4	8	110625	110632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008014	TG	19	38	111252	111289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_008014	TA	5	10	111734	111743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.